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We have collected EAR motif-containing proteins in Arabidopsis thaliana and predicted the EAR motif-containing proteins of 70 species, including algae, moss, ferms, gymnospermae and angiosperms.Camellia sinensis and Glycyrrhiza uralensis are the species we have recently added.

Aquilegia coerulea v3.1
Arabidopsis halleri v1.1
Amaranthus hypochondriacus v1.0
Arabidopsis lyrata v1.0
Arabidopsis thaliana TAIR10
Amborella trichopoda v1.0
Brachypodium distachyon v3.1
Brassica rapa FPsc v1.3
Brachypodium stacei v1.1
Boechera stricta v1.2
Citrus clementina v1.0
Capsella grandiflora v1.1
Carica papaya ASGPBv0.4
Chenopodium quinoa v1.0
Chlamydomonas reinhardtii v5.5
Capsella rubella v1.0
Cucumis sativus v1.0
Citrus sinensis v1.1
Coccomyxa subellipsoidea C-169 v2.0
Camellia sinensis
Daucus carota v2.0
Dunaliella salina v1.0
Eucalyptus grandis v2.0
Eutrema salsugineum v1.0
Fragaria vesca v1.1
Glycine max Wm82.a2.v1 (Soybean)
Gossypium raimondii v2.1 (Cotton)
Gossypium arboreum
Gossypium hirsutum
Glycyrrhiza uralensis
Ginkgo biloba
Gnetum montanum Markgr
Kalanchoe marnieriana v1.1
Kalanchoe laxiflora v1.1 (Milk widow)
Linum usitatissimum v1.0
Musa acuminata v1
Malus domestica v1.0
Manihot esculenta v6.1
Mimulus guttatus v2.0
Marchantia polymorpha v3.1
Micromonas pusilla CCMP1545 v3.0
Micromonas sp. RCC299 v3.0
Medicago truncatula Mt4.0v1 (Barrel medic)
Nicotiana benthamiana
Nicotiana tabacum Basma Xanthi
Nicotiana tabacum K326
Nicotiana tabacum TN90
Ostreococcus lucimarinus
Oryza sativa v7_JGI (Rice)
Panicum hallii v2.0
Physcomitrella patens v3.3
Prunus persica v2.1
Populus trichocarpa v3.0
Phaseolus vulgaris v1.0
Pinus taeda
Pinus abies
Panicum virgatum v1.1
Ricinus communis v0.1
Sorghum bicolor v3.1
Sphagnum fallax v0.5
Solanum lycopersicum iTAG2.3
Selaginella moellendorffii v1.0
Spirodela polyrhiza v2
Salix purpurea v1.0
Solanum tuberosum v3.4
Setaria viridis v1.1
Triticum aestivum v2.2
Trifolium pratense v2
Trifolium pratense
Theobroma cacao v1.1
Volvox carteri v2.1
Vitis vinifera Genoscope.12X
Zostera marina v2.2
Zea mays Ensembl-18


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According to the rules of iTAK, we carried out a gene family division of all EAR motif-containing proteins of each plant. Most of the EAR motif-containing proteins in the plantEAR were transcription factors, and some were non-transcription factors with transcriptional regulation, with a small fraction of neither transcriptional nor transcriptional regulators.

C2H2  HB  AUX/IAA  ERF  G2-like 
MYB  MYB-related  bHLH  TUB  AP2 
MIKC  B3  bZIP  TRAF  NF-YC 
SBP  LOB  BES1  RWP-RK  TCP 
HSF  WRKY  NAC  GRAS  IWS1 
PHD  Trihelix  Jumonji  Tify  BBR-BPC 
M-type  Orphans  DBB  ARR-B  DDT 
ARF  ARID  C2C2-CO-like  EIL  C2C2-Dof 
NF-YB  C2C2-GATA  C3H  NOZZLE  zf-HD 
Pseudo ARR-B  C2C2-YABBY  SET  FAR1  GRF 
mTERF  RAV  GNAT  OFP  E2F-DP 
Coactivator p15  SNF2  Whirly  MADS-MIKC  GARP-G2-like 
HB-HD-ZIP  LBD  HB-BELL  HB-WOX  AP2/ERF-ERF 
AP2/ERF-AP2  B3-ARF  GARP-ARR-B  MADS-M-type  HB-KNOX 
Alfin-like 

Functional modules

We obtained the co-expression network of Arabidopsis thaliana from ATTED-II and identified the relevant functional modules and obtained the functional modules of Gossypium arboreum and Gossypium hirsutum from the ccENT. The following shows the functional modules containing the EAR motif-containing protein.

Arabidopsis thaliana functional modules with EAR motif-containing protein.

CFinderM000044  CFinderM000061  CFinderM000068  CFinderM000091  CFinderM000100 
CFinderM000112  CFinderM000142  CFinderM000166  CFinderM000178  CFinderM000194 
CFinderM000228  CFinderM000234  CFinderM000236  CFinderM000258  CFinderM000264 
CFinderM000375  CFinderM000387  CFinderM000402  CFinderM000420  CFinderM000427 
CFinderM000434  CFinderM000465  CFinderM000473  CFinderM000492  CFinderM000498 
CFinderM000524  CFinderM000558 

Gossypium arboreum functional module with EAR motif-containing protein.

CFinderM000015  CFinderM000134  CFinderM000218  CFinderM000254  CFinderM000256 
CFinderM000262  CFinderM000278  CFinderM000301  CFinderM000303  CFinderM000451 
CFinderM000452  CFinderM000476  CFinderM000491  CFinderM000495  CFinderM000512 
CFinderM000532  CFinderM000571  CFinderM000591  CFinderM000599  CFinderM000676 
CFinderM000695  CFinderM000726  CFinderM000737  CFinderM000745  CFinderM000746 
CFinderM000774  CFinderM000776  CFinderM000789  CFinderM000799  CFinderM000838 
CFinderM000844  CFinderM000852  CFinderM000867  CFinderM000873  CFinderM000878 
CFinderM000882  CFinderM000883  CFinderM000887  CFinderM000888  CFinderM000897 
CFinderM000901  CFinderM000903  CFinderM000904  CFinderM000911  CFinderM000913 
CFinderM000929  CFinderM000942  CFinderM000950  CFinderM000970  CFinderM000979 
CFinderM001008  CFinderM001009  CFinderM001032  CFinderM001091  CFinderM001112 
CFinderM001126  CFinderM001135  CFinderM001200  CFinderM001229  CFinderM001241 
CFinderM001281  CFinderM001287  CFinderM001293  CFinderM001302  CFinderM001327 
CFinderM001338  CFinderM001363  CFinderM001373  CFinderM001382  CFinderM001416 
CFinderM001421  CFinderM001461  CFinderM001470  CFinderM001489  CFinderM001540 
CFinderM001547  CFinderM001555  CFinderM001605  CFinderM001642  CFinderM001671 
CFinderM001677  CFinderM001680  CFinderM001714  CFinderM001718  CFinderM001816 
CFinderM001817  CFinderM001918  CFinderM001931  CFinderM001934  CFinderM001975 
CFinderM002002  CFinderM002023  CFinderM002036  CFinderM002037 

Gossypium hirsutum functional module with EAR motif-containing protein.

CFinderADM000030  CFinderADM000043  CFinderADM000048  CFinderADM000095  CFinderADM000104 
CFinderADM000107  CFinderADM000123  CFinderADM000129  CFinderADM000135  CFinderADM000160 
CFinderADM000161  CFinderADM000171  CFinderADM000183  CFinderADM000200  CFinderADM000201 
CFinderADM000215  CFinderADM000232  CFinderADM000238  CFinderADM000290  CFinderADM000309 
CFinderADM000352  CFinderADM000357  CFinderADM000388  CFinderADM000401  CFinderADM000426 
CFinderADM000441  CFinderADM000481  CFinderADM000496  CFinderADM000505  CFinderADM000507 
CFinderADM000509  CFinderADM000514  CFinderADM000517  CFinderADM000523  CFinderADM000549 
CFinderADM000561  CFinderADM000606  CFinderADM000623  CFinderADM000659  CFinderADM000683 
CFinderADM000685  CFinderADM000687  CFinderADM000697  CFinderADM000720  CFinderADM000734 
CFinderADM000736  CFinderADM000739  CFinderADM000745  CFinderADM000760  CFinderADM000776 
CFinderADM000779  CFinderADM000790  CFinderADM000798  CFinderADM000847  CFinderADM000849 
CFinderADM000862  CFinderADM000882  CFinderADM000927  CFinderADM001003  CFinderADM001010 
CFinderADM001072  CFinderADM001088  CFinderADM001093  CFinderADM001113  CFinderADM001148 
CFinderADM001167  CFinderADM001194  CFinderADM001239  CFinderADM001246  CFinderADM001285 
CFinderADM001288  CFinderADM001352  CFinderADM001360  CFinderADM001370  CFinderADM001395 
CFinderADM001412  CFinderADM001420  CFinderADM001427  CFinderADM001440  CFinderADM001448 
CFinderADM001454  CFinderADM001459  CFinderADM001539  CFinderADM001540  CFinderADM001554 
CFinderADM001608  CFinderADM001629  CFinderADM001639  CFinderADM001648  CFinderADM001654 
CFinderADM001655  CFinderADM001701  CFinderADM001750  CFinderADM001763  CFinderADM001766 
CFinderADM001773  CFinderADM001794  CFinderADM001827  CFinderADM001842  CFinderADM001929 
CFinderADM001970  CFinderADM001972  CFinderADM001975  CFinderADM002017  CFinderADM002035 
CFinderADM002047  CFinderADM002048  CFinderADM002065  CFinderADM002070  CFinderADM002088 
CFinderADM002138  CFinderADM002157  CFinderADM002167  CFinderADM002179  CFinderADM002180 
CFinderADM002215  CFinderADM002256  CFinderADM002282  CFinderADM002309  CFinderADM002330 
CFinderADM002333  CFinderADM002360  CFinderADM002382  CFinderADM002384  CFinderADM002393 
CFinderADM002473  CFinderADM002480  CFinderADM002482  CFinderADM002487  CFinderADM002517 
CFinderADM002530  CFinderADM002547  CFinderADM002569  CFinderADM002590  CFinderADM002635 
CFinderADM002703  CFinderADM002725  CFinderADM002739  CFinderADM002761 

All copyright are reserved by Prof. Zhen Su's lab at China Agricultural University
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