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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0009052 GO:0009052 pentose-phosphate_shunt,_non-oxidative_branch GOslim:biological_process GO:0009052 pentose-phosphate_shunt,_non-oxidative_branch GOslim:biological_process Cotton_A_36070,Cotton_A_34809,Cotton_A_28099,Cotton_A_14976,Cotton_A_16867,Cotton_A_20195 TRANSPORT GO_BP Gossypium arboreum GO:0006810 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006139 GO:0006139 nucleobase-containing_compound_metabolic_process GOslim:biological_process GO:0006139 nucleobase-containing_compound_metabolic_process GOslim:biological_process Cotton_A_01841,Cotton_A_08103,Cotton_A_30954,Cotton_A_28287,Cotton_A_31547,Cotton_A_08730,Cotton_A_12204,Cotton_A_31047,Cotton_A_08228,Cotton_A_09271,Cotton_A_09273,Cotton_A_31133,Cotton_A_04770,Cotton_A_06843,Cotton_A_06876,Cotton_A_11731,Cotton_A_14171,Cotton_A_28771,Cotton_A_34345,Cotton_A_36626,Cotton_A_04605,Cotton_A_16946,Cotton_A_36259,Cotton_A_13220,Cotton_A_22642,Cotton_A_25976,Cotton_A_13896,Cotton_A_18525,Cotton_A_24350,Cotton_A_29574,Cotton_A_15567,Cotton_A_29436,Cotton_A_08057,Cotton_A_23827,Cotton_A_24906,Cotton_A_33315,Cotton_A_09688,Cotton_A_13589,Cotton_A_01025,Cotton_A_20270,Cotton_A_19918,Cotton_A_38820,Cotton_A_24102,Cotton_A_32561,Cotton_A_11594,Cotton_A_19921,Cotton_A_04019,Cotton_A_36479,Cotton_A_40716,Cotton_A_06088,Cotton_A_13112,Cotton_A_34566 IRON-SULFUR_CLUSTER_ASSEMBLY GO_BP Gossypium arboreum GO:0016226 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0019627 GO:0019627 urea_metabolic_process GOslim:biological_process GO:0019627 urea_metabolic_process GOslim:biological_process Cotton_A_14137 PSEUDOURIDINE_SYNTHESIS GO_BP Gossypium arboreum GO:0001522 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0001522 GO:0001522 pseudouridine_synthesis GOslim:biological_process GO:0001522 pseudouridine_synthesis GOslim:biological_process Cotton_A_26187,Cotton_A_30325,Cotton_A_27039,Cotton_A_08776,Cotton_A_08817,Cotton_A_16235,Cotton_A_32527,Cotton_A_10986,Cotton_A_14979,Cotton_A_00172,Cotton_A_04166,Cotton_A_25706,Cotton_A_16817,Cotton_A_04700,Cotton_A_15090,Cotton_A_33662,Cotton_A_16853,Cotton_A_18485,Cotton_A_02926,Cotton_A_32923,Cotton_A_35524,Cotton_A_01887,Cotton_A_08421 MITOTIC_CHROMOSOME_CONDENSATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0007076 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0007076 GO:0007076 mitotic_chromosome_condensation GOslim:biological_process GO:0007076 mitotic_chromosome_condensation GOslim:biological_process Cotton_A_18704,Cotton_A_24009 CELL_PROLIFERATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0008283 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0008283 GO:0008283 cell_proliferation GOslim:biological_process GO:0008283 cell_proliferation GOslim:biological_process Cotton_A_29961,Cotton_A_25246,Cotton_A_00520,Cotton_A_00521,Cotton_A_20866,Cotton_A_09559,Cotton_A_17172,Cotton_A_23470,Cotton_A_35209,Cotton_A_09786,Cotton_A_06222,Cotton_A_24609,Cotton_A_24610,Cotton_A_32586,Cotton_A_11545,Cotton_A_31048 PROLINE_CATABOLIC_PROCESS GO_BP Gossypium arboreum GO:0006562 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006562 GO:0006562 proline_catabolic_process GOslim:biological_process GO:0006562 proline_catabolic_process GOslim:biological_process Cotton_A_38074,Cotton_A_17875,Cotton_A_12638 OLIGOSACCHARIDE_BIOSYNTHETIC_PROCESS GO_BP Gossypium arboreum GO:0009312 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0009312 GO:0009312 oligosaccharide_biosynthetic_process GOslim:biological_process GO:0009312 oligosaccharide_biosynthetic_process GOslim:biological_process Cotton_A_32056,Cotton_A_03703 CELLULAR_RESPONSE_TO_DNA_DAMAGE_STIMULUS GO_BP Gossypium arboreum GO:0006974 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0009073 GO:0009073 aromatic_amino_acid_family_biosynthetic_process GOslim:biological_process GO:0009073 aromatic_amino_acid_family_biosynthetic_process GOslim:biological_process Cotton_A_16592,Cotton_A_19430,Cotton_A_22178,Cotton_A_26508,Cotton_A_26832,Cotton_A_39597,Cotton_A_13183,Cotton_A_23409,Cotton_A_11383,Cotton_A_01169,Cotton_A_15484,Cotton_A_15480,Cotton_A_32588,Cotton_A_26652 PROTEIN_DEPHOSPHORYLATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0006470 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006801 GO:0006801 superoxide_metabolic_process GOslim:biological_process GO:0006801 superoxide_metabolic_process GOslim:biological_process Cotton_A_21978,Cotton_A_03623,Cotton_A_30467,Cotton_A_24238,Cotton_A_26478,Cotton_A_04050,Cotton_A_32487,Cotton_A_09949,Cotton_A_21263,Cotton_A_36793 CELL_SURFACE_RECEPTOR_SIGNALING_PATHWAY GO_BP Gossypium arboreum GO:0007166 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0007166 GO:0007166 cell_surface_receptor_signaling_pathway GOslim:biological_process GO:0007166 cell_surface_receptor_signaling_pathway GOslim:biological_process Cotton_A_08777 PHOSPHATIDYLINOSITOL_PHOSPHORYLATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0046854 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0046854 GO:0046854 phosphatidylinositol_phosphorylation GOslim:biological_process GO:0046854 phosphatidylinositol_phosphorylation GOslim:biological_process Cotton_A_27073,Cotton_A_29110,Cotton_A_34778,Cotton_A_00719,Cotton_A_08491,Cotton_A_06331,Cotton_A_04637,Cotton_A_04730,Cotton_A_18732,Cotton_A_26144,Cotton_A_03860,Cotton_A_03864,Cotton_A_24199,Cotton_A_35851 ACTIN_CYTOSKELETON_ORGANIZATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0030036 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0015931 GO:0015931 nucleobase-containing_compound_transport GOslim:biological_process GO:0015931 nucleobase-containing_compound_transport GOslim:biological_process Cotton_A_21649,Cotton_A_21648 TRNA_5'-LEADER_REMOVAL GO_BP Gossypium arboreum GO:0001682 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0001682 GO:0001682 tRNA_5'-leader_removal GOslim:biological_process GO:0001682 tRNA_5'-leader_removal GOslim:biological_process Cotton_A_23213 TRYPTOPHANYL-TRNA_AMINOACYLATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0006436 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0034508 GO:0034508 centromere_complex_assembly GOslim:biological_process GO:0034508 centromere_complex_assembly GOslim:biological_process Cotton_A_01120 PLANT-TYPE_CELL_WALL_ORGANIZATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0009664 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006529 GO:0006529 asparagine_biosynthetic_process GOslim:biological_process GO:0006529 asparagine_biosynthetic_process GOslim:biological_process Cotton_A_21135,Cotton_A_20006,Cotton_A_09527,Cotton_A_11649,Cotton_A_32485,Cotton_A_25969,Cotton_A_12954,Cotton_A_36795,Cotton_A_06199,Cotton_A_35249 TYROSYL-TRNA_AMINOACYLATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0006437 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006437 GO:0006437 tyrosyl-tRNA_aminoacylation GOslim:biological_process GO:0006437 tyrosyl-tRNA_aminoacylation GOslim:biological_process Cotton_A_25335 REGULATION_OF_CATALYTIC_ACTIVITY GO_BP Gossypium arboreum GO:0050790 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0017004 GO:0017004 cytochrome_complex_assembly GOslim:biological_process GO:0017004 cytochrome_complex_assembly GOslim:biological_process Cotton_A_00306,Cotton_A_17943,Cotton_A_41104,Cotton_A_33863,Cotton_A_17514 REGULATION_OF_DNA_REPLICATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0006275 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006275 GO:0006275 regulation_of_DNA_replication GOslim:biological_process GO:0006275 regulation_of_DNA_replication GOslim:biological_process Cotton_A_20024,Cotton_A_25222,Cotton_A_29030 PROTEIN_HOMOOLIGOMERIZATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0051260 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0032065 GO:0032065 cortical_protein_anchoring GOslim:biological_process GO:0032065 cortical_protein_anchoring GOslim:biological_process Cotton_A_01772,Cotton_A_33339,Cotton_A_38353 ENDOCYTOSIS GO_BP Gossypium arboreum GO:0006897 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006897 GO:0006897 endocytosis GOslim:biological_process GO:0006897 endocytosis GOslim:biological_process Cotton_A_28331,Cotton_A_29201,Cotton_A_09472 TRNA_SPLICING,_VIA_ENDONUCLEOLYTIC_CLEAVAGE_AND_LIGATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0006388 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006259 GO:0006259 DNA_metabolic_process GOslim:biological_process GO:0006259 DNA_metabolic_process GOslim:biological_process Cotton_A_31120,Cotton_A_02866,Cotton_A_01011,Cotton_A_25070,Cotton_A_34986,Cotton_A_24400,Cotton_A_15260,Cotton_A_32351,Cotton_A_16487,Cotton_A_06534,Cotton_A_37741,Cotton_A_24572,Cotton_A_30403,Cotton_A_08360,Cotton_A_03141,Cotton_A_14064,Cotton_A_14810,Cotton_A_36894,Cotton_A_21686,Cotton_A_15061,Cotton_A_36226,Cotton_A_12118,Cotton_A_20258,Cotton_A_23364,Cotton_A_38145,Cotton_A_07001,Cotton_A_16911,Cotton_A_24678 HISTONE_MODIFICATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0016570 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0016570 GO:0016570 histone_modification GOslim:biological_process GO:0016570 histone_modification GOslim:biological_process Cotton_A_00695,Cotton_A_01578,Cotton_A_18673,Cotton_A_38270,Cotton_A_25678,Cotton_A_05750,Cotton_A_03880,Cotton_A_38501 GLYCINE_BIOSYNTHETIC_PROCESS GO_BP Gossypium arboreum GO:0006545 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006545 GO:0006545 glycine_biosynthetic_process GOslim:biological_process GO:0006545 glycine_biosynthetic_process GOslim:biological_process Cotton_A_07856,Cotton_A_00723,Cotton_A_00224 RESPONSE_TO_LIGHT_STIMULUS GO_BP Gossypium arboreum GO:0009416 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0009098 GO:0009098 leucine_biosynthetic_process GOslim:biological_process GO:0009098 leucine_biosynthetic_process GOslim:biological_process Cotton_A_37876,Cotton_A_23078 CTP_BIOSYNTHETIC_PROCESS GO_BP Gossypium arboreum GO:0006241 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006241 GO:0006241 CTP_biosynthetic_process GOslim:biological_process GO:0006241 CTP_biosynthetic_process GOslim:biological_process Cotton_A_08157,Cotton_A_09676,Cotton_A_28074,Cotton_A_21201,Cotton_A_13246,Cotton_A_27705 C-TERMINAL_PROTEIN_METHYLATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0006481 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006357 GO:0006357 regulation_of_transcription_from_RNA_polymerase_II_promoter GOslim:biological_process GO:0006357 regulation_of_transcription_from_RNA_polymerase_II_promoter GOslim:biological_process Cotton_A_11099,Cotton_A_30310,Cotton_A_00331,Cotton_A_08807,Cotton_A_28025,Cotton_A_06601,Cotton_A_21455,Cotton_A_24760,Cotton_A_03162,Cotton_A_05806,Cotton_A_16877,Cotton_A_17495,Cotton_A_13208,Cotton_A_20945,Cotton_A_37446 FATTY_ACID_METABOLIC_PROCESS GO_BP Gossypium arboreum GO:0006631 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0008610 GO:0008610 lipid_biosynthetic_process GOslim:biological_process GO:0008610 lipid_biosynthetic_process GOslim:biological_process Cotton_A_07553,Cotton_A_10642,Cotton_A_11120,Cotton_A_16607,Cotton_A_31611,Cotton_A_40578,Cotton_A_13763,Cotton_A_20428,Cotton_A_26191,Cotton_A_36064,Cotton_A_00737,Cotton_A_19287,Cotton_A_22862,Cotton_A_22863,Cotton_A_14030,Cotton_A_24659,Cotton_A_27018,Cotton_A_15911,Cotton_A_00007,Cotton_A_00219,Cotton_A_00221,Cotton_A_15160,Cotton_A_17832,Cotton_A_31248,Cotton_A_03189,Cotton_A_09129,Cotton_A_07004,Cotton_A_16465,Cotton_A_35572,Cotton_A_38995,Cotton_A_14494,Cotton_A_38264,Cotton_A_38239,Cotton_A_38240,Cotton_A_26434,Cotton_A_32569,Cotton_A_25897 PENTOSE-PHOSPHATE_SHUNT GO_BP Gossypium arboreum GO:0006098 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0043086 GO:0043086 negative_regulation_of_catalytic_activity GOslim:biological_process GO:0043086 negative_regulation_of_catalytic_activity GOslim:biological_process Cotton_A_13434,Cotton_A_26289,Cotton_A_40530,Cotton_A_14888,Cotton_A_14893,Cotton_A_16445,Cotton_A_22973,Cotton_A_22974,Cotton_A_29458,Cotton_A_19912,Cotton_A_28587,Cotton_A_28742,Cotton_A_37979,Cotton_A_03375,Cotton_A_03376,Cotton_A_03377,Cotton_A_18231,Cotton_A_20331,Cotton_A_03725,Cotton_A_10921,Cotton_A_10948,Cotton_A_18889,Cotton_A_04139,Cotton_A_26114,Cotton_A_26115,Cotton_A_26123,Cotton_A_26124,Cotton_A_03171,Cotton_A_19755,Cotton_A_20543,Cotton_A_24355,Cotton_A_27395,Cotton_A_36345,Cotton_A_02647,Cotton_A_08666,Cotton_A_08667,Cotton_A_13488,Cotton_A_13489,Cotton_A_13490,Cotton_A_13491,Cotton_A_13495,Cotton_A_13497,Cotton_A_13498,Cotton_A_13500,Cotton_A_15053,Cotton_A_16655,Cotton_A_18954,Cotton_A_23202,Cotton_A_35816,Cotton_A_09950,Cotton_A_09951,Cotton_A_09963,Cotton_A_11860,Cotton_A_22944,Cotton_A_26615,Cotton_A_03979,Cotton_A_07447,Cotton_A_08556,Cotton_A_10230,Cotton_A_12899,Cotton_A_40069,Cotton_A_10766,Cotton_A_13191,Cotton_A_13261,Cotton_A_40434,Cotton_A_40909 MICROTUBULE_CYTOSKELETON_ORGANIZATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0000226 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0000226 GO:0000226 microtubule_cytoskeleton_organization GOslim:biological_process GO:0000226 microtubule_cytoskeleton_organization GOslim:biological_process Cotton_A_37886,Cotton_A_33027,Cotton_A_03554,Cotton_A_13975,Cotton_A_39570,Cotton_A_23294,Cotton_A_06595,Cotton_A_29665,Cotton_A_15537,Cotton_A_21598,Cotton_A_26806,Cotton_A_11065,Cotton_A_12124,Cotton_A_24382,Cotton_A_24706,Cotton_A_36492 FRUCTOSE_METABOLIC_PROCESS GO_BP Gossypium arboreum GO:0006000 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006000 GO:0006000 fructose_metabolic_process GOslim:biological_process GO:0006000 fructose_metabolic_process GOslim:biological_process Cotton_A_39359,Cotton_A_04210,Cotton_A_33849,Cotton_A_21267 RETROGRADE_TRANSPORT,_ENDOSOME_TO_GOLGI GO_BP Gossypium arboreum GO:0042147 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0042147 GO:0042147 retrograde_transport,_endosome_to_Golgi GOslim:biological_process GO:0042147 retrograde_transport,_endosome_to_Golgi GOslim:biological_process Cotton_A_16440,Cotton_A_17892,Cotton_A_10237,Cotton_A_02004,Cotton_A_40943 GOLGI_ORGANIZATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0007030 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0007030 GO:0007030 Golgi_organization GOslim:biological_process GO:0007030 Golgi_organization GOslim:biological_process Cotton_A_17887 PROTEIN_CATABOLIC_PROCESS GO_BP Gossypium arboreum GO:0030163 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0030163 GO:0030163 protein_catabolic_process GOslim:biological_process GO:0030163 protein_catabolic_process GOslim:biological_process Cotton_A_23247,Cotton_A_38861,Cotton_A_23066 DNA_METHYLATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0006306 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006306 GO:0006306 DNA_methylation GOslim:biological_process GO:0006306 DNA_methylation GOslim:biological_process Cotton_A_27044,Cotton_A_03613,Cotton_A_08447,Cotton_A_27234,Cotton_A_19737,Cotton_A_36034,Cotton_A_20175,Cotton_A_29333,Cotton_A_29334 NUCLEOCYTOPLASMIC_TRANSPORT GO_BP Gossypium arboreum GO:0006913 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006913 GO:0006913 nucleocytoplasmic_transport GOslim:biological_process GO:0006913 nucleocytoplasmic_transport GOslim:biological_process Cotton_A_10404,Cotton_A_26380,Cotton_A_21411,Cotton_A_27769,Cotton_A_20743,Cotton_A_07606,Cotton_A_17453,Cotton_A_01433,Cotton_A_25114,Cotton_A_06832,Cotton_A_27723,Cotton_A_19688,Cotton_A_19658,Cotton_A_28879,Cotton_A_31726,Cotton_A_37909,Cotton_A_17452,Cotton_A_00411,Cotton_A_00748,Cotton_A_00931,Cotton_A_03936,Cotton_A_04620,Cotton_A_05005,Cotton_A_05023,Cotton_A_05184,Cotton_A_05274,Cotton_A_05517,Cotton_A_06994,Cotton_A_07672,Cotton_A_07787,Cotton_A_08493,Cotton_A_09143,Cotton_A_10361,Cotton_A_10540,Cotton_A_10815,Cotton_A_10864,Cotton_A_10873,Cotton_A_11151,Cotton_A_11171,Cotton_A_11569,Cotton_A_12018,Cotton_A_12398,Cotton_A_12898,Cotton_A_13004,Cotton_A_13626,Cotton_A_15207,Cotton_A_16062,Cotton_A_16189,Cotton_A_18880,Cotton_A_19388,Cotton_A_19593,Cotton_A_19687,Cotton_A_20103,Cotton_A_20462,Cotton_A_21198,Cotton_A_23094,Cotton_A_23166,Cotton_A_23684,Cotton_A_23863,Cotton_A_23898,Cotton_A_24321,Cotton_A_26094,Cotton_A_26301,Cotton_A_27002,Cotton_A_27481,Cotton_A_27789,Cotton_A_28058,Cotton_A_28942,Cotton_A_29729,Cotton_A_31298,Cotton_A_31580,Cotton_A_32134,Cotton_A_32295,Cotton_A_32479,Cotton_A_32986,Cotton_A_33223,Cotton_A_34015,Cotton_A_34035,Cotton_A_34140,Cotton_A_34142,Cotton_A_35309,Cotton_A_35313,Cotton_A_35644,Cotton_A_36277,Cotton_A_36771,Cotton_A_37980,Cotton_A_38562,Cotton_A_39542,Cotton_A_39838,Cotton_A_41250 PROTON-TRANSPORTING_ATP_SYNTHASE_COMPLEX_ASSEMBLY GO_BP Gossypium arboreum GO:0043461 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0043461 GO:0043461 proton-transporting_ATP_synthase_complex_assembly GOslim:biological_process GO:0043461 proton-transporting_ATP_synthase_complex_assembly GOslim:biological_process Cotton_A_24075 PROTEIN_RETENTION_IN_ER_LUMEN GO_BP Gossypium arboreum GO:0006621 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006621 GO:0006621 protein_retention_in_ER_lumen GOslim:biological_process GO:0006621 protein_retention_in_ER_lumen GOslim:biological_process Cotton_A_38405,Cotton_A_00660,Cotton_A_27091,Cotton_A_15188,Cotton_A_15189,Cotton_A_30419,Cotton_A_32656,Cotton_A_18255,Cotton_A_12392,Cotton_A_17510,Cotton_A_15298 RRNA_MODIFICATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0000154 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0000154 GO:0000154 rRNA_modification GOslim:biological_process GO:0000154 rRNA_modification GOslim:biological_process Cotton_A_01584,Cotton_A_26368,Cotton_A_10940 GLUTAMINE_METABOLIC_PROCESS GO_BP Gossypium arboreum GO:0006541 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006541 GO:0006541 glutamine_metabolic_process GOslim:biological_process GO:0006541 glutamine_metabolic_process GOslim:biological_process Cotton_A_30762,Cotton_A_33818,Cotton_A_11649,Cotton_A_33573,Cotton_A_25553,Cotton_A_10902,Cotton_A_23410,Cotton_A_38367 PYRIMIDINE_NUCLEOTIDE_BIOSYNTHETIC_PROCESS GO_BP Gossypium arboreum GO:0006221 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006221 GO:0006221 pyrimidine_nucleotide_biosynthetic_process GOslim:biological_process GO:0006221 pyrimidine_nucleotide_biosynthetic_process GOslim:biological_process Cotton_A_26451,Cotton_A_12705,Cotton_A_02185,Cotton_A_12579,Cotton_A_30195 METHIONINE_BIOSYNTHETIC_PROCESS GO_BP Gossypium arboreum GO:0009086 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0009086 GO:0009086 methionine_biosynthetic_process GOslim:biological_process GO:0009086 methionine_biosynthetic_process GOslim:biological_process Cotton_A_13335,Cotton_A_13982,Cotton_A_31138,Cotton_A_28767,Cotton_A_34341,Cotton_A_20058 TRNA_WOBBLE_URIDINE_MODIFICATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0002098 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0002098 GO:0002098 tRNA_wobble_uridine_modification GOslim:biological_process GO:0002098 tRNA_wobble_uridine_modification GOslim:biological_process Cotton_A_17869 GLYCEROL-3-PHOSPHATE_CATABOLIC_PROCESS GO_BP Gossypium arboreum GO:0046168 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0046168 GO:0046168 glycerol-3-phosphate_catabolic_process GOslim:biological_process GO:0046168 glycerol-3-phosphate_catabolic_process GOslim:biological_process Cotton_A_01902,Cotton_A_18371,Cotton_A_13782,Cotton_A_06013,Cotton_A_08402 CARBOHYDRATE_PHOSPHORYLATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0046835 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0046835 GO:0046835 carbohydrate_phosphorylation GOslim:biological_process GO:0046835 carbohydrate_phosphorylation GOslim:biological_process Cotton_A_09624,Cotton_A_17791 SRP-DEPENDENT_COTRANSLATIONAL_PROTEIN_TARGETING_TO_MEMBRANE GO_BP Gossypium arboreum GO:0006614 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006614 GO:0006614 SRP-dependent_cotranslational_protein_targeting_to_membrane GOslim:biological_process GO:0006614 SRP-dependent_cotranslational_protein_targeting_to_membrane GOslim:biological_process Cotton_A_25758,Cotton_A_26706,Cotton_A_07252,Cotton_A_18720,Cotton_A_05273,Cotton_A_25537,Cotton_A_32334,Cotton_A_16453,Cotton_A_03325,Cotton_A_07484,Cotton_A_20194,Cotton_A_26560,Cotton_A_20683 REGULATION_OF_PROTEIN_CATABOLIC_PROCESS GO_BP Gossypium arboreum GO:0042176 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0016567 GO:0016567 protein_ubiquitination GOslim:biological_process GO:0016567 protein_ubiquitination GOslim:biological_process Cotton_A_08104,Cotton_A_10646,Cotton_A_11174,Cotton_A_13482,Cotton_A_13483,Cotton_A_21127,Cotton_A_22068,Cotton_A_10551,Cotton_A_14835,Cotton_A_29615,Cotton_A_32598,Cotton_A_35272,Cotton_A_40428,Cotton_A_00399,Cotton_A_10146,Cotton_A_23565,Cotton_A_23568,Cotton_A_26709,Cotton_A_28827,Cotton_A_33089,Cotton_A_33247,Cotton_A_33896,Cotton_A_00590,Cotton_A_00790,Cotton_A_04330,Cotton_A_19322,Cotton_A_22433,Cotton_A_32612,Cotton_A_34614,Cotton_A_39575,Cotton_A_01605,Cotton_A_03596,Cotton_A_15201,Cotton_A_19459,Cotton_A_24318,Cotton_A_25056,Cotton_A_29204,Cotton_A_31336,Cotton_A_32293,Cotton_A_32728,Cotton_A_32730,Cotton_A_33569,Cotton_A_39360,Cotton_A_40125,Cotton_A_05183,Cotton_A_30071,Cotton_A_34788,Cotton_A_34789,Cotton_A_35696,Cotton_A_35698,Cotton_A_40903,Cotton_A_03788,Cotton_A_03789,Cotton_A_14656,Cotton_A_21454,Cotton_A_26575,Cotton_A_35265,Cotton_A_36433,Cotton_A_00059,Cotton_A_04966,Cotton_A_12670,Cotton_A_18549,Cotton_A_35328,Cotton_A_01031,Cotton_A_02284,Cotton_A_15743,Cotton_A_30232,Cotton_A_33829,Cotton_A_34061,Cotton_A_06980,Cotton_A_11085,Cotton_A_16464,Cotton_A_16673,Cotton_A_17889,Cotton_A_30451,Cotton_A_16843,Cotton_A_27189,Cotton_A_03017,Cotton_A_12948,Cotton_A_17031,Cotton_A_24628,Cotton_A_32354,Cotton_A_32924,Cotton_A_34172,Cotton_A_36278,Cotton_A_01294,Cotton_A_01456,Cotton_A_01479,Cotton_A_01480,Cotton_A_06220,Cotton_A_10915,Cotton_A_36908,Cotton_A_36911,Cotton_A_37450,Cotton_A_35355,Cotton_A_34433,Cotton_A_22855 REGULATION_OF_TRANSLATIONAL_FIDELITY GO_BP Gossypium arboreum GO:0006450 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0007010 GO:0007010 cytoskeleton_organization GOslim:biological_process GO:0007010 cytoskeleton_organization GOslim:biological_process Cotton_A_35367,Cotton_A_15323,Cotton_A_40893,Cotton_A_00744,Cotton_A_18279,Cotton_A_25232,Cotton_A_11715,Cotton_A_33433,Cotton_A_19384,Cotton_A_02524,Cotton_A_04629,Cotton_A_26947,Cotton_A_06722,Cotton_A_12934,Cotton_A_20222,Cotton_A_03120,Cotton_A_18096,Cotton_A_05594,Cotton_A_09397,Cotton_A_31553,Cotton_A_09398,Cotton_A_14535,Cotton_A_13026,Cotton_A_18094,Cotton_A_09339 PROTEIN_INSERTION_INTO_MEMBRANE GO_BP Gossypium arboreum GO:0051205 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0009396 GO:0009396 folic_acid-containing_compound_biosynthetic_process GOslim:biological_process GO:0009396 folic_acid-containing_compound_biosynthetic_process GOslim:biological_process Cotton_A_34454,Cotton_A_15319,Cotton_A_13262,Cotton_A_23716,Cotton_A_24111,Cotton_A_05989,Cotton_A_10441,Cotton_A_23850,Cotton_A_06204,Cotton_A_21318,Cotton_A_41056 GLUTAMINYL-TRNA_AMINOACYLATION GO_BP Gossypium arboreum GO:0006425 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0006425 GO:0006425 glutaminyl-tRNA_aminoacylation GOslim:biological_process GO:0006425 glutaminyl-tRNA_aminoacylation GOslim:biological_process Cotton_A_22425 PRIMARY_METABOLIC_PROCESS GO_BP Gossypium arboreum GO:0044238 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0044238 GO:0044238 primary_metabolic_process GOslim:biological_process GO:0044238 primary_metabolic_process GOslim:biological_process Cotton_A_38283 MICROTUBULE-BASED_PROCESS GO_BP Gossypium arboreum GO:0007017 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0007017 GO:0007017 microtubule-based_process GOslim:biological_process GO:0007017 microtubule-based_process GOslim:biological_process Cotton_A_18036,Cotton_A_19777,Cotton_A_31302,Cotton_A_28945,Cotton_A_00389,Cotton_A_33091,Cotton_A_37504,Cotton_A_03581,Cotton_A_19662,Cotton_A_38570,Cotton_A_31200,Cotton_A_38473,Cotton_A_04852,Cotton_A_21689,Cotton_A_28149,Cotton_A_37294,Cotton_A_36756,Cotton_A_03855,Cotton_A_18821,Cotton_A_35078,Cotton_A_25798,Cotton_A_34009,Cotton_A_38717,Cotton_A_12880,Cotton_A_13983,Cotton_A_38860,Cotton_A_19991,Cotton_A_25973,Cotton_A_15044,Cotton_A_09321,Cotton_A_20026,Cotton_A_26014,Cotton_A_13050,Cotton_A_13288,Cotton_A_34155,Cotton_A_14376,Cotton_A_30560,Cotton_A_39225,Cotton_A_18736,Cotton_A_11639,Cotton_A_38233,Cotton_A_11642,Cotton_A_06395,Cotton_A_14308,Cotton_A_30468,Cotton_A_38144,Cotton_A_20863,Cotton_A_27308,Cotton_A_25989,Cotton_A_02475,Cotton_A_27830,Cotton_A_16425,Cotton_A_12909,Cotton_A_29022,Cotton_A_07680,Cotton_A_18250,Cotton_A_11640,Cotton_A_36660 TRANSMEMBRANE_TRANSPORT GO_BP Gossypium arboreum GO:0055085 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0005885 GO:0005885 Arp2/3_protein_complex GOslim:cellular_component GO:0005885 Arp2/3_protein_complex GOslim:cellular_component Cotton_A_27098,Cotton_A_38348,Cotton_A_11478 BOX_H/ACA_RNP_COMPLEX GO_CC Gossypium arboreum GO:0072588 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0072588 GO:0072588 box_H/ACA_RNP_complex GOslim:cellular_component GO:0072588 box_H/ACA_RNP_complex GOslim:cellular_component Cotton_A_25706,Cotton_A_02926 ENDOPLASMIC_RETICULUM_MEMBRANE GO_CC Gossypium arboreum GO:0005789 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0005576 GO:0005576 extracellular_region GOslim:cellular_component GO:0005576 extracellular_region GOslim:cellular_component Cotton_A_29961,Cotton_A_25246,Cotton_A_00520,Cotton_A_00521,Cotton_A_04385,Cotton_A_04386,Cotton_A_04387,Cotton_A_04388,Cotton_A_20866,Cotton_A_25277,Cotton_A_09559,Cotton_A_17172,Cotton_A_26087,Cotton_A_18758,Cotton_A_23470,Cotton_A_35209,Cotton_A_09786,Cotton_A_06222,Cotton_A_24609,Cotton_A_24610,Cotton_A_32586,Cotton_A_28186,Cotton_A_20906,Cotton_A_33130,Cotton_A_13253,Cotton_A_01657,Cotton_A_32270,Cotton_A_36502,Cotton_A_08957,Cotton_A_21776,Cotton_A_16039,Cotton_A_23237,Cotton_A_04053,Cotton_A_16729,Cotton_A_38175,Cotton_A_28454,Cotton_A_36868,Cotton_A_18183,Cotton_A_26771,Cotton_A_12198,Cotton_A_16450,Cotton_A_05555,Cotton_A_05935,Cotton_A_18291,Cotton_A_40984,Cotton_A_18114,Cotton_A_31820,Cotton_A_15770,Cotton_A_22092,Cotton_A_30929,Cotton_A_14082,Cotton_A_18229,Cotton_A_12046,Cotton_A_17340,Cotton_A_00603,Cotton_A_09975,Cotton_A_02067,Cotton_A_36593,Cotton_A_06020,Cotton_A_15740,Cotton_A_34755,Cotton_A_06064,Cotton_A_18574,Cotton_A_00939,Cotton_A_37758,Cotton_A_36858,Cotton_A_29577,Cotton_A_30342,Cotton_A_34754,Cotton_A_04052,Cotton_A_02323,Cotton_A_01126,Cotton_A_06971,Cotton_A_36859,Cotton_A_00374,Cotton_A_04460,Cotton_A_17991,Cotton_A_16731,Cotton_A_16628,Cotton_A_29490,Cotton_A_08864,Cotton_A_18290,Cotton_A_34783,Cotton_A_06302,Cotton_A_02247,Cotton_A_10471,Cotton_A_13399,Cotton_A_09955,Cotton_A_23833,Cotton_A_13148,Cotton_A_11229,Cotton_A_05112,Cotton_A_10837,Cotton_A_41171,Cotton_A_21850,Cotton_A_11057,Cotton_A_35786,Cotton_A_31303,Cotton_A_09480,Cotton_A_05092,Cotton_A_09804,Cotton_A_05091,Cotton_A_20823,Cotton_A_08939,Cotton_A_17203 CELLULAR_COMPONENT GO_CC Gossypium arboreum GO:0005575 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0031461 GO:0031461 cullin-RING_ubiquitin_ligase_complex GOslim:cellular_component GO:0031461 cullin-RING_ubiquitin_ligase_complex GOslim:cellular_component Cotton_A_16571,Cotton_A_25958,Cotton_A_36565,Cotton_A_27450,Cotton_A_37441,Cotton_A_24145,Cotton_A_05288,Cotton_A_13943,Cotton_A_13944,Cotton_A_18193,Cotton_A_08290,Cotton_A_04869,Cotton_A_11767,Cotton_A_17816,Cotton_A_38342,Cotton_A_02255,Cotton_A_27914,Cotton_A_30338,Cotton_A_02899,Cotton_A_18786,Cotton_A_30146,Cotton_A_23646 MITOCHONDRIAL_PROTON-TRANSPORTING_ATP_SYNTHASE_COMPLEX,_COUPLING_FACTOR_F(O) GO_CC Gossypium arboreum GO:0000276 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0000276 GO:0000276 mitochondrial_proton-transporting_ATP_synthase_complex,_coupling_factor_F(o) GOslim:cellular_component GO:0000276 mitochondrial_proton-transporting_ATP_synthase_complex,_coupling_factor_F(o) GOslim:cellular_component Cotton_A_30965,Cotton_A_09377,Cotton_A_18069,Cotton_A_31542,Cotton_A_10306,Cotton_A_24124,Cotton_A_25549,Cotton_A_29938,Cotton_A_28004,Cotton_A_37563 MITOCHONDRION GO_CC Gossypium arboreum GO:0005739 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0005739 GO:0005739 mitochondrion GOslim:cellular_component GO:0005739 mitochondrion GOslim:cellular_component Cotton_A_39808,Cotton_A_23632,Cotton_A_28032,Cotton_A_28033,Cotton_A_25549,Cotton_A_01248,Cotton_A_26515,Cotton_A_35358,Cotton_A_11301,Cotton_A_13155,Cotton_A_34445,Cotton_A_34446,Cotton_A_40036,Cotton_A_32751,Cotton_A_30023,Cotton_A_08929,Cotton_A_11207,Cotton_A_19641,Cotton_A_25805,Cotton_A_06535,Cotton_A_28684,Cotton_A_10188,Cotton_A_19913,Cotton_A_09430,Cotton_A_35167,Cotton_A_28004,Cotton_A_31401,Cotton_A_09373,Cotton_A_31525,Cotton_A_03313,Cotton_A_27154,Cotton_A_28297,Cotton_A_03130,Cotton_A_09808,Cotton_A_29938,Cotton_A_06825,Cotton_A_27136,Cotton_A_09377,Cotton_A_19901,Cotton_A_24924,Cotton_A_32803,Cotton_A_06030,Cotton_A_09034,Cotton_A_08158,Cotton_A_01071,Cotton_A_03274,Cotton_A_07495,Cotton_A_07478,Cotton_A_17076,Cotton_A_32957,Cotton_A_30014,Cotton_A_13422,Cotton_A_31475,Cotton_A_34853,Cotton_A_40183,Cotton_A_10979,Cotton_A_00113,Cotton_A_34412,Cotton_A_24927,Cotton_A_29811,Cotton_A_19436,Cotton_A_21830,Cotton_A_37563,Cotton_A_24124,Cotton_A_09687,Cotton_A_08480,Cotton_A_18069,Cotton_A_13900,Cotton_A_27363,Cotton_A_26776,Cotton_A_38399,Cotton_A_32305,Cotton_A_10909,Cotton_A_12992,Cotton_A_14013,Cotton_A_06789,Cotton_A_16951,Cotton_A_32958,Cotton_A_25032,Cotton_A_23488,Cotton_A_29820,Cotton_A_08989,Cotton_A_20465,Cotton_A_28191,Cotton_A_33031,Cotton_A_03312,Cotton_A_36881,Cotton_A_11806,Cotton_A_31724,Cotton_A_04471,Cotton_A_15729,Cotton_A_06132,Cotton_A_02411,Cotton_A_25102,Cotton_A_31542,Cotton_A_01187,Cotton_A_30311,Cotton_A_26591,Cotton_A_36879,Cotton_A_01182,Cotton_A_22250,Cotton_A_26612,Cotton_A_11330,Cotton_A_22432,Cotton_A_10306,Cotton_A_36727,Cotton_A_34366,Cotton_A_34051,Cotton_A_27135,Cotton_A_22738,Cotton_A_34480,Cotton_A_17777 LARGE_RIBOSOMAL_SUBUNIT GO_CC Gossypium arboreum GO:0015934 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0015934 GO:0015934 large_ribosomal_subunit GOslim:cellular_component GO:0015934 large_ribosomal_subunit GOslim:cellular_component Cotton_A_03654 MEMBRANE_COAT GO_CC Gossypium arboreum GO:0030117 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0030117 GO:0030117 membrane_coat GOslim:cellular_component GO:0030117 membrane_coat GOslim:cellular_component Cotton_A_21094,Cotton_A_31289,Cotton_A_32631,Cotton_A_32632,Cotton_A_35240,Cotton_A_00705,Cotton_A_00706,Cotton_A_00747,Cotton_A_33371,Cotton_A_08898,Cotton_A_15944,Cotton_A_15947,Cotton_A_01128,Cotton_A_09262,Cotton_A_11668,Cotton_A_14254,Cotton_A_36004,Cotton_A_09113,Cotton_A_19386,Cotton_A_05354,Cotton_A_26386,Cotton_A_11913,Cotton_A_19528,Cotton_A_26631,Cotton_A_11839,Cotton_A_01413,Cotton_A_10816,Cotton_A_13571,Cotton_A_21325,Cotton_A_27216,Cotton_A_27217,Cotton_A_32950,Cotton_A_37369 PROTON-TRANSPORTING_ATP_SYNTHASE_COMPLEX,_CATALYTIC_CORE_F(1) GO_CC Gossypium arboreum GO:0045261 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0045261 GO:0045261 proton-transporting_ATP_synthase_complex,_catalytic_core_F(1) GOslim:cellular_component GO:0045261 proton-transporting_ATP_synthase_complex,_catalytic_core_F(1) GOslim:cellular_component Cotton_A_10077,Cotton_A_21693,Cotton_A_25516,Cotton_A_19115,Cotton_A_06445,Cotton_A_32525,Cotton_A_18158,Cotton_A_37401,Cotton_A_04795,Cotton_A_39172,Cotton_A_13161,Cotton_A_20886,Cotton_A_21212,Cotton_A_27486,Cotton_A_07187,Cotton_A_13345,Cotton_A_07858,Cotton_A_35444,Cotton_A_30286,Cotton_A_15414,Cotton_A_27976,Cotton_A_36253,Cotton_A_25882,Cotton_A_36638,Cotton_A_27696,Cotton_A_27972,Cotton_A_39406,Cotton_A_25183 ANAPHASE-PROMOTING_COMPLEX GO_CC Gossypium arboreum GO:0005680 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0005680 GO:0005680 anaphase-promoting_complex GOslim:cellular_component GO:0005680 anaphase-promoting_complex GOslim:cellular_component Cotton_A_10136,Cotton_A_27785,Cotton_A_02580,Cotton_A_05142,Cotton_A_35184,Cotton_A_01604 PROTEIN_KINASE_CK2_COMPLEX GO_CC Gossypium arboreum GO:0005956 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0005956 GO:0005956 protein_kinase_CK2_complex GOslim:cellular_component GO:0005956 protein_kinase_CK2_complex GOslim:cellular_component Cotton_A_07663,Cotton_A_17616,Cotton_A_06521,Cotton_A_16032,Cotton_A_09152,Cotton_A_13174,Cotton_A_21206,Cotton_A_07181,Cotton_A_27716 RIBONUCLEASE_MRP_COMPLEX GO_CC Gossypium arboreum GO:0000172 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0000172 GO:0000172 ribonuclease_MRP_complex GOslim:cellular_component GO:0000172 ribonuclease_MRP_complex GOslim:cellular_component Cotton_A_00442 GOLGI_STACK GO_CC Gossypium arboreum GO:0005795 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0005795 GO:0005795 Golgi_stack GOslim:cellular_component GO:0005795 Golgi_stack GOslim:cellular_component Cotton_A_02490,Cotton_A_28927,Cotton_A_32056,Cotton_A_03510,Cotton_A_03511,Cotton_A_03703,Cotton_A_26151,Cotton_A_03879 COPII_VESICLE_COAT GO_CC Gossypium arboreum GO:0030127 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0030127 GO:0030127 COPII_vesicle_coat GOslim:cellular_component GO:0030127 COPII_vesicle_coat GOslim:cellular_component Cotton_A_07407,Cotton_A_16304,Cotton_A_30907,Cotton_A_15691,Cotton_A_32548,Cotton_A_06565,Cotton_A_12874,Cotton_A_15720,Cotton_A_26090,Cotton_A_26091,Cotton_A_12099,Cotton_A_13874,Cotton_A_16091,Cotton_A_21247,Cotton_A_24441,Cotton_A_14806,Cotton_A_22621,Cotton_A_39295,Cotton_A_30995 EXTRINSIC_COMPONENT_OF_MEMBRANE GO_CC Gossypium arboreum GO:0019898 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0019898 GO:0019898 extrinsic_component_of_membrane GOslim:cellular_component GO:0019898 extrinsic_component_of_membrane GOslim:cellular_component Cotton_A_34751,Cotton_A_34833,Cotton_A_19611,Cotton_A_12249,Cotton_A_15923,Cotton_A_23948,Cotton_A_29859,Cotton_A_29311,Cotton_A_02250,Cotton_A_17919,Cotton_A_21883,Cotton_A_31850,Cotton_A_04714,Cotton_A_20799,Cotton_A_26403,Cotton_A_03309,Cotton_A_17007,Cotton_A_19968,Cotton_A_40593 PRERIBOSOME,_SMALL_SUBUNIT_PRECURSOR GO_CC Gossypium arboreum GO:0030688 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0030688 GO:0030688 preribosome,_small_subunit_precursor GOslim:cellular_component GO:0030688 preribosome,_small_subunit_precursor GOslim:cellular_component Cotton_A_25253,Cotton_A_21555,Cotton_A_29072 VACUOLE GO_CC Gossypium arboreum GO:0005773 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0005773 GO:0005773 vacuole GOslim:cellular_component GO:0005773 vacuole GOslim:cellular_component Cotton_A_14540,Cotton_A_01041,Cotton_A_32411,Cotton_A_32410,Cotton_A_33714,Cotton_A_00900,Cotton_A_05726,Cotton_A_37992,Cotton_A_19748,Cotton_A_01724,Cotton_A_11952,Cotton_A_37239,Cotton_A_00228 PHOSPHATIDYLINOSITOL_3-KINASE_COMPLEX GO_CC Gossypium arboreum GO:0005942 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0005942 GO:0005942 phosphatidylinositol_3-kinase_complex GOslim:cellular_component GO:0005942 phosphatidylinositol_3-kinase_complex GOslim:cellular_component Cotton_A_35851 MITOCHONDRIAL_MEMBRANE GO_CC Gossypium arboreum GO:0031966 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0031966 GO:0031966 mitochondrial_membrane GOslim:cellular_component GO:0031966 mitochondrial_membrane GOslim:cellular_component Cotton_A_30319 NUCLEAR_CHROMOSOME,_TELOMERIC_REGION GO_CC Gossypium arboreum GO:0000784 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0000784 GO:0000784 nuclear_chromosome,_telomeric_region GOslim:cellular_component GO:0000784 nuclear_chromosome,_telomeric_region GOslim:cellular_component Cotton_A_12193,Cotton_A_08028 VIRAL_CAPSID GO_CC Gossypium arboreum GO:0019028 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0019028 GO:0019028 viral_capsid GOslim:cellular_component GO:0019028 viral_capsid GOslim:cellular_component Cotton_A_33175 MICROTUBULE_ORGANIZING_CENTER GO_CC Gossypium arboreum GO:0005815 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0005815 GO:0005815 microtubule_organizing_center GOslim:cellular_component GO:0005815 microtubule_organizing_center GOslim:cellular_component Cotton_A_13975,Cotton_A_39570,Cotton_A_23294,Cotton_A_29665,Cotton_A_11065,Cotton_A_24706 ORIGIN_RECOGNITION_COMPLEX GO_CC Gossypium arboreum GO:0000808 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0000808 GO:0000808 origin_recognition_complex GOslim:cellular_component GO:0000808 origin_recognition_complex GOslim:cellular_component Cotton_A_05546,Cotton_A_21447 PROTEINACEOUS_EXTRACELLULAR_MATRIX GO_CC Gossypium arboreum GO:0005578 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0005578 GO:0005578 proteinaceous_extracellular_matrix GOslim:cellular_component GO:0005578 proteinaceous_extracellular_matrix GOslim:cellular_component Cotton_A_26472,Cotton_A_36860,Cotton_A_08985,Cotton_A_19365 MITOCHONDRIAL_PROTON-TRANSPORTING_ATP_SYNTHASE_COMPLEX,_CATALYTIC_CORE_F(1) GO_CC Gossypium arboreum GO:0000275 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0000275 GO:0000275 mitochondrial_proton-transporting_ATP_synthase_complex,_catalytic_core_F(1) GOslim:cellular_component GO:0000275 mitochondrial_proton-transporting_ATP_synthase_complex,_catalytic_core_F(1) GOslim:cellular_component Cotton_A_34480,Cotton_A_24924,Cotton_A_24927,Cotton_A_10909,Cotton_A_27154 MONOLAYER-SURROUNDED_LIPID_STORAGE_BODY GO_CC Gossypium arboreum GO:0012511 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0000148 GO:0000148 1,3-beta-D-glucan_synthase_complex GOslim:cellular_component GO:0000148 1,3-beta-D-glucan_synthase_complex GOslim:cellular_component Cotton_A_38155,Cotton_A_08328,Cotton_A_08330,Cotton_A_08333,Cotton_A_17997,Cotton_A_18722,Cotton_A_14920,Cotton_A_29867,Cotton_A_11765,Cotton_A_40135,Cotton_A_21819,Cotton_A_11349,Cotton_A_12004,Cotton_A_16163,Cotton_A_36273,Cotton_A_36276,Cotton_A_34968 MEMBRANE_ATTACK_COMPLEX GO_CC Gossypium arboreum GO:0005579 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0005579 GO:0005579 membrane_attack_complex GOslim:cellular_component GO:0005579 membrane_attack_complex GOslim:cellular_component Cotton_A_11326 PROTON-TRANSPORTING_V-TYPE_ATPASE,_V0_DOMAIN GO_CC Gossypium arboreum GO:0033179 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0000785 GO:0000785 chromatin GOslim:cellular_component GO:0000785 chromatin GOslim:cellular_component Cotton_A_05143,Cotton_A_26699,Cotton_A_29334,Cotton_A_03613,Cotton_A_19202,Cotton_A_26929,Cotton_A_02577,Cotton_A_01788,Cotton_A_09098,Cotton_A_29333,Cotton_A_00620,Cotton_A_05160,Cotton_A_10023,Cotton_A_12251,Cotton_A_16132,Cotton_A_17151,Cotton_A_18453,Cotton_A_19157,Cotton_A_20210,Cotton_A_20211,Cotton_A_40537 VACUOLAR_PROTON-TRANSPORTING_V-TYPE_ATPASE,_V1_DOMAIN GO_CC Gossypium arboreum GO:0000221 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0000221 GO:0000221 vacuolar_proton-transporting_V-type_ATPase,_V1_domain GOslim:cellular_component GO:0000221 vacuolar_proton-transporting_V-type_ATPase,_V1_domain GOslim:cellular_component Cotton_A_14835,Cotton_A_40428,Cotton_A_37992,Cotton_A_05726 CELL_CORTEX GO_CC Gossypium arboreum GO:0005938 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0005938 GO:0005938 cell_cortex GOslim:cellular_component GO:0005938 cell_cortex GOslim:cellular_component Cotton_A_01772,Cotton_A_33339,Cotton_A_38353 CIS-GOLGI_NETWORK GO_CC Gossypium arboreum GO:0005801 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0005801 GO:0005801 cis-Golgi_network GOslim:cellular_component GO:0005801 cis-Golgi_network GOslim:cellular_component Cotton_A_02410,Cotton_A_12045,Cotton_A_34987,Cotton_A_05553,Cotton_A_03185 TRANSCRIPTIONAL_REPRESSOR_COMPLEX GO_CC Gossypium arboreum GO:0017053 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0017053 GO:0017053 transcriptional_repressor_complex GOslim:cellular_component GO:0017053 transcriptional_repressor_complex GOslim:cellular_component Cotton_A_10975,Cotton_A_04877,Cotton_A_27916,Cotton_A_06811 RIBONUCLEOSIDE-DIPHOSPHATE_REDUCTASE_COMPLEX GO_CC Gossypium arboreum GO:0005971 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0005971 GO:0005971 ribonucleoside-diphosphate_reductase_complex GOslim:cellular_component GO:0005971 ribonucleoside-diphosphate_reductase_complex GOslim:cellular_component Cotton_A_25723,Cotton_A_40803 ACETYL-COA_CARBOXYLASE_COMPLEX GO_CC Gossypium arboreum GO:0009317 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0009317 GO:0009317 acetyl-CoA_carboxylase_complex GOslim:cellular_component GO:0009317 acetyl-CoA_carboxylase_complex GOslim:cellular_component Cotton_A_30019,Cotton_A_31991,Cotton_A_40726,Cotton_A_18292,Cotton_A_23281,Cotton_A_25594,Cotton_A_25681,Cotton_A_36640,Cotton_A_38676 GOLGI_APPARATUS GO_CC Gossypium arboreum GO:0005794 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0016820 GO:0016820 hydrolase_activity,_acting_on_acid_anhydrides,_catalyzing_transmembrane_movement_of_substances GOslim:molecular_function GO:0016820 hydrolase_activity,_acting_on_acid_anhydrides,_catalyzing_transmembrane_movement_of_substances GOslim:molecular_function Cotton_A_07603,Cotton_A_10609,Cotton_A_13048,Cotton_A_10077,Cotton_A_28256,Cotton_A_34480,Cotton_A_36452,Cotton_A_06444,Cotton_A_06463,Cotton_A_23431,Cotton_A_24924,Cotton_A_24927,Cotton_A_25549,Cotton_A_32514,Cotton_A_32525,Cotton_A_37992,Cotton_A_28562,Cotton_A_27413,Cotton_A_30619,Cotton_A_36254,Cotton_A_15087,Cotton_A_17339,Cotton_A_22495,Cotton_A_05726,Cotton_A_36639,Cotton_A_10260,Cotton_A_28481,Cotton_A_33190,Cotton_A_35445,Cotton_A_39187,Cotton_A_25036,Cotton_A_37239,Cotton_A_10091,Cotton_A_09444,Cotton_A_00900,Cotton_A_32225,Cotton_A_33714,Cotton_A_30824,Cotton_A_00420,Cotton_A_01072,Cotton_A_01119,Cotton_A_01268,Cotton_A_01905,Cotton_A_02222,Cotton_A_02685,Cotton_A_04315,Cotton_A_04473,Cotton_A_06056,Cotton_A_06421,Cotton_A_06727,Cotton_A_07526,Cotton_A_08575,Cotton_A_08601,Cotton_A_09053,Cotton_A_09115,Cotton_A_09309,Cotton_A_09312,Cotton_A_09766,Cotton_A_10107,Cotton_A_11524,Cotton_A_14844,Cotton_A_15074,Cotton_A_16470,Cotton_A_16471,Cotton_A_16483,Cotton_A_16922,Cotton_A_16931,Cotton_A_17071,Cotton_A_18600,Cotton_A_18913,Cotton_A_20278,Cotton_A_20877,Cotton_A_23434,Cotton_A_23477,Cotton_A_24167,Cotton_A_24664,Cotton_A_24709,Cotton_A_24775,Cotton_A_25023,Cotton_A_25371,Cotton_A_25785,Cotton_A_25987,Cotton_A_25991,Cotton_A_25993,Cotton_A_26619,Cotton_A_28934,Cotton_A_28935,Cotton_A_31403,Cotton_A_31687,Cotton_A_32292,Cotton_A_32785,Cotton_A_33194,Cotton_A_35312,Cotton_A_35531,Cotton_A_37085,Cotton_A_37549,Cotton_A_38943,Cotton_A_39154,Cotton_A_39885 IMPORTIN-ALPHA_EXPORT_RECEPTOR_ACTIVITY GO_MF Gossypium arboreum GO:0008262 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0008262 GO:0008262 importin-alpha_export_receptor_activity GOslim:molecular_function GO:0008262 importin-alpha_export_receptor_activity GOslim:molecular_function Cotton_A_31048 DRUG_TRANSMEMBRANE_TRANSPORTER_ACTIVITY GO_MF Gossypium arboreum GO:0015238 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0015238 GO:0015238 drug_transmembrane_transporter_activity GOslim:molecular_function GO:0015238 drug_transmembrane_transporter_activity GOslim:molecular_function Cotton_A_01824,Cotton_A_01858,Cotton_A_07545,Cotton_A_07598,Cotton_A_07599,Cotton_A_12471,Cotton_A_14741,Cotton_A_25604,Cotton_A_25605,Cotton_A_25608,Cotton_A_27875,Cotton_A_36951,Cotton_A_37422,Cotton_A_02806,Cotton_A_09404,Cotton_A_18103,Cotton_A_00294,Cotton_A_15329,Cotton_A_00702,Cotton_A_00703,Cotton_A_00704,Cotton_A_10319,Cotton_A_12208,Cotton_A_12209,Cotton_A_23601,Cotton_A_36630,Cotton_A_36631,Cotton_A_08859,Cotton_A_20416,Cotton_A_17271,Cotton_A_30984,Cotton_A_36352,Cotton_A_38142,Cotton_A_39721,Cotton_A_40180,Cotton_A_00148,Cotton_A_04850,Cotton_A_06267,Cotton_A_17154,Cotton_A_17155,Cotton_A_33036,Cotton_A_16784,Cotton_A_16785,Cotton_A_16786,Cotton_A_24370,Cotton_A_02516,Cotton_A_04051,Cotton_A_04689,Cotton_A_13693,Cotton_A_19523,Cotton_A_34394,Cotton_A_06827,Cotton_A_09978,Cotton_A_12986,Cotton_A_14530,Cotton_A_29722,Cotton_A_29724,Cotton_A_18824,Cotton_A_24645,Cotton_A_25640,Cotton_A_38174,Cotton_A_01338,Cotton_A_01420,Cotton_A_11428,Cotton_A_20939,Cotton_A_35442,Cotton_A_35736,Cotton_A_38110,Cotton_A_37169 NAD+_ADP-RIBOSYLTRANSFERASE_ACTIVITY GO_MF Gossypium arboreum GO:0003950 Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/term_details?term=GO:0003950 GO:0003950 NAD+_ADP-ribosyltransferase_activity GOslim:molecular_function GO:0003950 NAD+_ADP-ribosyltransferase_activity GOslim:molecular_function Cotton_A_32771,Cotton_A_23293,Cotton_A_13887,Cotton_A_16681,Cotton_A_21374,Cotton_A_27826,Cotton_A_09734,Cotton_A_01488,Cotton_A_07931,Cotton_A_23044 ZINC_ION_BINDING GO_MF Gossypium arboreum GO:0008270 Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory NA BSD Transcription_Regulator BSD Transcription_Regulator Cotton_A_02767,Cotton_A_06211,Cotton_A_09784,Cotton_A_10603,Cotton_A_20507,Cotton_A_23471,Cotton_A_25244,Cotton_A_30079,Cotton_A_31925,Cotton_A_36523,Cotton_A_40847,Cotton_A_36522 TRANSCRIPTION_REGULATOR_IWS1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA IWS1 Transcription_Regulator IWS1 Transcription_Regulator Cotton_A_04084,Cotton_A_04314,Cotton_A_05996,Cotton_A_07644,Cotton_A_07937,Cotton_A_12461,Cotton_A_13095,Cotton_A_13097,Cotton_A_14309,Cotton_A_15127,Cotton_A_15130,Cotton_A_15135,Cotton_A_15616,Cotton_A_25396,Cotton_A_26592,Cotton_A_32158 TRANSCRIPTION_REGULATOR_Orphans GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory NA mTERF Transcription_Regulator mTERF Transcription_Regulator Cotton_A_02134,Cotton_A_02930,Cotton_A_04874,Cotton_A_04875,Cotton_A_04906,Cotton_A_05593,Cotton_A_06397,Cotton_A_08796,Cotton_A_10111,Cotton_A_11835,Cotton_A_15517,Cotton_A_17608,Cotton_A_17817,Cotton_A_17818,Cotton_A_17819,Cotton_A_17820,Cotton_A_17821,Cotton_A_17822,Cotton_A_17823,Cotton_A_18008,Cotton_A_18781,Cotton_A_19380,Cotton_A_22884,Cotton_A_23164,Cotton_A_23685,Cotton_A_24617,Cotton_A_24722,Cotton_A_24723,Cotton_A_27024,Cotton_A_28223,Cotton_A_30876,Cotton_A_31929,Cotton_A_33733,Cotton_A_35701,Cotton_A_39911,Cotton_A_40079,Cotton_A_40686,Cotton_A_40706,Cotton_A_41048 TRANSCRIPTION_REGULATOR_SBP GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory NA Coactivator p15 Transcription_Regulator_(Coactivator_p15) Coactivator p15 Transcription_Regulator_(Coactivator_p15) Cotton_A_09503,Cotton_A_14404,Cotton_A_29121,Cotton_A_36151 TRANSCRIPTION_REGULATOR_LOB GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA LOB Transcription_Regulator LOB Transcription_Regulator Cotton_A_00996,Cotton_A_01340,Cotton_A_01732,Cotton_A_03364,Cotton_A_03365,Cotton_A_04070,Cotton_A_04160,Cotton_A_04183,Cotton_A_05223,Cotton_A_05224,Cotton_A_05624,Cotton_A_06006,Cotton_A_06694,Cotton_A_07740,Cotton_A_08437,Cotton_A_08599,Cotton_A_08600,Cotton_A_09199,Cotton_A_09474,Cotton_A_10145,Cotton_A_10152,Cotton_A_11307,Cotton_A_11954,Cotton_A_13320,Cotton_A_13825,Cotton_A_13980,Cotton_A_14292,Cotton_A_14412,Cotton_A_14848,Cotton_A_15754,Cotton_A_16830,Cotton_A_16998,Cotton_A_17088,Cotton_A_17319,Cotton_A_18920,Cotton_A_18980,Cotton_A_19238,Cotton_A_19285,Cotton_A_20528,Cotton_A_20634,Cotton_A_20674,Cotton_A_20675,Cotton_A_21348,Cotton_A_21713,Cotton_A_23498,Cotton_A_23989,Cotton_A_23990,Cotton_A_23991,Cotton_A_24288,Cotton_A_24381,Cotton_A_24772,Cotton_A_25715,Cotton_A_26059,Cotton_A_26179,Cotton_A_26935,Cotton_A_28637,Cotton_A_28638,Cotton_A_29937,Cotton_A_30915,Cotton_A_31814,Cotton_A_32772,Cotton_A_32773,Cotton_A_33719,Cotton_A_36884,Cotton_A_38441,Cotton_A_38801,Cotton_A_38917,Cotton_A_39710 TRANSCRIPTION_REGULATOR_Trihelix GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA Trihelix Transcription_Regulator Trihelix Transcription_Regulator Cotton_A_00051,Cotton_A_00322,Cotton_A_00508,Cotton_A_00524,Cotton_A_01032,Cotton_A_02660,Cotton_A_03492,Cotton_A_03825,Cotton_A_04914,Cotton_A_05257,Cotton_A_05357,Cotton_A_05507,Cotton_A_05643,Cotton_A_05869,Cotton_A_10368,Cotton_A_10382,Cotton_A_11272,Cotton_A_11840,Cotton_A_12728,Cotton_A_12729,Cotton_A_13010,Cotton_A_13185,Cotton_A_14977,Cotton_A_15314,Cotton_A_15315,Cotton_A_16240,Cotton_A_16456,Cotton_A_17373,Cotton_A_17537,Cotton_A_19924,Cotton_A_20237,Cotton_A_21044,Cotton_A_21204,Cotton_A_21637,Cotton_A_22342,Cotton_A_24495,Cotton_A_24895,Cotton_A_26259,Cotton_A_28289,Cotton_A_31292,Cotton_A_32681,Cotton_A_36212,Cotton_A_36213,Cotton_A_39677,Cotton_A_39997 TRANSCRIPTION_REGULATOR_GRF GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GRF Transcription_Regulator GRF Transcription_Regulator Cotton_A_03163,Cotton_A_06427,Cotton_A_07749,Cotton_A_08528,Cotton_A_09326,Cotton_A_09791,Cotton_A_09943,Cotton_A_13200,Cotton_A_13201,Cotton_A_13440,Cotton_A_16674,Cotton_A_19273,Cotton_A_23464,Cotton_A_23512,Cotton_A_25254,Cotton_A_35986,Cotton_A_36089,Cotton_A_36649 TRANSCRIPTION_REGULATOR_S1Fa-like GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA S1Fa-like Transcription_Regulator S1Fa-like Transcription_Regulator Cotton_A_00448 TRANSCRIPTION_REGULATOR_GNAT GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GNAT Transcription_Regulator GNAT Transcription_Regulator Cotton_A_01919,Cotton_A_02970,Cotton_A_03165,Cotton_A_04035,Cotton_A_04206,Cotton_A_05166,Cotton_A_05731,Cotton_A_06424,Cotton_A_08346,Cotton_A_08347,Cotton_A_08715,Cotton_A_09760,Cotton_A_09776,Cotton_A_10492,Cotton_A_12481,Cotton_A_16964,Cotton_A_17087,Cotton_A_18073,Cotton_A_19553,Cotton_A_21691,Cotton_A_21823,Cotton_A_22577,Cotton_A_22717,Cotton_A_22726,Cotton_A_22752,Cotton_A_23401,Cotton_A_23404,Cotton_A_25168,Cotton_A_26574,Cotton_A_29344,Cotton_A_31951,Cotton_A_31952,Cotton_A_31953,Cotton_A_31964,Cotton_A_32087,Cotton_A_33362,Cotton_A_33375,Cotton_A_34898,Cotton_A_36556,Cotton_A_36803,Cotton_A_37161,Cotton_A_37297,Cotton_A_37351,Cotton_A_39498,Cotton_A_39834,Cotton_A_40142,Cotton_A_41058,Cotton_A_41229 TRANSCRIPTION_REGULATOR_HB GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA HB Transcription_Regulator HB Transcription_Regulator Cotton_A_00390,Cotton_A_00505,Cotton_A_00507,Cotton_A_00715,Cotton_A_01049,Cotton_A_01196,Cotton_A_01436,Cotton_A_01437,Cotton_A_01469,Cotton_A_01632,Cotton_A_01649,Cotton_A_02021,Cotton_A_02211,Cotton_A_02285,Cotton_A_02375,Cotton_A_02596,Cotton_A_02692,Cotton_A_02815,Cotton_A_03394,Cotton_A_03738,Cotton_A_03937,Cotton_A_04252,Cotton_A_04266,Cotton_A_04480,Cotton_A_04656,Cotton_A_05000,Cotton_A_05001,Cotton_A_05129,Cotton_A_05379,Cotton_A_05396,Cotton_A_05511,Cotton_A_05613,Cotton_A_06253,Cotton_A_06354,Cotton_A_06375,Cotton_A_07016,Cotton_A_07061,Cotton_A_07152,Cotton_A_07197,Cotton_A_07682,Cotton_A_07684,Cotton_A_07685,Cotton_A_07844,Cotton_A_08380,Cotton_A_08384,Cotton_A_08468,Cotton_A_08673,Cotton_A_09092,Cotton_A_09138,Cotton_A_09802,Cotton_A_09961,Cotton_A_10243,Cotton_A_10520,Cotton_A_10549,Cotton_A_10669,Cotton_A_10835,Cotton_A_11086,Cotton_A_11191,Cotton_A_11308,Cotton_A_11370,Cotton_A_11503,Cotton_A_11973,Cotton_A_13207,Cotton_A_13481,Cotton_A_13945,Cotton_A_14429,Cotton_A_15440,Cotton_A_16168,Cotton_A_17302,Cotton_A_17618,Cotton_A_18479,Cotton_A_19190,Cotton_A_19290,Cotton_A_19429,Cotton_A_19739,Cotton_A_20173,Cotton_A_20373,Cotton_A_20473,Cotton_A_21639,Cotton_A_21696,Cotton_A_22129,Cotton_A_22259,Cotton_A_22352,Cotton_A_22674,Cotton_A_22902,Cotton_A_23718,Cotton_A_23721,Cotton_A_23798,Cotton_A_23799,Cotton_A_24123,Cotton_A_24179,Cotton_A_24588,Cotton_A_24633,Cotton_A_24777,Cotton_A_25113,Cotton_A_25268,Cotton_A_25269,Cotton_A_25654,Cotton_A_25802,Cotton_A_25888,Cotton_A_26317,Cotton_A_26519,Cotton_A_26598,Cotton_A_27084,Cotton_A_27212,Cotton_A_27417,Cotton_A_27816,Cotton_A_27817,Cotton_A_27818,Cotton_A_27957,Cotton_A_28247,Cotton_A_28415,Cotton_A_28656,Cotton_A_29012,Cotton_A_29751,Cotton_A_30275,Cotton_A_30333,Cotton_A_30465,Cotton_A_31305,Cotton_A_31306,Cotton_A_31330,Cotton_A_32201,Cotton_A_32300,Cotton_A_32341,Cotton_A_32389,Cotton_A_32808,Cotton_A_33133,Cotton_A_33264,Cotton_A_33669,Cotton_A_33973,Cotton_A_34090,Cotton_A_34107,Cotton_A_34157,Cotton_A_34158,Cotton_A_34527,Cotton_A_34913,Cotton_A_35264,Cotton_A_35320,Cotton_A_35739,Cotton_A_36822,Cotton_A_36823,Cotton_A_37018,Cotton_A_37086,Cotton_A_38379,Cotton_A_38457,Cotton_A_38798,Cotton_A_39058,Cotton_A_39066,Cotton_A_39083,Cotton_A_39533,Cotton_A_39708,Cotton_A_39756,Cotton_A_40124,Cotton_A_40228,Cotton_A_41190,Cotton_A_41261 TRANSCRIPTION_REGULATOR_Alfin-like GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA Alfin-like Transcription_Regulator Alfin-like Transcription_Regulator Cotton_A_00987,Cotton_A_03151,Cotton_A_05634,Cotton_A_08539,Cotton_A_11335,Cotton_A_13839,Cotton_A_14035,Cotton_A_15847,Cotton_A_30280,Cotton_A_36668,Cotton_A_40843 TRANSCRIPTION_REGULATOR_zf-HD GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA zf-HD Transcription_Regulator zf-HD Transcription_Regulator Cotton_A_01606,Cotton_A_02016,Cotton_A_02051,Cotton_A_02798,Cotton_A_05931,Cotton_A_09279,Cotton_A_11203,Cotton_A_13064,Cotton_A_13766,Cotton_A_14653,Cotton_A_17599,Cotton_A_19854,Cotton_A_27582,Cotton_A_27654,Cotton_A_30607,Cotton_A_30610,Cotton_A_31397,Cotton_A_34763,Cotton_A_36026,Cotton_A_36769,Cotton_A_37150,Cotton_A_38394,Cotton_A_39305 TRANSCRIPTION_REGULATOR_MED6 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory NA HMG Transcription_Regulator HMG Transcription_Regulator Cotton_A_00313,Cotton_A_00980,Cotton_A_02493,Cotton_A_04604,Cotton_A_12660,Cotton_A_14594,Cotton_A_15604,Cotton_A_15752,Cotton_A_16218,Cotton_A_19351,Cotton_A_20604,Cotton_A_27464,Cotton_A_28209,Cotton_A_28745,Cotton_A_33756,Cotton_A_36892,Cotton_A_37388 TRANSCRIPTION_REGULATOR_ARF GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ARF Transcription_Regulator ARF Transcription_Regulator Cotton_A_01738,Cotton_A_01955,Cotton_A_02933,Cotton_A_03644,Cotton_A_03933,Cotton_A_04263,Cotton_A_05677,Cotton_A_06071,Cotton_A_06107,Cotton_A_07064,Cotton_A_07995,Cotton_A_08273,Cotton_A_10518,Cotton_A_11048,Cotton_A_11311,Cotton_A_14407,Cotton_A_14740,Cotton_A_16138,Cotton_A_16408,Cotton_A_16760,Cotton_A_18446,Cotton_A_18937,Cotton_A_21333,Cotton_A_22543,Cotton_A_23397,Cotton_A_24047,Cotton_A_25871,Cotton_A_26156,Cotton_A_27669,Cotton_A_27843,Cotton_A_31049,Cotton_A_31395,Cotton_A_35443,Cotton_A_36154,Cotton_A_38575,Cotton_A_40208,Cotton_A_23394 TRANSCRIPTION_REGULATOR_FAR1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory NA Pseudo ARR-B Transcription_Regulator_(Pseudo_ARR-B) Pseudo ARR-B Transcription_Regulator_(Pseudo_ARR-B) Cotton_A_02371,Cotton_A_02454,Cotton_A_05538,Cotton_A_07019,Cotton_A_15652,Cotton_A_19278,Cotton_A_20332,Cotton_A_29955,Cotton_A_38950 TRANSCRIPTION_REGULATOR_ABI3VP1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory NA CCAAT Transcription_Regulator CCAAT Transcription_Regulator Cotton_A_00410,Cotton_A_00435,Cotton_A_02119,Cotton_A_02125,Cotton_A_02245,Cotton_A_02277,Cotton_A_02567,Cotton_A_02671,Cotton_A_03153,Cotton_A_03200,Cotton_A_03321,Cotton_A_03704,Cotton_A_04625,Cotton_A_04868,Cotton_A_05536,Cotton_A_05707,Cotton_A_06049,Cotton_A_06526,Cotton_A_06685,Cotton_A_06742,Cotton_A_06793,Cotton_A_08040,Cotton_A_08309,Cotton_A_08538,Cotton_A_09663,Cotton_A_09997,Cotton_A_10241,Cotton_A_10542,Cotton_A_10544,Cotton_A_11031,Cotton_A_11245,Cotton_A_11430,Cotton_A_12715,Cotton_A_12983,Cotton_A_13300,Cotton_A_13877,Cotton_A_13919,Cotton_A_15634,Cotton_A_16018,Cotton_A_16851,Cotton_A_17922,Cotton_A_18010,Cotton_A_18601,Cotton_A_18789,Cotton_A_19936,Cotton_A_20271,Cotton_A_21066,Cotton_A_21280,Cotton_A_21361,Cotton_A_21434,Cotton_A_22387,Cotton_A_22406,Cotton_A_22531,Cotton_A_22550,Cotton_A_23317,Cotton_A_23424,Cotton_A_24712,Cotton_A_26079,Cotton_A_26323,Cotton_A_29111,Cotton_A_29133,Cotton_A_29306,Cotton_A_31582,Cotton_A_32061,Cotton_A_32253,Cotton_A_32311,Cotton_A_32497,Cotton_A_33028,Cotton_A_36618,Cotton_A_37546,Cotton_A_39954,Cotton_A_40576 TRANSCRIPTION_REGULATOR_LUG GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA LUG Transcription_Regulator LUG Transcription_Regulator Cotton_A_04993,Cotton_A_05873,Cotton_A_11340,Cotton_A_16285,Cotton_A_20437,Cotton_A_35498,Cotton_A_35499,Cotton_A_38777,Cotton_A_39699,Cotton_A_05872 TRANSCRIPTION_REGULATOR_MED7 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA MED7 Transcription_Regulator MED7 Transcription_Regulator Cotton_A_06601 TRANSCRIPTION_REGULATOR_C2H2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA C2H2 Transcription_Regulator C2H2 Transcription_Regulator Cotton_A_00011,Cotton_A_00383,Cotton_A_00487,Cotton_A_00517,Cotton_A_00587,Cotton_A_00928,Cotton_A_00942,Cotton_A_01116,Cotton_A_01466,Cotton_A_01628,Cotton_A_01629,Cotton_A_01742,Cotton_A_01862,Cotton_A_02243,Cotton_A_02437,Cotton_A_02439,Cotton_A_02564,Cotton_A_02832,Cotton_A_03311,Cotton_A_03585,Cotton_A_03586,Cotton_A_03995,Cotton_A_03996,Cotton_A_04482,Cotton_A_04715,Cotton_A_05439,Cotton_A_05503,Cotton_A_06087,Cotton_A_06180,Cotton_A_06773,Cotton_A_06824,Cotton_A_07135,Cotton_A_07361,Cotton_A_07623,Cotton_A_07707,Cotton_A_07802,Cotton_A_07818,Cotton_A_07959,Cotton_A_08194,Cotton_A_08245,Cotton_A_08293,Cotton_A_08799,Cotton_A_09528,Cotton_A_09582,Cotton_A_09671,Cotton_A_10286,Cotton_A_10539,Cotton_A_10871,Cotton_A_10872,Cotton_A_10916,Cotton_A_11017,Cotton_A_11041,Cotton_A_11495,Cotton_A_11969,Cotton_A_12092,Cotton_A_12503,Cotton_A_12929,Cotton_A_13065,Cotton_A_13116,Cotton_A_13280,Cotton_A_13302,Cotton_A_13347,Cotton_A_13737,Cotton_A_13908,Cotton_A_13920,Cotton_A_13948,Cotton_A_14012,Cotton_A_14847,Cotton_A_14880,Cotton_A_15327,Cotton_A_15377,Cotton_A_16124,Cotton_A_16132,Cotton_A_16553,Cotton_A_16994,Cotton_A_17077,Cotton_A_17603,Cotton_A_18399,Cotton_A_18453,Cotton_A_18465,Cotton_A_18629,Cotton_A_18922,Cotton_A_19328,Cotton_A_19635,Cotton_A_19663,Cotton_A_19869,Cotton_A_20184,Cotton_A_20229,Cotton_A_20230,Cotton_A_20334,Cotton_A_20732,Cotton_A_20833,Cotton_A_21716,Cotton_A_21865,Cotton_A_22124,Cotton_A_22698,Cotton_A_22728,Cotton_A_22907,Cotton_A_22908,Cotton_A_22951,Cotton_A_22961,Cotton_A_23121,Cotton_A_23497,Cotton_A_23645,Cotton_A_23691,Cotton_A_23987,Cotton_A_24414,Cotton_A_24729,Cotton_A_25013,Cotton_A_25086,Cotton_A_25087,Cotton_A_25548,Cotton_A_25928,Cotton_A_26287,Cotton_A_26449,Cotton_A_26936,Cotton_A_27118,Cotton_A_27168,Cotton_A_27458,Cotton_A_28135,Cotton_A_28174,Cotton_A_28213,Cotton_A_28611,Cotton_A_28641,Cotton_A_28643,Cotton_A_28862,Cotton_A_29310,Cotton_A_29495,Cotton_A_29576,Cotton_A_29686,Cotton_A_29807,Cotton_A_30177,Cotton_A_30220,Cotton_A_30227,Cotton_A_30562,Cotton_A_31376,Cotton_A_31377,Cotton_A_31827,Cotton_A_31963,Cotton_A_32041,Cotton_A_32209,Cotton_A_32480,Cotton_A_32488,Cotton_A_32489,Cotton_A_32768,Cotton_A_32868,Cotton_A_33225,Cotton_A_33418,Cotton_A_33892,Cotton_A_35591,Cotton_A_35682,Cotton_A_35683,Cotton_A_36496,Cotton_A_36602,Cotton_A_36792,Cotton_A_36933,Cotton_A_36942,Cotton_A_37749,Cotton_A_37800,Cotton_A_37867,Cotton_A_37922,Cotton_A_38190,Cotton_A_38986,Cotton_A_39342,Cotton_A_39901,Cotton_A_40524,Cotton_A_40713,Cotton_A_41187,Cotton_A_08286,Cotton_A_13929 TRANSCRIPTION_REGULATOR_SWI/SNF-BAF60b GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA SWI/SNF-BAF60b Transcription_Regulator SWI/SNF-BAF60b Transcription_Regulator Cotton_A_00695,Cotton_A_00783,Cotton_A_02005,Cotton_A_04926,Cotton_A_08051,Cotton_A_08485,Cotton_A_14263,Cotton_A_15540,Cotton_A_18673,Cotton_A_21705,Cotton_A_24591,Cotton_A_25678,Cotton_A_27368,Cotton_A_28621,Cotton_A_29716,Cotton_A_30977,Cotton_A_31393,Cotton_A_33721,Cotton_A_38270 TRANSCRIPTION_REGULATOR_SAP GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA SAP Transcription_Regulator SAP Transcription_Regulator Cotton_A_32051,Cotton_A_40741 TRANSCRIPTION_REGULATOR_FHA GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA FHA Transcription_Regulator FHA Transcription_Regulator Cotton_A_01861,Cotton_A_03628,Cotton_A_04905,Cotton_A_05098,Cotton_A_07745,Cotton_A_08314,Cotton_A_11056,Cotton_A_15183,Cotton_A_15570,Cotton_A_19926,Cotton_A_21334,Cotton_A_24363,Cotton_A_25823,Cotton_A_25947,Cotton_A_31383,Cotton_A_36381,Cotton_A_39166 TRANSCRIPTION_REGULATOR_BES1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA BES1 Transcription_Regulator BES1 Transcription_Regulator Cotton_A_03434,Cotton_A_05312,Cotton_A_07763,Cotton_A_13575,Cotton_A_13729,Cotton_A_14161,Cotton_A_18778,Cotton_A_21459,Cotton_A_28046,Cotton_A_34134,Cotton_A_34170,Cotton_A_35761 TRANSCRIPTION_REGULATOR_PBF-2-like GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PBF-2-like Transcription_Regulator PBF-2-like Transcription_Regulator Cotton_A_05820,Cotton_A_36246 TRANSCRIPTION_REGULATOR_ULT GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ULT Transcription_Regulator ULT Transcription_Regulator Cotton_A_13638,Cotton_A_17968,Cotton_A_30249 TRANSCRIPTION_REGULATOR_EIL GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA EIL Transcription_Regulator EIL Transcription_Regulator Cotton_A_02559,Cotton_A_04284,Cotton_A_05109,Cotton_A_07037,Cotton_A_10526,Cotton_A_11210,Cotton_A_39037 TRANSCRIPTION_REGULATOR_CAMTA GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CAMTA Transcription_Regulator CAMTA Transcription_Regulator Cotton_A_00802,Cotton_A_21232,Cotton_A_21790,Cotton_A_24164,Cotton_A_30458,Cotton_A_34645,Cotton_A_40245 TRANSCRIPTION_REGULATOR_OFP GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA OFP Transcription_Regulator OFP Transcription_Regulator Cotton_A_01627,Cotton_A_02301,Cotton_A_02302,Cotton_A_04329,Cotton_A_04645,Cotton_A_05359,Cotton_A_08214,Cotton_A_08545,Cotton_A_09610,Cotton_A_10358,Cotton_A_10468,Cotton_A_11158,Cotton_A_12420,Cotton_A_12472,Cotton_A_13461,Cotton_A_13743,Cotton_A_16971,Cotton_A_18774,Cotton_A_25542,Cotton_A_25544,Cotton_A_27255,Cotton_A_30257,Cotton_A_30297,Cotton_A_31798,Cotton_A_32353,Cotton_A_38130,Cotton_A_38748,Cotton_A_41300 TRANSCRIPTION_REGULATOR_WRKY GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory NA SNF2 Transcription_Regulator SNF2 Transcription_Regulator Cotton_A_01788,Cotton_A_01900,Cotton_A_02577,Cotton_A_02636,Cotton_A_03333,Cotton_A_04470,Cotton_A_05801,Cotton_A_05993,Cotton_A_08990,Cotton_A_09277,Cotton_A_09621,Cotton_A_10587,Cotton_A_13821,Cotton_A_14768,Cotton_A_17316,Cotton_A_19736,Cotton_A_20228,Cotton_A_20546,Cotton_A_20657,Cotton_A_21253,Cotton_A_21443,Cotton_A_22365,Cotton_A_23795,Cotton_A_24739,Cotton_A_25563,Cotton_A_27211,Cotton_A_28526,Cotton_A_29106,Cotton_A_29542,Cotton_A_29805,Cotton_A_29823,Cotton_A_31241,Cotton_A_31804,Cotton_A_32427,Cotton_A_32723,Cotton_A_33875,Cotton_A_34973,Cotton_A_35174,Cotton_A_37809,Cotton_A_38674,Cotton_A_39069 TRANSCRIPTION_REGULATOR_AP2-EREBP GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory NA HRT Transcription_Regulator HRT Transcription_Regulator Cotton_A_14549,Cotton_A_14550 TRANSCRIPTION_REGULATOR_ARID GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ARID Transcription_Regulator ARID Transcription_Regulator Cotton_A_02169,Cotton_A_03819,Cotton_A_05667,Cotton_A_12691,Cotton_A_14066,Cotton_A_19526,Cotton_A_20940,Cotton_A_25975,Cotton_A_28671,Cotton_A_29703,Cotton_A_30409,Cotton_A_32284,Cotton_A_33486,Cotton_A_34328,Cotton_A_34983 TRANSCRIPTION_REGULATOR_Tify GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA Tify Transcription_Regulator Tify Transcription_Regulator Cotton_A_00049,Cotton_A_01448,Cotton_A_02654,Cotton_A_02904,Cotton_A_05658,Cotton_A_09418,Cotton_A_10012,Cotton_A_11516,Cotton_A_11862,Cotton_A_12336,Cotton_A_14056,Cotton_A_16991,Cotton_A_18896,Cotton_A_22024,Cotton_A_23690,Cotton_A_27045,Cotton_A_27840,Cotton_A_36075,Cotton_A_36376,Cotton_A_41299 TRANSCRIPTION_REGULATOR_TRAF GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA TRAF Transcription_Regulator TRAF Transcription_Regulator Cotton_A_01650,Cotton_A_01881,Cotton_A_02227,Cotton_A_04198,Cotton_A_04858,Cotton_A_06004,Cotton_A_06484,Cotton_A_07449,Cotton_A_08315,Cotton_A_08609,Cotton_A_12446,Cotton_A_13225,Cotton_A_14558,Cotton_A_14735,Cotton_A_15371,Cotton_A_17345,Cotton_A_20771,Cotton_A_22002,Cotton_A_23686,Cotton_A_30497,Cotton_A_34950,Cotton_A_09762,Cotton_A_14364,Cotton_A_20959,Cotton_A_22996,Cotton_A_23185,Cotton_A_28749 TRANSCRIPTION_REGULATOR_LIM GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA LIM Transcription_Regulator LIM Transcription_Regulator Cotton_A_00967,Cotton_A_06392,Cotton_A_09995,Cotton_A_13549,Cotton_A_14459,Cotton_A_14838,Cotton_A_21476,Cotton_A_21729,Cotton_A_23003,Cotton_A_26589,Cotton_A_31990 TRANSCRIPTION_REGULATOR_SWI/SNF-SWI3 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA SWI/SNF-SWI3 Transcription_Regulator SWI/SNF-SWI3 Transcription_Regulator Cotton_A_04587,Cotton_A_10025,Cotton_A_17947,Cotton_A_19021,Cotton_A_27244,Cotton_A_30323,Cotton_A_35745 TRANSCRIPTION_REGULATOR_GRAS GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GRAS Transcription_Regulator GRAS Transcription_Regulator Cotton_A_01014,Cotton_A_01620,Cotton_A_01631,Cotton_A_01790,Cotton_A_02423,Cotton_A_02581,Cotton_A_03284,Cotton_A_03445,Cotton_A_03694,Cotton_A_04008,Cotton_A_04290,Cotton_A_04404,Cotton_A_04405,Cotton_A_04406,Cotton_A_04408,Cotton_A_04412,Cotton_A_04413,Cotton_A_04414,Cotton_A_04630,Cotton_A_04922,Cotton_A_05556,Cotton_A_06569,Cotton_A_06807,Cotton_A_06965,Cotton_A_06966,Cotton_A_07105,Cotton_A_08527,Cotton_A_08801,Cotton_A_09677,Cotton_A_09772,Cotton_A_09980,Cotton_A_10566,Cotton_A_10567,Cotton_A_11125,Cotton_A_12101,Cotton_A_12455,Cotton_A_12716,Cotton_A_12754,Cotton_A_14441,Cotton_A_14771,Cotton_A_16113,Cotton_A_16333,Cotton_A_16334,Cotton_A_16339,Cotton_A_16824,Cotton_A_17020,Cotton_A_17926,Cotton_A_18421,Cotton_A_18477,Cotton_A_18579,Cotton_A_19599,Cotton_A_20431,Cotton_A_21357,Cotton_A_21360,Cotton_A_21420,Cotton_A_21679,Cotton_A_21785,Cotton_A_21855,Cotton_A_22052,Cotton_A_22326,Cotton_A_22746,Cotton_A_22965,Cotton_A_23600,Cotton_A_24283,Cotton_A_24410,Cotton_A_25838,Cotton_A_26934,Cotton_A_27285,Cotton_A_29199,Cotton_A_29569,Cotton_A_29570,Cotton_A_29851,Cotton_A_29854,Cotton_A_30598,Cotton_A_30653,Cotton_A_30654,Cotton_A_30811,Cotton_A_30927,Cotton_A_32665,Cotton_A_34201,Cotton_A_34381,Cotton_A_34382,Cotton_A_38432,Cotton_A_40102,Cotton_A_40750,Cotton_A_41295,Cotton_A_16822 TRANSCRIPTION_REGULATOR_Rcd1-like GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory NA TUB Transcription_Regulator TUB Transcription_Regulator Cotton_A_00581,Cotton_A_01603,Cotton_A_02013,Cotton_A_06847,Cotton_A_08277,Cotton_A_13768,Cotton_A_14780,Cotton_A_17032,Cotton_A_17106,Cotton_A_18767,Cotton_A_20151,Cotton_A_22538,Cotton_A_22539,Cotton_A_29419,Cotton_A_29560,Cotton_A_33887,Cotton_A_33944,Cotton_A_34069,Cotton_A_36302,Cotton_A_37396 TRANSCRIPTION_REGULATOR_MYB GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory NA Jumonji Transcription_Regulator Jumonji Transcription_Regulator Cotton_A_01475,Cotton_A_02186,Cotton_A_03863,Cotton_A_07928,Cotton_A_08463,Cotton_A_08968,Cotton_A_09298,Cotton_A_09732,Cotton_A_10232,Cotton_A_12831,Cotton_A_14403,Cotton_A_14590,Cotton_A_15049,Cotton_A_18520,Cotton_A_19243,Cotton_A_25403,Cotton_A_26509,Cotton_A_29370,Cotton_A_30481,Cotton_A_32137,Cotton_A_33259,Cotton_A_37711,Cotton_A_38601 TRANSCRIPTION_REGULATOR_NOZZLE GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA NOZZLE Transcription_Regulator NOZZLE Transcription_Regulator Cotton_A_28157 TRANSCRIPTION_REGULATOR_CSD GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CSD Transcription_Regulator CSD Transcription_Regulator Cotton_A_00241,Cotton_A_00650,Cotton_A_11378,Cotton_A_16121,Cotton_A_18468,Cotton_A_19373,Cotton_A_34922,Cotton_A_39551 STE20-PAK_LIKE_PROTEIN_KINASE_PPC:4.1.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.1.2 STE20-PAK_Like_Protein_Kinase PPC:4.1.2 STE20-PAK_Like_Protein_Kinase Cotton_A_01361,Cotton_A_02342,Cotton_A_06202,Cotton_A_06259,Cotton_A_08581,Cotton_A_10199,Cotton_A_10394,Cotton_A_13215,Cotton_A_16170,Cotton_A_16780,Cotton_A_18976,Cotton_A_20627,Cotton_A_23140,Cotton_A_24728,Cotton_A_28049,Cotton_A_28246,Cotton_A_33528,Cotton_A_34181,Cotton_A_34902,Cotton_A_35073,Cotton_A_35074,Cotton_A_35075,Cotton_A_36265,Cotton_A_41065,Cotton_A_41117 DOMAIN_OF_UNKNOWN_FUNCTION_26_KINASE_PPC:1.7.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.7.2 Domain_of_Unknown_Function_26_Kinase PPC:1.7.2 Domain_of_Unknown_Function_26_Kinase Cotton_A_00100,Cotton_A_01265,Cotton_A_04709,Cotton_A_04719,Cotton_A_04721,Cotton_A_04967,Cotton_A_05365,Cotton_A_05730,Cotton_A_07230,Cotton_A_07641,Cotton_A_08932,Cotton_A_08933,Cotton_A_08934,Cotton_A_09056,Cotton_A_09057,Cotton_A_09058,Cotton_A_11534,Cotton_A_11931,Cotton_A_13085,Cotton_A_13787,Cotton_A_15085,Cotton_A_15370,Cotton_A_15575,Cotton_A_15880,Cotton_A_15883,Cotton_A_16175,Cotton_A_16176,Cotton_A_17628,Cotton_A_17629,Cotton_A_17630,Cotton_A_17633,Cotton_A_17636,Cotton_A_17641,Cotton_A_20810,Cotton_A_20811,Cotton_A_21651,Cotton_A_21652,Cotton_A_21653,Cotton_A_21654,Cotton_A_21656,Cotton_A_21659,Cotton_A_21661,Cotton_A_21663,Cotton_A_21664,Cotton_A_21848,Cotton_A_23056,Cotton_A_23058,Cotton_A_24862,Cotton_A_24864,Cotton_A_26634,Cotton_A_30881,Cotton_A_30882,Cotton_A_30883,Cotton_A_30885,Cotton_A_30891,Cotton_A_31940,Cotton_A_31941,Cotton_A_31942,Cotton_A_31944,Cotton_A_31945,Cotton_A_31946,Cotton_A_33324,Cotton_A_33667,Cotton_A_33668,Cotton_A_34291,Cotton_A_34733,Cotton_A_34735,Cotton_A_34736,Cotton_A_34743,Cotton_A_34744,Cotton_A_35352,Cotton_A_35354,Cotton_A_35609,Cotton_A_35690,Cotton_A_35990,Cotton_A_36073,Cotton_A_36143,Cotton_A_38975,Cotton_A_38977,Cotton_A_38980,Cotton_A_39041,Cotton_A_39042,Cotton_A_39401,Cotton_A_40436,Cotton_A_40923 UNKNOWN_FUNCTION_KINASE_PPC:4.2.5 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.2.5 Unknown_Function_Kinase PPC:4.2.5 Unknown_Function_Kinase Cotton_A_05596,Cotton_A_06079,Cotton_A_06082,Cotton_A_21852,Cotton_A_22936,Cotton_A_30094,Cotton_A_38681 UNKNOWN_FUNCTION_KINASE_PPC:4.4.3 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.4.3 Unknown_Function_Kinase PPC:4.4.3 Unknown_Function_Kinase Cotton_A_17244,Cotton_A_24508,Cotton_A_29141 LEUCINE_RICH_REPEAT_KINASE_III_PPC:1.13.5 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.13.5 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_III PPC:1.13.5 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_III Cotton_A_08679,Cotton_A_11728,Cotton_A_23546,Cotton_A_31071,Cotton_A_36119,Cotton_A_37253 CASEIN_KINASE_II_FAMILY_PPC:4.5.3 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.5.3 Casein_Kinase_II_Family PPC:4.5.3 Casein_Kinase_II_Family Cotton_A_09757,Cotton_A_09758,Cotton_A_09759,Cotton_A_16833,Cotton_A_26933,Cotton_A_30154,Cotton_A_34331 TOUSLED_LIKE_KINASE_PPC:1.4.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.4.2 Tousled_like_kinase PPC:1.4.2 Tousled_like_kinase Cotton_A_02620,Cotton_A_20505 IRE/NPH/PI_DEPENDENT/S6_KINASE_PPC:4.2.6 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.2.6 IRE/NPH/PI_dependent/S6_Kinase PPC:4.2.6 IRE/NPH/PI_dependent/S6_Kinase Cotton_A_01075,Cotton_A_02138,Cotton_A_02184,Cotton_A_02206,Cotton_A_03010,Cotton_A_04041,Cotton_A_04910,Cotton_A_05325,Cotton_A_05499,Cotton_A_06502,Cotton_A_06952,Cotton_A_07018,Cotton_A_07462,Cotton_A_07615,Cotton_A_08429,Cotton_A_08652,Cotton_A_09345,Cotton_A_09571,Cotton_A_10287,Cotton_A_10339,Cotton_A_10628,Cotton_A_11104,Cotton_A_12009,Cotton_A_13056,Cotton_A_13057,Cotton_A_13438,Cotton_A_13739,Cotton_A_13898,Cotton_A_14027,Cotton_A_15202,Cotton_A_15592,Cotton_A_15969,Cotton_A_15972,Cotton_A_16182,Cotton_A_17707,Cotton_A_17839,Cotton_A_18867,Cotton_A_19135,Cotton_A_19675,Cotton_A_20280,Cotton_A_20637,Cotton_A_20656,Cotton_A_21190,Cotton_A_22446,Cotton_A_23592,Cotton_A_24273,Cotton_A_24319,Cotton_A_27995,Cotton_A_28225,Cotton_A_29972,Cotton_A_30399,Cotton_A_30874,Cotton_A_31096,Cotton_A_32160,Cotton_A_34510,Cotton_A_35175,Cotton_A_39141,Cotton_A_39539,Cotton_A_40492 PROTEIN_KINASE_LIKE_RECEPTOR_LIKE_PROTEIN_KINASE/PUTATIVE_SER_THR-SPECIFIC_RECEPTOR_PROTEIN/SER_THR-SPECIFIC_PROTEIN_KINASE_LIKE_PUTATIVE_PPC:1.1.5 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.1.5 protein_kinase_like_receptor_like_protein_kinase/putative_ser_thr-specific_receptor_protein/Ser_thr-specific_protein_kinase_like_putative PPC:1.1.5 protein_kinase_like_receptor_like_protein_kinase/putative_ser_thr-specific_receptor_protein/Ser_thr-specific_protein_kinase_like_putative Cotton_A_18081 LEUCINE_RICH_REPEAT_KINASE_IX_PPC:1.6.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.6.1 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_IX PPC:1.6.1 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_IX Cotton_A_00858,Cotton_A_02289,Cotton_A_06104,Cotton_A_07400,Cotton_A_10511,Cotton_A_13477,Cotton_A_18993,Cotton_A_24421,Cotton_A_25305,Cotton_A_25554,Cotton_A_27419,Cotton_A_30270,Cotton_A_32990,Cotton_A_35261 SNF1_RELATED_PROTEIN_KINASE__PPC:4.2.4 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.2.4 SNF1_Related_Protein_Kinase_ PPC:4.2.4 SNF1_Related_Protein_Kinase_ Cotton_A_00206,Cotton_A_00784,Cotton_A_01175,Cotton_A_01247,Cotton_A_01750,Cotton_A_02041,Cotton_A_02426,Cotton_A_02928,Cotton_A_04065,Cotton_A_04154,Cotton_A_04158,Cotton_A_04331,Cotton_A_04333,Cotton_A_04541,Cotton_A_05019,Cotton_A_05034,Cotton_A_05944,Cotton_A_07248,Cotton_A_08366,Cotton_A_09063,Cotton_A_10809,Cotton_A_10863,Cotton_A_11022,Cotton_A_12475,Cotton_A_13180,Cotton_A_13289,Cotton_A_15478,Cotton_A_15585,Cotton_A_15608,Cotton_A_15642,Cotton_A_16517,Cotton_A_17083,Cotton_A_17423,Cotton_A_17529,Cotton_A_18188,Cotton_A_19207,Cotton_A_19398,Cotton_A_19508,Cotton_A_22074,Cotton_A_23687,Cotton_A_23795,Cotton_A_23852,Cotton_A_25709,Cotton_A_25899,Cotton_A_26510,Cotton_A_29772,Cotton_A_30062,Cotton_A_32356,Cotton_A_32557,Cotton_A_32831,Cotton_A_33722,Cotton_A_34691,Cotton_A_34885,Cotton_A_35092,Cotton_A_36065,Cotton_A_36161,Cotton_A_36854,Cotton_A_37254,Cotton_A_37365,Cotton_A_38153,Cotton_A_39763,Cotton_A_40555,Cotton_A_40836,Cotton_A_40954 APG1_LIKE_KINASE_PPC:4.1.7 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.1.7 APG1_Like_Kinase PPC:4.1.7 APG1_Like_Kinase Cotton_A_10908,Cotton_A_15660,Cotton_A_22675,Cotton_A_33556 LEUCINE_RICH_REPEAT_KINASE_II_&_X_PPC:1.12.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.12.2 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_II_&_X PPC:1.12.2 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_II_&_X Cotton_A_00824,Cotton_A_00825,Cotton_A_00828,Cotton_A_02688,Cotton_A_05954,Cotton_A_06197,Cotton_A_06226,Cotton_A_07327,Cotton_A_09204,Cotton_A_09436,Cotton_A_10870,Cotton_A_13017,Cotton_A_14083,Cotton_A_14722,Cotton_A_15508,Cotton_A_16880,Cotton_A_17525,Cotton_A_17871,Cotton_A_21943,Cotton_A_23334,Cotton_A_25002,Cotton_A_25325,Cotton_A_27351,Cotton_A_28282,Cotton_A_32848,Cotton_A_32879,Cotton_A_32881,Cotton_A_34235,Cotton_A_34236,Cotton_A_37284,Cotton_A_37883,Cotton_A_39889,Cotton_A_40160,Cotton_A_40814 CASEIN_KINASE_I_FAMILY_PPC:3.1.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:3.1.1 Casein_Kinase_I_Family PPC:3.1.1 Casein_Kinase_I_Family Cotton_A_02684,Cotton_A_03009,Cotton_A_03143,Cotton_A_05399,Cotton_A_05716,Cotton_A_07192,Cotton_A_09036,Cotton_A_09294,Cotton_A_09354,Cotton_A_10341,Cotton_A_10630,Cotton_A_10987,Cotton_A_11148,Cotton_A_11903,Cotton_A_12002,Cotton_A_14206,Cotton_A_14502,Cotton_A_18870,Cotton_A_20083,Cotton_A_20470,Cotton_A_20655,Cotton_A_22410,Cotton_A_22445,Cotton_A_28330,Cotton_A_29198,Cotton_A_31183,Cotton_A_32738,Cotton_A_33426,Cotton_A_40643 CRINKLY_4_LIKE_KINASE_PPC:1.4.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.4.1 Crinkly_4_Like_Kinase PPC:1.4.1 Crinkly_4_Like_Kinase Cotton_A_00985,Cotton_A_03984,Cotton_A_04563,Cotton_A_13844,Cotton_A_18004,Cotton_A_18006,Cotton_A_21051,Cotton_A_21159,Cotton_A_21403,Cotton_A_24038,Cotton_A_26709,Cotton_A_27702 LEUCINE_RICH_REPEAT_KINASE_III_PPC:1.13.4 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.13.4 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_III PPC:1.13.4 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_III Cotton_A_02653,Cotton_A_05253,Cotton_A_05684,Cotton_A_05685,Cotton_A_10267,Cotton_A_11861,Cotton_A_15093,Cotton_A_18894,Cotton_A_23832,Cotton_A_27838,Cotton_A_31415,Cotton_A_40975 LEUCINE_RICH_REPEAT_KINASE_IV_PPC:1.15.3 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.15.3 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_IV PPC:1.15.3 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_IV Cotton_A_00740,Cotton_A_06854,Cotton_A_10821,Cotton_A_19379,Cotton_A_40485 LEUCINE_RICH_REPEAT_KINASE_X_PPC:1.12.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.12.1 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_X PPC:1.12.1 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_X Cotton_A_00338,Cotton_A_03753,Cotton_A_15230,Cotton_A_19306,Cotton_A_19444,Cotton_A_20611,Cotton_A_39541 LRK10_LIKE_KINASE_(TYPE_1)_PPC:1.5.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.5.2 LRK10_Like_Kinase_(Type_1) PPC:1.5.2 LRK10_Like_Kinase_(Type_1) Cotton_A_17849,Cotton_A_19295,Cotton_A_25619,Cotton_A_27600,Cotton_A_30763,Cotton_A_34294 LEUCINE_RICH_REPEAT_RECEPTOR_KINASE_I_&_UNKNOWN_RECEPTOR_KINASE_I_PPC:1.3.3 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.3.3 Leucine_Rich_Repeat_Receptor_Kinase_I_&_Unknown_Receptor_Kinase_I PPC:1.3.3 Leucine_Rich_Repeat_Receptor_Kinase_I_&_Unknown_Receptor_Kinase_I Cotton_A_10765,Cotton_A_11401,Cotton_A_17925,Cotton_A_18835,Cotton_A_20795,Cotton_A_21680,Cotton_A_29617 RECEPTOR_LIKE_CYTOPLASMIC_KINASE_IX_PPC:1.14.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.14.2 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_IX PPC:1.14.2 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_IX Cotton_A_01294,Cotton_A_03596,Cotton_A_06053,Cotton_A_10268,Cotton_A_10551,Cotton_A_14025,Cotton_A_21008,Cotton_A_21454,Cotton_A_22722,Cotton_A_31416,Cotton_A_32728,Cotton_A_32730,Cotton_A_33629,Cotton_A_35272,Cotton_A_36190 UNKNOWN_FUNCTION_KINASE_PPC:4.5.7 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.5.7 Unknown_Function_Kinase PPC:4.5.7 Unknown_Function_Kinase Cotton_A_00503,Cotton_A_13909,Cotton_A_16152,Cotton_A_28660,Cotton_A_34517,Cotton_A_37797 PLANT_EXTERNAL_RESPONSE_LIKE_KINASE_PPC:1.6.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.6.2 Plant_External_Response_Like_Kinase PPC:1.6.2 Plant_External_Response_Like_Kinase Cotton_A_00217,Cotton_A_01622,Cotton_A_05433,Cotton_A_06899,Cotton_A_09434,Cotton_A_10355,Cotton_A_11160,Cotton_A_12764,Cotton_A_14509,Cotton_A_14638,Cotton_A_17027,Cotton_A_17464,Cotton_A_17881,Cotton_A_18065,Cotton_A_18659,Cotton_A_19387,Cotton_A_19587,Cotton_A_25788,Cotton_A_29238,Cotton_A_32043,Cotton_A_32564,Cotton_A_35824,Cotton_A_37082,Cotton_A_38620,Cotton_A_40117,Cotton_A_40250,Cotton_A_41081,Cotton_A_41130 UNKNOWN_FUNCTION_KINASE_PPC:2.1.6 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:2.1.6 Unknown_Function_Kinase PPC:2.1.6 Unknown_Function_Kinase Cotton_A_38509 OTHER_KINASE_PPC:5.2.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:5.2.1 Other_Kinase PPC:5.2.1 Other_Kinase Cotton_A_09402 RECEPTOR_LIKE_PROTEIN_KINASE/RECEPTOR_LECTIN_KINASE_LIKE_PROTEIN_PPC:1.3.7 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.3.7 Receptor_like_protein_kinase/Receptor_lectin_kinase_like_protein PPC:1.3.7 Receptor_like_protein_kinase/Receptor_lectin_kinase_like_protein Cotton_A_00449,Cotton_A_02889 UNKNOWN_FUNCTION_KINASE_PPC:4.4.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.4.1 Unknown_Function_Kinase PPC:4.4.1 Unknown_Function_Kinase Cotton_A_04215,Cotton_A_04668,Cotton_A_05162,Cotton_A_10495,Cotton_A_22015,Cotton_A_23536,Cotton_A_24357,Cotton_A_24551,Cotton_A_30140,Cotton_A_31082,Cotton_A_37205,Cotton_A_39444,Cotton_A_39748,Cotton_A_40460 RECEPTOR_LIKE_CYTOPLASMIC_KINASE_I_PPC:1.15.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.15.1 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_I PPC:1.15.1 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_I Cotton_A_08184,Cotton_A_10002,Cotton_A_10150,Cotton_A_11637,Cotton_A_13831,Cotton_A_24282,Cotton_A_26055,Cotton_A_30061,Cotton_A_37332 MAP3K_PPC:4.1.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.1.1 MAP3K PPC:4.1.1 MAP3K Cotton_A_00102,Cotton_A_02043,Cotton_A_04311,Cotton_A_08616,Cotton_A_08956,Cotton_A_14578,Cotton_A_16130,Cotton_A_19031,Cotton_A_19602,Cotton_A_25487,Cotton_A_25950,Cotton_A_25963,Cotton_A_27152,Cotton_A_31463,Cotton_A_35704,Cotton_A_39061,Cotton_A_39849,Cotton_A_40870 LEUCINE_RICH_REPEAT_KINASE_XI_&_XII_PPC:1.12.4 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.12.4 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_XI_&_XII PPC:1.12.4 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_XI_&_XII Cotton_A_01272,Cotton_A_01441,Cotton_A_01863,Cotton_A_01964,Cotton_A_02046,Cotton_A_02842,Cotton_A_02843,Cotton_A_02844,Cotton_A_02846,Cotton_A_02996,Cotton_A_03588,Cotton_A_03926,Cotton_A_03983,Cotton_A_04562,Cotton_A_05052,Cotton_A_05053,Cotton_A_05054,Cotton_A_05590,Cotton_A_05648,Cotton_A_05912,Cotton_A_06265,Cotton_A_06488,Cotton_A_07196,Cotton_A_07344,Cotton_A_07426,Cotton_A_07457,Cotton_A_07558,Cotton_A_07796,Cotton_A_07821,Cotton_A_08296,Cotton_A_08501,Cotton_A_08819,Cotton_A_09069,Cotton_A_09275,Cotton_A_09405,Cotton_A_09810,Cotton_A_09812,Cotton_A_09813,Cotton_A_10236,Cotton_A_10274,Cotton_A_10278,Cotton_A_10894,Cotton_A_11267,Cotton_A_11315,Cotton_A_12930,Cotton_A_13376,Cotton_A_13605,Cotton_A_14152,Cotton_A_14154,Cotton_A_14155,Cotton_A_14156,Cotton_A_14232,Cotton_A_14237,Cotton_A_14486,Cotton_A_15128,Cotton_A_15131,Cotton_A_15132,Cotton_A_15524,Cotton_A_16435,Cotton_A_16684,Cotton_A_16685,Cotton_A_16741,Cotton_A_18166,Cotton_A_18189,Cotton_A_18191,Cotton_A_18192,Cotton_A_18199,Cotton_A_18203,Cotton_A_18212,Cotton_A_18683,Cotton_A_19136,Cotton_A_19137,Cotton_A_19693,Cotton_A_20073,Cotton_A_20076,Cotton_A_20114,Cotton_A_20115,Cotton_A_20417,Cotton_A_20472,Cotton_A_20548,Cotton_A_20651,Cotton_A_20746,Cotton_A_21581,Cotton_A_21959,Cotton_A_21985,Cotton_A_22141,Cotton_A_22142,Cotton_A_22143,Cotton_A_22145,Cotton_A_22146,Cotton_A_22249,Cotton_A_22298,Cotton_A_22299,Cotton_A_22300,Cotton_A_22824,Cotton_A_22838,Cotton_A_23383,Cotton_A_23387,Cotton_A_23391,Cotton_A_23407,Cotton_A_24516,Cotton_A_25344,Cotton_A_25900,Cotton_A_26522,Cotton_A_26524,Cotton_A_26525,Cotton_A_26532,Cotton_A_26859,Cotton_A_26865,Cotton_A_27038,Cotton_A_27075,Cotton_A_27078,Cotton_A_27080,Cotton_A_27081,Cotton_A_27082,Cotton_A_27083,Cotton_A_27832,Cotton_A_27833,Cotton_A_27877,Cotton_A_27878,Cotton_A_27880,Cotton_A_28319,Cotton_A_28584,Cotton_A_28921,Cotton_A_28923,Cotton_A_28924,Cotton_A_29184,Cotton_A_30096,Cotton_A_30187,Cotton_A_30218,Cotton_A_30525,Cotton_A_30527,Cotton_A_30528,Cotton_A_31956,Cotton_A_32822,Cotton_A_33748,Cotton_A_33814,Cotton_A_33817,Cotton_A_34609,Cotton_A_34822,Cotton_A_35229,Cotton_A_35989,Cotton_A_36109,Cotton_A_36487,Cotton_A_36736,Cotton_A_37268,Cotton_A_37276,Cotton_A_38228,Cotton_A_38684,Cotton_A_39152,Cotton_A_39167,Cotton_A_39183,Cotton_A_39203,Cotton_A_39216,Cotton_A_39416,Cotton_A_39598,Cotton_A_39754,Cotton_A_40475,Cotton_A_40793,Cotton_A_40804 LEUCINE_RICH_REPEAT_KINASE_VII_PPC:1.13.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.13.1 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_VII PPC:1.13.1 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_VII Cotton_A_10754,Cotton_A_20988 S_DOMAIN_KINASE_(TYPE_2)_PPC:1.9.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.9.2 S_Domain_Kinase_(Type_2) PPC:1.9.2 S_Domain_Kinase_(Type_2) Cotton_A_00506,Cotton_A_01089,Cotton_A_01090,Cotton_A_01216,Cotton_A_01243,Cotton_A_01364,Cotton_A_01572,Cotton_A_01856,Cotton_A_04060,Cotton_A_04062,Cotton_A_06281,Cotton_A_06868,Cotton_A_06871,Cotton_A_08692,Cotton_A_08693,Cotton_A_08694,Cotton_A_08811,Cotton_A_08812,Cotton_A_08924,Cotton_A_10210,Cotton_A_11776,Cotton_A_12068,Cotton_A_12397,Cotton_A_12535,Cotton_A_13492,Cotton_A_14823,Cotton_A_14864,Cotton_A_14865,Cotton_A_16118,Cotton_A_16665,Cotton_A_17093,Cotton_A_17449,Cotton_A_17766,Cotton_A_18197,Cotton_A_18471,Cotton_A_18724,Cotton_A_18748,Cotton_A_19046,Cotton_A_19047,Cotton_A_19049,Cotton_A_19050,Cotton_A_19053,Cotton_A_19054,Cotton_A_19056,Cotton_A_19057,Cotton_A_19333,Cotton_A_19743,Cotton_A_20938,Cotton_A_21224,Cotton_A_21225,Cotton_A_22144,Cotton_A_23607,Cotton_A_24988,Cotton_A_25343,Cotton_A_25556,Cotton_A_25751,Cotton_A_26528,Cotton_A_26530,Cotton_A_26623,Cotton_A_27074,Cotton_A_28183,Cotton_A_28409,Cotton_A_29023,Cotton_A_29185,Cotton_A_30236,Cotton_A_31432,Cotton_A_31901,Cotton_A_33274,Cotton_A_35230,Cotton_A_37244,Cotton_A_37535,Cotton_A_37722,Cotton_A_37954,Cotton_A_38124,Cotton_A_38225,Cotton_A_38866,Cotton_A_38867 ANKYRIN_REPEAT_DOMAIN_KINASE_PPC:2.1.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:2.1.2 Ankyrin_Repeat_Domain_Kinase PPC:2.1.2 Ankyrin_Repeat_Domain_Kinase Cotton_A_01715,Cotton_A_04017,Cotton_A_04353,Cotton_A_06167,Cotton_A_12483,Cotton_A_20950,Cotton_A_28448,Cotton_A_29166,Cotton_A_34162,Cotton_A_35391,Cotton_A_38710,Cotton_A_39478,Cotton_A_40850 CRPK1_LIKE_KINASE_(TYPES_1_AND_2)_PPC:1.9.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.9.1 CRPK1_Like_Kinase_(Types_1_and_2) PPC:1.9.1 CRPK1_Like_Kinase_(Types_1_and_2) Cotton_A_04061,Cotton_A_11721,Cotton_A_12182,Cotton_A_12550,Cotton_A_12552,Cotton_A_12554,Cotton_A_12555,Cotton_A_12558,Cotton_A_12560,Cotton_A_12561,Cotton_A_12563,Cotton_A_12564,Cotton_A_12565,Cotton_A_12569,Cotton_A_14159,Cotton_A_14160,Cotton_A_14223,Cotton_A_16917,Cotton_A_16918,Cotton_A_17847,Cotton_A_20361,Cotton_A_20582,Cotton_A_25309,Cotton_A_26668,Cotton_A_26684,Cotton_A_27539,Cotton_A_27540,Cotton_A_27605,Cotton_A_34964,Cotton_A_34965,Cotton_A_35977,Cotton_A_38881,Cotton_A_38882 LEUCINE_RICH_REPEAT_KINASE_VII_PPC:1.12.3 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.12.3 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_VII PPC:1.12.3 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_VII Cotton_A_07077,Cotton_A_07249,Cotton_A_09938,Cotton_A_13810,Cotton_A_15603,Cotton_A_15838,Cotton_A_19980,Cotton_A_23842,Cotton_A_38306 MALE_GREM_CELL-ASSOCIATED_KINASE__PPC:4.5.1.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.5.1.1 Male_grem_cell-associated_kinase_ PPC:4.5.1.1 Male_grem_cell-associated_kinase_ Cotton_A_03795,Cotton_A_07964,Cotton_A_14275,Cotton_A_25379 WALL_ASSOCIATED_KINASE-LIKE_KINASE_PPC:1.5.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.5.1 Wall_Associated_Kinase-like_Kinase PPC:1.5.1 Wall_Associated_Kinase-like_Kinase Cotton_A_01663,Cotton_A_03787,Cotton_A_06896,Cotton_A_12062,Cotton_A_12772,Cotton_A_12773,Cotton_A_12774,Cotton_A_12777,Cotton_A_12779,Cotton_A_12781,Cotton_A_13715,Cotton_A_14078,Cotton_A_15134,Cotton_A_15140,Cotton_A_15143,Cotton_A_15661,Cotton_A_17006,Cotton_A_17344,Cotton_A_18116,Cotton_A_18201,Cotton_A_18202,Cotton_A_18210,Cotton_A_19574,Cotton_A_19579,Cotton_A_19581,Cotton_A_22212,Cotton_A_22653,Cotton_A_23928,Cotton_A_23929,Cotton_A_24545,Cotton_A_25095,Cotton_A_25728,Cotton_A_26096,Cotton_A_26097,Cotton_A_26534,Cotton_A_26535,Cotton_A_26538,Cotton_A_26541,Cotton_A_26544,Cotton_A_26545,Cotton_A_26547,Cotton_A_26550,Cotton_A_26841,Cotton_A_26844,Cotton_A_26845,Cotton_A_26848,Cotton_A_26856,Cotton_A_26861,Cotton_A_26862,Cotton_A_26866,Cotton_A_27915,Cotton_A_31150,Cotton_A_31151,Cotton_A_31154,Cotton_A_33166,Cotton_A_33167,Cotton_A_33169,Cotton_A_34835,Cotton_A_37257,Cotton_A_37258 UNKNOWN_FUNCTION_KINASE_PPC:4.5.8 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.5.8 Unknown_Function_Kinase PPC:4.5.8 Unknown_Function_Kinase Cotton_A_02736,Cotton_A_07624,Cotton_A_15851,Cotton_A_23503,Cotton_A_29534,Cotton_A_32071,Cotton_A_33424,Cotton_A_36932,Cotton_A_38243 LEUCINE_RICH_REPEAT_KINASE_III_PPC:1.13.3 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.13.3 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_III PPC:1.13.3 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_III Cotton_A_00511,Cotton_A_00787,Cotton_A_00815,Cotton_A_01978,Cotton_A_02727,Cotton_A_03099,Cotton_A_04148,Cotton_A_06573,Cotton_A_11130,Cotton_A_12184,Cotton_A_13091,Cotton_A_14496,Cotton_A_15589,Cotton_A_17755,Cotton_A_17757,Cotton_A_17867,Cotton_A_19473,Cotton_A_19956,Cotton_A_20434,Cotton_A_24172,Cotton_A_26621,Cotton_A_27496,Cotton_A_29085,Cotton_A_30899,Cotton_A_31015,Cotton_A_32261,Cotton_A_37000,Cotton_A_37697,Cotton_A_39358,Cotton_A_40040 RECEPTOR_LIKE_CYTOPLASMIC_KINASE_VI_PPC:1.10.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.10.1 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_VI PPC:1.10.1 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_VI Cotton_A_00753,Cotton_A_02967,Cotton_A_04144,Cotton_A_08259,Cotton_A_10594,Cotton_A_10850,Cotton_A_10984,Cotton_A_11421,Cotton_A_15259,Cotton_A_17827,Cotton_A_20707,Cotton_A_21287,Cotton_A_23677,Cotton_A_26707,Cotton_A_28575,Cotton_A_32112,Cotton_A_32441,Cotton_A_32915,Cotton_A_33061,Cotton_A_33177,Cotton_A_33797,Cotton_A_35294,Cotton_A_37965,Cotton_A_39612,Cotton_A_39915,Cotton_A_40118 MAP2K_PPC:4.1.4 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.1.4 MAP2K PPC:4.1.4 MAP2K Cotton_A_03119,Cotton_A_05713,Cotton_A_06675,Cotton_A_09342,Cotton_A_10314,Cotton_A_20635 S_DOMAIN_KINASE_(TYPE_1)_PPC:1.7.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.7.1 S_Domain_Kinase_(Type_1) PPC:1.7.1 S_Domain_Kinase_(Type_1) Cotton_A_05579,Cotton_A_06705,Cotton_A_08588,Cotton_A_08589,Cotton_A_08590,Cotton_A_08591,Cotton_A_08593,Cotton_A_12386,Cotton_A_12387,Cotton_A_12388,Cotton_A_12389,Cotton_A_12390,Cotton_A_13292,Cotton_A_14227,Cotton_A_14228,Cotton_A_14230,Cotton_A_14231,Cotton_A_20559,Cotton_A_22780,Cotton_A_22950,Cotton_A_23411,Cotton_A_23680,Cotton_A_24036,Cotton_A_27204,Cotton_A_27206,Cotton_A_28039,Cotton_A_28911,Cotton_A_30401,Cotton_A_30745,Cotton_A_35383,Cotton_A_35503,Cotton_A_38216,Cotton_A_38218 CALCIUM_DEPENDENT_PROTEIN_KINASE_PPC:4.2.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.2.1 Calcium_Dependent_Protein_Kinase PPC:4.2.1 Calcium_Dependent_Protein_Kinase Cotton_A_00778,Cotton_A_00840,Cotton_A_00844,Cotton_A_01345,Cotton_A_01559,Cotton_A_01782,Cotton_A_01819,Cotton_A_01837,Cotton_A_02586,Cotton_A_02803,Cotton_A_03493,Cotton_A_04013,Cotton_A_04790,Cotton_A_04955,Cotton_A_05577,Cotton_A_07814,Cotton_A_08792,Cotton_A_09202,Cotton_A_10433,Cotton_A_11040,Cotton_A_11979,Cotton_A_15383,Cotton_A_15551,Cotton_A_15775,Cotton_A_15811,Cotton_A_16634,Cotton_A_17593,Cotton_A_18224,Cotton_A_19365,Cotton_A_20526,Cotton_A_23073,Cotton_A_23177,Cotton_A_23725,Cotton_A_23914,Cotton_A_23915,Cotton_A_24177,Cotton_A_25635,Cotton_A_27334,Cotton_A_27579,Cotton_A_28267,Cotton_A_28750,Cotton_A_28981,Cotton_A_30001,Cotton_A_30437,Cotton_A_30794,Cotton_A_31216,Cotton_A_31597,Cotton_A_32301,Cotton_A_32963,Cotton_A_33112,Cotton_A_33650,Cotton_A_33971,Cotton_A_35187,Cotton_A_35525,Cotton_A_36453,Cotton_A_36826,Cotton_A_37709,Cotton_A_39947,Cotton_A_39960,Cotton_A_39976,Cotton_A_39977 RECEPTOR_LIKE_CYTOPLASMIC_KINASE_IV_PPC:1.5.3 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.5.3 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_IV PPC:1.5.3 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_IV Cotton_A_07290,Cotton_A_11474,Cotton_A_15110,Cotton_A_19639,Cotton_A_20187,Cotton_A_28899,Cotton_A_34325 MAP2K_PPC:4.1.3 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.1.3 MAP2K PPC:4.1.3 MAP2K Cotton_A_01454,Cotton_A_01455,Cotton_A_07922,Cotton_A_15069,Cotton_A_25919,Cotton_A_33385,Cotton_A_39824 PUTATIVE_PROTEIN_KINASE/PUTATIVE_RECEPTOR-LIKE_PROTEIN_KINASE_PPC:1.1.3 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.1.3 Putative_protein_kinase/Putative_receptor-like_protein_kinase PPC:1.1.3 Putative_protein_kinase/Putative_receptor-like_protein_kinase Cotton_A_02026,Cotton_A_02027,Cotton_A_02028,Cotton_A_08464,Cotton_A_12282,Cotton_A_13721,Cotton_A_16206,Cotton_A_24848,Cotton_A_26698,Cotton_A_27440,Cotton_A_32553,Cotton_A_33568,Cotton_A_34226,Cotton_A_34796,Cotton_A_37363,Cotton_A_40185 C-TERMINAL_ANKYRIN_REPEAT_DOMAIN_KINASE_PPC:2.2.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:2.2.2 C-terminal_Ankyrin_Repeat_Domain_Kinase PPC:2.2.2 C-terminal_Ankyrin_Repeat_Domain_Kinase Cotton_A_20241,Cotton_A_24488,Cotton_A_24489 RECEPTOR_LIKE_CYTOPLASMIC_KINASE_VIII_PPC:1.2.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.2.1 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_VIII PPC:1.2.1 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_VIII Cotton_A_04254,Cotton_A_08762,Cotton_A_12617,Cotton_A_14068,Cotton_A_19810,Cotton_A_22392,Cotton_A_22631,Cotton_A_23077,Cotton_A_23912,Cotton_A_26701,Cotton_A_31217,Cotton_A_33482,Cotton_A_34917,Cotton_A_37512,Cotton_A_38028 CRINKLY_4_LIKE_KINASE_PPC:1.14.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.14.1 Crinkly_4_Like_Kinase PPC:1.14.1 Crinkly_4_Like_Kinase Cotton_A_02797,Cotton_A_07651,Cotton_A_21222,Cotton_A_23640,Cotton_A_27062 RKF3_LIKE_KINASE_PPC:1.6.4 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.6.4 RKF3_Like_Kinase PPC:1.6.4 RKF3_Like_Kinase Cotton_A_00755,Cotton_A_08258,Cotton_A_10813,Cotton_A_19535,Cotton_A_19537,Cotton_A_21288,Cotton_A_21289,Cotton_A_23678,Cotton_A_33470 POSSIBLE_MAP2K_PPC:4.1.5 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.1.5 Possible_MAP2K PPC:4.1.5 Possible_MAP2K Cotton_A_34301 OTHER_PROTEIN_KINASE_PPC:1.Other GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.Other Other_Protein_Kinase PPC:1.Other Other_Protein_Kinase Cotton_A_04321,Cotton_A_05837,Cotton_A_07034,Cotton_A_11243,Cotton_A_12466,Cotton_A_13614,Cotton_A_19985,Cotton_A_26407,Cotton_A_29836,Cotton_A_37904,Cotton_A_38763,Cotton_A_39639 LEUCINE_RICH_REPEAT_KINASE_VI_PPC:1.15.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.15.2 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_VI PPC:1.15.2 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_VI Cotton_A_08056,Cotton_A_27266,Cotton_A_34347,Cotton_A_35538 LEUCINE_RICH_REPEAT_KINASE_IV_PPC:1.13.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.13.2 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_IV PPC:1.13.2 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_IV Cotton_A_01379,Cotton_A_07095,Cotton_A_09921,Cotton_A_24394,Cotton_A_37667 LEUCINE_RICH_REPEAT_KINASE_X_PPC:1.12.5 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.12.5 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_X PPC:1.12.5 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_X Cotton_A_08075,Cotton_A_24765,Cotton_A_24938 PUTATIVE_LRR_RECEPTOR-LIKE_PROTEIN_KINASE/RECEPTOR_PROTEIN_KINASE_LIKE_PROTEIN_PPC:1.9.5 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.9.5 Putative_LRR_receptor-like_protein_kinase/Receptor_protein_kinase_like_protein PPC:1.9.5 Putative_LRR_receptor-like_protein_kinase/Receptor_protein_kinase_like_protein Cotton_A_11592,Cotton_A_19920,Cotton_A_24101,Cotton_A_38327 RECEPTOR_LIKE_CYTOPLASMIC_KINASE_VII_PPC:1.2.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.2.2 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_VII PPC:1.2.2 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_VII Cotton_A_00040,Cotton_A_00041,Cotton_A_00373,Cotton_A_00429,Cotton_A_00834,Cotton_A_01746,Cotton_A_02645,Cotton_A_02955,Cotton_A_03170,Cotton_A_03534,Cotton_A_04140,Cotton_A_04292,Cotton_A_04772,Cotton_A_05445,Cotton_A_05651,Cotton_A_06062,Cotton_A_06139,Cotton_A_06833,Cotton_A_06972,Cotton_A_06973,Cotton_A_07054,Cotton_A_07183,Cotton_A_07660,Cotton_A_08521,Cotton_A_09153,Cotton_A_09155,Cotton_A_09449,Cotton_A_09450,Cotton_A_09620,Cotton_A_10290,Cotton_A_10530,Cotton_A_10555,Cotton_A_10556,Cotton_A_11020,Cotton_A_11468,Cotton_A_12044,Cotton_A_12654,Cotton_A_13169,Cotton_A_13837,Cotton_A_14285,Cotton_A_15781,Cotton_A_15945,Cotton_A_16047,Cotton_A_16573,Cotton_A_17825,Cotton_A_18184,Cotton_A_18564,Cotton_A_18667,Cotton_A_18994,Cotton_A_20602,Cotton_A_21069,Cotton_A_22056,Cotton_A_22435,Cotton_A_22919,Cotton_A_23361,Cotton_A_24057,Cotton_A_25031,Cotton_A_25163,Cotton_A_25507,Cotton_A_25649,Cotton_A_26119,Cotton_A_26375,Cotton_A_27341,Cotton_A_27834,Cotton_A_27951,Cotton_A_27952,Cotton_A_28599,Cotton_A_28652,Cotton_A_29011,Cotton_A_29841,Cotton_A_31240,Cotton_A_32807,Cotton_A_33363,Cotton_A_33447,Cotton_A_33452,Cotton_A_33649,Cotton_A_33876,Cotton_A_34190,Cotton_A_34908,Cotton_A_36011,Cotton_A_38577,Cotton_A_38689,Cotton_A_38818,Cotton_A_39385 UNKNOWN_FUNCTION_KINASE_PPC:4.5.5 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.5.5 Unknown_Function_Kinase PPC:4.5.5 Unknown_Function_Kinase Cotton_A_23255 UNKNOWN_FUNCTION_KINASE_PPC:2.2.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:2.2.1 Unknown_Function_Kinase PPC:2.2.1 Unknown_Function_Kinase Cotton_A_01212,Cotton_A_29239 PUTATIVE_PROTEIN_KINASE/SER_THR_KINASE_LIKE_PROTEIN/PUTATIVE_RECEPTOR-LIKE_PROTEIN_KINASE_PPC:1.1.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.1.2 Putative_protein_kinase/Ser_thr_kinase_like_protein/Putative_receptor-like_protein_kinase PPC:1.1.2 Putative_protein_kinase/Ser_thr_kinase_like_protein/Putative_receptor-like_protein_kinase Cotton_A_01192,Cotton_A_01193,Cotton_A_17069,Cotton_A_19197,Cotton_A_35685 LEUCINE_RICH_REPEAT_KINASE_I_PPC:1.8.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.8.1 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_I PPC:1.8.1 Leucine_Rich_Repeat_Kinase_I Cotton_A_05085,Cotton_A_05210,Cotton_A_05411,Cotton_A_12076,Cotton_A_12307,Cotton_A_17492,Cotton_A_17498,Cotton_A_25664,Cotton_A_32012,Cotton_A_32611,Cotton_A_38637 WNK_LIKE_KINASE_-_WITH_NO_LYSINE_KINASE_PPC:4.1.5.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.1.5.1 WNK_like_kinase_-_with_no_lysine_kinase PPC:4.1.5.1 WNK_like_kinase_-_with_no_lysine_kinase Cotton_A_03691,Cotton_A_04328,Cotton_A_04442,Cotton_A_06571,Cotton_A_08325,Cotton_A_09664,Cotton_A_10470,Cotton_A_13222,Cotton_A_14994,Cotton_A_15523,Cotton_A_18604,Cotton_A_19041,Cotton_A_32350,Cotton_A_38879,Cotton_A_40115 PUTATIVE_RECEPTOR_LIKE_PROTEIN_KINASE_PPC:1.9.3 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.9.3 Putative_receptor_like_protein_kinase PPC:1.9.3 Putative_receptor_like_protein_kinase Cotton_A_15347,Cotton_A_17856,Cotton_A_21032,Cotton_A_23557,Cotton_A_25615,Cotton_A_33020,Cotton_A_35147,Cotton_A_36295 ELM1/PAK1/TOS3_LIKE_KINASE_PPC:4.2.7 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.2.7 ELM1/PAK1/TOS3_Like_Kinase PPC:4.2.7 ELM1/PAK1/TOS3_Like_Kinase Cotton_A_11042,Cotton_A_11958,Cotton_A_13291 MAPK_FAMILY_PPC:4.5.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.5.1 MAPK_Family PPC:4.5.1 MAPK_Family Cotton_A_01430,Cotton_A_01592,Cotton_A_02010,Cotton_A_02201,Cotton_A_03216,Cotton_A_04377,Cotton_A_07020,Cotton_A_07028,Cotton_A_07602,Cotton_A_07852,Cotton_A_11681,Cotton_A_14752,Cotton_A_15191,Cotton_A_16520,Cotton_A_17049,Cotton_A_19078,Cotton_A_20928,Cotton_A_22570,Cotton_A_22593,Cotton_A_23784,Cotton_A_24541,Cotton_A_25334,Cotton_A_25849,Cotton_A_28389,Cotton_A_29153,Cotton_A_31255,Cotton_A_32714,Cotton_A_33211,Cotton_A_37089,Cotton_A_38714,Cotton_A_40196 OTHER_KINASE_PPC:5.1.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:5.1.1 Other_Kinase PPC:5.1.1 Other_Kinase Cotton_A_03306,Cotton_A_18587,Cotton_A_27515,Cotton_A_35215 RECEPTOR_LIKE_CYTOPLASMIC_KINASE_II_PPC:1.16.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.16.1 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_II PPC:1.16.1 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_II Cotton_A_00358,Cotton_A_02104,Cotton_A_02471,Cotton_A_08180,Cotton_A_10103,Cotton_A_12256,Cotton_A_12907,Cotton_A_19643,Cotton_A_20951,Cotton_A_29019,Cotton_A_30036,Cotton_A_31561 LIGHT_SENSOR_KINASE_PPC:2.1.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:2.1.1 Light_Sensor_Kinase PPC:2.1.1 Light_Sensor_Kinase Cotton_A_14378,Cotton_A_37145 SER_THR_PROTEIN_KINASE_LIKE_PROTEIN_PPC:1.2.5 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.2.5 ser_thr_protein_kinase_like_protein PPC:1.2.5 ser_thr_protein_kinase_like_protein Cotton_A_11314 GMPK6/ATMRK1_FAMILY_PPC:2.1.4 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:2.1.4 GmPK6/AtMRK1_Family PPC:2.1.4 GmPK6/AtMRK1_Family Cotton_A_00254,Cotton_A_01101,Cotton_A_01481,Cotton_A_01519,Cotton_A_03905,Cotton_A_05074,Cotton_A_08199,Cotton_A_08349,Cotton_A_08382,Cotton_A_08386,Cotton_A_08479,Cotton_A_08871,Cotton_A_10376,Cotton_A_11345,Cotton_A_11502,Cotton_A_12717,Cotton_A_12734,Cotton_A_14038,Cotton_A_16502,Cotton_A_16898,Cotton_A_16981,Cotton_A_17685,Cotton_A_20623,Cotton_A_21757,Cotton_A_22016,Cotton_A_22156,Cotton_A_23440,Cotton_A_24542,Cotton_A_28171,Cotton_A_28872,Cotton_A_29705,Cotton_A_30308,Cotton_A_31042,Cotton_A_36512,Cotton_A_40064,Cotton_A_40735,Cotton_A_40739,Cotton_A_40881 UNKNOWN_FUNCTION_KINASE_PPC:4.3.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.3.2 Unknown_Function_Kinase PPC:4.3.2 Unknown_Function_Kinase Cotton_A_12675,Cotton_A_28665 LEUCINE_RICH_REPEAT_RECEPTOR_VIII_PPC:1.3.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.3.2 Leucine_Rich_Repeat_Receptor_VIII PPC:1.3.2 Leucine_Rich_Repeat_Receptor_VIII Cotton_A_01529,Cotton_A_04304,Cotton_A_10476,Cotton_A_11332,Cotton_A_19959,Cotton_A_22161,Cotton_A_25918,Cotton_A_36293,Cotton_A_37296 LEUCINE-RICH_TRANSMEMBRANE_PROTEIN_KINASE/STRUBBELIG_RECEPTOR_FAMILY_1_PPC:1.1.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.1.1 Leucine-rich_transmembrane_protein_kinase/Strubbelig_Receptor_Family_1 PPC:1.1.1 Leucine-rich_transmembrane_protein_kinase/Strubbelig_Receptor_Family_1 Cotton_A_03868,Cotton_A_07774,Cotton_A_08467,Cotton_A_08573,Cotton_A_15099,Cotton_A_17971,Cotton_A_18965,Cotton_A_23192,Cotton_A_26639,Cotton_A_26883,Cotton_A_29459,Cotton_A_38440 OTHER_KINASE_PPC:5.1.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:5.1.2 Other_Kinase PPC:5.1.2 Other_Kinase Cotton_A_02362,Cotton_A_17375,Cotton_A_40139,Cotton_A_40140 RECEPTOR_LIKE_CYTOPLASMIC_KINASE_V_PPC:1.6.3 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.6.3 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_V PPC:1.6.3 Receptor_Like_Cytoplasmic_Kinase_V Cotton_A_00743,Cotton_A_05018,Cotton_A_08668,Cotton_A_08763,Cotton_A_09636,Cotton_A_10817,Cotton_A_14785,Cotton_A_15120,Cotton_A_16656,Cotton_A_20926,Cotton_A_24351,Cotton_A_29869,Cotton_A_30393,Cotton_A_33213,Cotton_A_38360 UNKNOWN_FUNCTION_KINASE_PPC:4.1.6 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.1.6 Unknown_Function_Kinase PPC:4.1.6 Unknown_Function_Kinase Cotton_A_02624,Cotton_A_07798,Cotton_A_11088,Cotton_A_12010,Cotton_A_12869,Cotton_A_14978,Cotton_A_15339,Cotton_A_16984,Cotton_A_22020,Cotton_A_30266,Cotton_A_35259 CALCIUM/CALMODULIN_DEPENDENT_PROTEIN_KINASE__PPC:4.2.3 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.2.3 Calcium/Calmodulin_Dependent_Protein_Kinase_ PPC:4.2.3 Calcium/Calmodulin_Dependent_Protein_Kinase_ Cotton_A_27269 CTR1/EDR1_KINASE_PPC:2.1.3 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:2.1.3 CTR1/EDR1_Kinase PPC:2.1.3 CTR1/EDR1_Kinase Cotton_A_01431,Cotton_A_02771,Cotton_A_05616,Cotton_A_08720,Cotton_A_08722,Cotton_A_10571,Cotton_A_11613,Cotton_A_13447,Cotton_A_14004,Cotton_A_15004,Cotton_A_16533,Cotton_A_16862,Cotton_A_19487,Cotton_A_27246,Cotton_A_29627,Cotton_A_32684,Cotton_A_34840,Cotton_A_37624,Cotton_A_38492,Cotton_A_40060 LEGUME_LECTIN_DOMAIN_KINASE_PPC:1.11.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.11.1 Legume_Lectin_Domain_Kinase PPC:1.11.1 Legume_Lectin_Domain_Kinase Cotton_A_00381,Cotton_A_01223,Cotton_A_02127,Cotton_A_03470,Cotton_A_03598,Cotton_A_03903,Cotton_A_05559,Cotton_A_06412,Cotton_A_06413,Cotton_A_06416,Cotton_A_06417,Cotton_A_06418,Cotton_A_06437,Cotton_A_06517,Cotton_A_06658,Cotton_A_06659,Cotton_A_06661,Cotton_A_06662,Cotton_A_06663,Cotton_A_06664,Cotton_A_07758,Cotton_A_10959,Cotton_A_12059,Cotton_A_12232,Cotton_A_12887,Cotton_A_12888,Cotton_A_13584,Cotton_A_14915,Cotton_A_17201,Cotton_A_17203,Cotton_A_17205,Cotton_A_17208,Cotton_A_18168,Cotton_A_18169,Cotton_A_18171,Cotton_A_19164,Cotton_A_19165,Cotton_A_19173,Cotton_A_20039,Cotton_A_20341,Cotton_A_22327,Cotton_A_22328,Cotton_A_22606,Cotton_A_22607,Cotton_A_22609,Cotton_A_22611,Cotton_A_22895,Cotton_A_22896,Cotton_A_22897,Cotton_A_22898,Cotton_A_26384,Cotton_A_27344,Cotton_A_29896,Cotton_A_30877,Cotton_A_30917,Cotton_A_34613,Cotton_A_35345,Cotton_A_35509,Cotton_A_36106,Cotton_A_36107,Cotton_A_36108,Cotton_A_36434,Cotton_A_36964,Cotton_A_39625,Cotton_A_39986,Cotton_A_40642,Cotton_A_40958,Cotton_A_41008 RECEPTOR-LIKE_PROTEIN_KINASE_PPC:1.3.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:1.3.1 Receptor-like_protein_kinase PPC:1.3.1 Receptor-like_protein_kinase Cotton_A_00717,Cotton_A_00925,Cotton_A_01289,Cotton_A_02225,Cotton_A_03059,Cotton_A_05180,Cotton_A_06333,Cotton_A_08717,Cotton_A_09283,Cotton_A_11591,Cotton_A_11743,Cotton_A_12306,Cotton_A_12315,Cotton_A_12326,Cotton_A_12327,Cotton_A_12328,Cotton_A_12330,Cotton_A_12331,Cotton_A_12332,Cotton_A_12333,Cotton_A_12460,Cotton_A_12492,Cotton_A_13385,Cotton_A_13655,Cotton_A_13658,Cotton_A_15047,Cotton_A_15906,Cotton_A_19085,Cotton_A_19735,Cotton_A_19953,Cotton_A_21317,Cotton_A_23558,Cotton_A_23559,Cotton_A_24662,Cotton_A_26110,Cotton_A_27637,Cotton_A_27639,Cotton_A_27640,Cotton_A_28124,Cotton_A_28482,Cotton_A_28487,Cotton_A_29855,Cotton_A_29930,Cotton_A_29931,Cotton_A_29935,Cotton_A_30202,Cotton_A_31671,Cotton_A_31673,Cotton_A_31674,Cotton_A_32789,Cotton_A_32790,Cotton_A_32792,Cotton_A_33235,Cotton_A_33237,Cotton_A_33921,Cotton_A_36998,Cotton_A_37105,Cotton_A_37106,Cotton_A_37182,Cotton_A_37187,Cotton_A_37478,Cotton_A_37479,Cotton_A_37480,Cotton_A_39452,Cotton_A_39814,Cotton_A_41114 CDC2_LIKE_KINASE_FAMILY_PPC:4.5.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.5.2 CDC2_Like_Kinase_Family PPC:4.5.2 CDC2_Like_Kinase_Family Cotton_A_01035,Cotton_A_03349,Cotton_A_03656,Cotton_A_04571,Cotton_A_05825,Cotton_A_06752,Cotton_A_08058,Cotton_A_08146,Cotton_A_09145,Cotton_A_09643,Cotton_A_09698,Cotton_A_10347,Cotton_A_11170,Cotton_A_12692,Cotton_A_13019,Cotton_A_13038,Cotton_A_13039,Cotton_A_13775,Cotton_A_14138,Cotton_A_14916,Cotton_A_15017,Cotton_A_16222,Cotton_A_16793,Cotton_A_16858,Cotton_A_17243,Cotton_A_17722,Cotton_A_18677,Cotton_A_19907,Cotton_A_21160,Cotton_A_21161,Cotton_A_22071,Cotton_A_22416,Cotton_A_26291,Cotton_A_27238,Cotton_A_27620,Cotton_A_28167,Cotton_A_33907,Cotton_A_34072,Cotton_A_36218,Cotton_A_37358,Cotton_A_38167,Cotton_A_38168,Cotton_A_38948,Cotton_A_39920 UNKNOWN_FUNCTION_KINASE_PPC:4.3.1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.3.1 Unknown_Function_Kinase PPC:4.3.1 Unknown_Function_Kinase Cotton_A_23314 ATN1_LIKE_FAMILY_PPC:2.1.5 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:2.1.5 ATN1_Like_Family PPC:2.1.5 ATN1_Like_Family Cotton_A_04325,Cotton_A_08426,Cotton_A_11560,Cotton_A_12470,Cotton_A_28474,Cotton_A_32204,Cotton_A_35636 LAMMER_KINASE_FAMILY_PPC:4.5.6 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.5.6 LAMMER_Kinase_Family PPC:4.5.6 LAMMER_Kinase_Family Cotton_A_01276,Cotton_A_18611,Cotton_A_24263,Cotton_A_34580,Cotton_A_35873 PHOSPHOENOLPYRUVATE_CARBOXYLASE_KINASE_PPC:4.2.2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.2.2 Phosphoenolpyruvate_Carboxylase_Kinase PPC:4.2.2 Phosphoenolpyruvate_Carboxylase_Kinase Cotton_A_09302,Cotton_A_12836,Cotton_A_33161 GSK3/SHAGGY_LIKE_PROTEIN_KINASE_FAMILY_PPC:4.5.4 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PPC:4.5.4 GSK3/Shaggy_Like_Protein_Kinase_Family PPC:4.5.4 GSK3/Shaggy_Like_Protein_Kinase_Family Cotton_A_04045,Cotton_A_05020,Cotton_A_10648,Cotton_A_15596,Cotton_A_16125,Cotton_A_17728,Cotton_A_18464,Cotton_A_22644,Cotton_A_23002,Cotton_A_27014,Cotton_A_29514,Cotton_A_30064,Cotton_A_30067,Cotton_A_32340,Cotton_A_35447 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH2 Glycoside_Hydrolases GH2 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_15619,Cotton_A_31468,Cotton_A_27928 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT28 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT28 GlycosylTransferases GT28 GlycosylTransferases Cotton_A_02753,Cotton_A_34355,Cotton_A_19223,Cotton_A_03053,Cotton_A_11479,Cotton_A_40949 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH29 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH29 Glycoside_Hydrolases GH29 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_05150,Cotton_A_01366 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT58 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT58 GlycosylTransferases GT58 GlycosylTransferases Cotton_A_18841,Cotton_A_26871,Cotton_A_32906,Cotton_A_17231,Cotton_A_30713,Cotton_A_12783,Cotton_A_22941,Cotton_A_26018,Cotton_A_30864 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH20 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH20 Glycoside_Hydrolases GH20 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_15917,Cotton_A_21495,Cotton_A_29070,Cotton_A_33993 POLYSACCHARIDE_LYASES_PL4 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PL4 Polysaccharide_Lyases PL4 Polysaccharide_Lyases Cotton_A_24828,Cotton_A_24829,Cotton_A_26702,Cotton_A_39395,Cotton_A_06658,Cotton_A_19495,Cotton_A_19496,Cotton_A_40464,Cotton_A_28501,Cotton_A_34871 CARBOHYDRATE-BINDING_MODULES_CBM43 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CBM43 Carbohydrate-Binding_Modules CBM43 Carbohydrate-Binding_Modules Cotton_A_23702,Cotton_A_31744,Cotton_A_31351,Cotton_A_33116,Cotton_A_18717,Cotton_A_24014,Cotton_A_30418,Cotton_A_32154,Cotton_A_32669,Cotton_A_05297,Cotton_A_29875,Cotton_A_18160,Cotton_A_25324,Cotton_A_29479,Cotton_A_32888,Cotton_A_12369,Cotton_A_25010,Cotton_A_29760,Cotton_A_17557,Cotton_A_33641,Cotton_A_41202,Cotton_A_06187,Cotton_A_13350,Cotton_A_14786,Cotton_A_17706,Cotton_A_22633 CARBOHYDRATE_ESTERASES_CE6 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CE6 Carbohydrate_Esterases CE6 Carbohydrate_Esterases Cotton_A_14867,Cotton_A_14868,Cotton_A_00175,Cotton_A_08690,Cotton_A_16662 CARBOHYDRATE-BINDING_MODULES_CBM53 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CBM53 Carbohydrate-Binding_Modules CBM53 Carbohydrate-Binding_Modules Cotton_A_04683,Cotton_A_25631 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. 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Cold Spring Harbor Laboratory NA GH3 Glycoside_Hydrolases GH3 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_01711,Cotton_A_10558,Cotton_A_20020,Cotton_A_35620,Cotton_A_35624,Cotton_A_35625,Cotton_A_27349,Cotton_A_20502,Cotton_A_23618,Cotton_A_26364,Cotton_A_06389,Cotton_A_06390,Cotton_A_06391,Cotton_A_25474,Cotton_A_28280,Cotton_A_09520,Cotton_A_31360,Cotton_A_31361,Cotton_A_11069,Cotton_A_27571,Cotton_A_27197,Cotton_A_37020,Cotton_A_12919,Cotton_A_19988,Cotton_A_35112,Cotton_A_33188 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH5 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH5 Glycoside_Hydrolases GH5 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_07864,Cotton_A_35279,Cotton_A_39199,Cotton_A_18001,Cotton_A_32161,Cotton_A_14085,Cotton_A_14086,Cotton_A_18643,Cotton_A_26248,Cotton_A_14662,Cotton_A_23236,Cotton_A_39171,Cotton_A_21820,Cotton_A_38164,Cotton_A_40764 CARBOHYDRATE-BINDING_MODULES_CBM50 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CBM50 Carbohydrate-Binding_Modules CBM50 Carbohydrate-Binding_Modules Cotton_A_27440,Cotton_A_40185 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT90 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT90 GlycosylTransferases GT90 GlycosylTransferases Cotton_A_21470,Cotton_A_21471,Cotton_A_21472,Cotton_A_14466,Cotton_A_31994,Cotton_A_37539,Cotton_A_29505,Cotton_A_01307 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT75 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT75 GlycosylTransferases GT75 GlycosylTransferases Cotton_A_30108,Cotton_A_19130,Cotton_A_27635,Cotton_A_30662,Cotton_A_31977,Cotton_A_12497,Cotton_A_17250,Cotton_A_40980,Cotton_A_38053,Cotton_A_22302,Cotton_A_40714 CARBOHYDRATE_ESTERASES_CE13 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CE13 Carbohydrate_Esterases CE13 Carbohydrate_Esterases Cotton_A_00370,Cotton_A_26245,Cotton_A_23243,Cotton_A_23273,Cotton_A_30198,Cotton_A_35027,Cotton_A_13022,Cotton_A_13025,Cotton_A_01302 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH28 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH28 Glycoside_Hydrolases GH28 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_02416,Cotton_A_07792,Cotton_A_07816,Cotton_A_09632,Cotton_A_13106,Cotton_A_16558,Cotton_A_16563,Cotton_A_16564,Cotton_A_18051,Cotton_A_22106,Cotton_A_25025,Cotton_A_25029,Cotton_A_25949,Cotton_A_09419,Cotton_A_17434,Cotton_A_28301,Cotton_A_40192,Cotton_A_35850,Cotton_A_39026,Cotton_A_39027,Cotton_A_39028,Cotton_A_08747,Cotton_A_23810,Cotton_A_23811,Cotton_A_37699,Cotton_A_37700,Cotton_A_05682,Cotton_A_11530,Cotton_A_25821,Cotton_A_30502,Cotton_A_30503,Cotton_A_33210,Cotton_A_36798,Cotton_A_38629,Cotton_A_38630,Cotton_A_38631,Cotton_A_38969,Cotton_A_38970,Cotton_A_38971,Cotton_A_03422,Cotton_A_05189,Cotton_A_05204,Cotton_A_18656,Cotton_A_03688,Cotton_A_06630,Cotton_A_23228,Cotton_A_38956,Cotton_A_04841,Cotton_A_11680,Cotton_A_15118,Cotton_A_26694,Cotton_A_36157,Cotton_A_15765,Cotton_A_15766,Cotton_A_20514,Cotton_A_20515,Cotton_A_20516,Cotton_A_20517,Cotton_A_21873,Cotton_A_24243,Cotton_A_24244,Cotton_A_26801,Cotton_A_26802,Cotton_A_26803,Cotton_A_40887,Cotton_A_33666,Cotton_A_36924,Cotton_A_39590,Cotton_A_06829,Cotton_A_23021,Cotton_A_23022,Cotton_A_27180,Cotton_A_27469,Cotton_A_32262,Cotton_A_37778,Cotton_A_11788,Cotton_A_11789,Cotton_A_19882,Cotton_A_19891,Cotton_A_27839,Cotton_A_01285,Cotton_A_15771,Cotton_A_22619,Cotton_A_22645,Cotton_A_40875,Cotton_A_39937,Cotton_A_39938,Cotton_A_40763,Cotton_A_38807 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH116 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH116 Glycoside_Hydrolases GH116 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_07362,Cotton_A_36079,Cotton_A_38930,Cotton_A_37834,Cotton_A_03340,Cotton_A_17721 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH31 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH31 Glycoside_Hydrolases GH31 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_05172,Cotton_A_05481,Cotton_A_09499,Cotton_A_24754,Cotton_A_20544,Cotton_A_32743,Cotton_A_15043,Cotton_A_06126 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT24 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT24 GlycosylTransferases GT24 GlycosylTransferases Cotton_A_32635,Cotton_A_10810 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH33 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH33 Glycoside_Hydrolases GH33 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_16284,Cotton_A_39792 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT37 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT37 GlycosylTransferases GT37 GlycosylTransferases Cotton_A_02698,Cotton_A_35385 CARBOHYDRATE-BINDING_MODULES_CBM57 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CBM57 Carbohydrate-Binding_Modules CBM57 Carbohydrate-Binding_Modules Cotton_A_17673,Cotton_A_20559,Cotton_A_35503,Cotton_A_35507,Cotton_A_14227,Cotton_A_14228,Cotton_A_14230,Cotton_A_12386,Cotton_A_12388,Cotton_A_12389,Cotton_A_03918,Cotton_A_27206 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH79 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH79 Glycoside_Hydrolases GH79 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_09647,Cotton_A_20556,Cotton_A_07302,Cotton_A_15879,Cotton_A_23382,Cotton_A_25112,Cotton_A_36404,Cotton_A_27533,Cotton_A_11934,Cotton_A_11935,Cotton_A_13370,Cotton_A_41309 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH77 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH77 Glycoside_Hydrolases GH77 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_11251 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT41 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT41 GlycosylTransferases GT41 GlycosylTransferases Cotton_A_10169,Cotton_A_36485,Cotton_A_05465,Cotton_A_12817,Cotton_A_24443 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT77 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT77 GlycosylTransferases GT77 GlycosylTransferases Cotton_A_27372,Cotton_A_25525,Cotton_A_38322,Cotton_A_06401,Cotton_A_14360,Cotton_A_06872,Cotton_A_14258,Cotton_A_22922,Cotton_A_27490,Cotton_A_27493,Cotton_A_34441,Cotton_A_13568,Cotton_A_20231,Cotton_A_27713 POLYSACCHARIDE_LYASES_PL1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA PL1 Polysaccharide_Lyases PL1 Polysaccharide_Lyases Cotton_A_02442,Cotton_A_07347,Cotton_A_18370,Cotton_A_25033,Cotton_A_25034,Cotton_A_28210,Cotton_A_29975,Cotton_A_13840,Cotton_A_13841,Cotton_A_13842,Cotton_A_13843,Cotton_A_29466,Cotton_A_30326,Cotton_A_00482,Cotton_A_30372,Cotton_A_39526,Cotton_A_20836,Cotton_A_36111,Cotton_A_11573,Cotton_A_18621,Cotton_A_25832,Cotton_A_41055,Cotton_A_08462,Cotton_A_08506,Cotton_A_20603,Cotton_A_30522,Cotton_A_11769,Cotton_A_15159,Cotton_A_20116,Cotton_A_24761,Cotton_A_24780,Cotton_A_36249,Cotton_A_19029,Cotton_A_28111,Cotton_A_31594,Cotton_A_36925,Cotton_A_38837,Cotton_A_38838,Cotton_A_38839,Cotton_A_05153,Cotton_A_02966,Cotton_A_07470,Cotton_A_18828,Cotton_A_35293,Cotton_A_08069,Cotton_A_17759,Cotton_A_17760,Cotton_A_30120 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH32 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH32 Glycoside_Hydrolases GH32 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_16609,Cotton_A_16610,Cotton_A_21611,Cotton_A_21612,Cotton_A_36875,Cotton_A_36877,Cotton_A_36878,Cotton_A_10174,Cotton_A_39532,Cotton_A_18925,Cotton_A_18926,Cotton_A_23891,Cotton_A_09030,Cotton_A_18423,Cotton_A_07120,Cotton_A_13591,Cotton_A_41210 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH13 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH13 Glycoside_Hydrolases GH13 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_18221,Cotton_A_28679,Cotton_A_08645,Cotton_A_17329,Cotton_A_20735 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH14 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH14 Glycoside_Hydrolases GH14 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_16585,Cotton_A_16586,Cotton_A_33072,Cotton_A_08945,Cotton_A_29559,Cotton_A_34134,Cotton_A_34070,Cotton_A_03434,Cotton_A_19138,Cotton_A_21458,Cotton_A_21459,Cotton_A_09154,Cotton_A_09156,Cotton_A_06792,Cotton_A_07184,Cotton_A_13575,Cotton_A_28490 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH63 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH63 Glycoside_Hydrolases GH63 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_24916 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT10 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT10 GlycosylTransferases GT10 GlycosylTransferases Cotton_A_29622,Cotton_A_00186,Cotton_A_33057,Cotton_A_39353,Cotton_A_10772 CARBOHYDRATE-BINDING_MODULES_CBM18 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CBM18 Carbohydrate-Binding_Modules CBM18 Carbohydrate-Binding_Modules Cotton_A_19778,Cotton_A_19779,Cotton_A_19781,Cotton_A_19782,Cotton_A_36865,Cotton_A_36866,Cotton_A_00596,Cotton_A_00597,Cotton_A_00598,Cotton_A_00599,Cotton_A_00600,Cotton_A_00601,Cotton_A_22147,Cotton_A_22148,Cotton_A_28377,Cotton_A_12858,Cotton_A_12859,Cotton_A_12860,Cotton_A_16368,Cotton_A_16371,Cotton_A_16372,Cotton_A_16373,Cotton_A_35181 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH16 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH16 Glycoside_Hydrolases GH16 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_02860,Cotton_A_16900,Cotton_A_16901,Cotton_A_18873,Cotton_A_27431,Cotton_A_16721,Cotton_A_08939,Cotton_A_25279,Cotton_A_33572,Cotton_A_39858,Cotton_A_25413,Cotton_A_35786,Cotton_A_03813,Cotton_A_05521,Cotton_A_09480,Cotton_A_10939,Cotton_A_31303,Cotton_A_35002,Cotton_A_04223,Cotton_A_38736,Cotton_A_19764,Cotton_A_21850,Cotton_A_11057,Cotton_A_12376,Cotton_A_20823,Cotton_A_29676,Cotton_A_38016,Cotton_A_39188,Cotton_A_05091,Cotton_A_05092,Cotton_A_05152,Cotton_A_06765,Cotton_A_06766,Cotton_A_06767,Cotton_A_06771,Cotton_A_09738,Cotton_A_09804,Cotton_A_35994,Cotton_A_03972,Cotton_A_24430,Cotton_A_07936,Cotton_A_10837,Cotton_A_40659 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH43 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH43 Glycoside_Hydrolases GH43 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_36335,Cotton_A_09773,Cotton_A_22187 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT48 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT48 GlycosylTransferases GT48 GlycosylTransferases Cotton_A_38155,Cotton_A_08328,Cotton_A_08330,Cotton_A_08333,Cotton_A_17997,Cotton_A_33479,Cotton_A_18722,Cotton_A_14920,Cotton_A_14921,Cotton_A_14922,Cotton_A_29867,Cotton_A_11765,Cotton_A_40135,Cotton_A_21819,Cotton_A_11349,Cotton_A_12004,Cotton_A_16163,Cotton_A_36273,Cotton_A_36276,Cotton_A_34968 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH51 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH51 Glycoside_Hydrolases GH51 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_22880 AUXILIARY_ACTIVITIES_AA1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA AA1 Auxiliary_Activities AA1 Auxiliary_Activities Cotton_A_11229,Cotton_A_21049,Cotton_A_41171 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT35 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT35 GlycosylTransferases GT35 GlycosylTransferases Cotton_A_14707,Cotton_A_20022,Cotton_A_29497,Cotton_A_11319 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT17 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT17 GlycosylTransferases GT17 GlycosylTransferases Cotton_A_35638,Cotton_A_39378,Cotton_A_03531,Cotton_A_08424,Cotton_A_30133,Cotton_A_41227 CARBOHYDRATE-BINDING_MODULES_CBM45 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CBM45 Carbohydrate-Binding_Modules CBM45 Carbohydrate-Binding_Modules Cotton_A_37763,Cotton_A_15507,Cotton_A_19493,Cotton_A_06133,Cotton_A_35611,Cotton_A_35612,Cotton_A_39080,Cotton_A_39081 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT2 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT2 GlycosylTransferases GT2 GlycosylTransferases Cotton_A_07355,Cotton_A_08148,Cotton_A_08149,Cotton_A_08150,Cotton_A_24727,Cotton_A_29274,Cotton_A_38984,Cotton_A_02861,Cotton_A_25259,Cotton_A_35065,Cotton_A_35866,Cotton_A_40717,Cotton_A_00513,Cotton_A_25726,Cotton_A_28830,Cotton_A_36448,Cotton_A_31378,Cotton_A_31385,Cotton_A_34416,Cotton_A_36087,Cotton_A_03538,Cotton_A_05922,Cotton_A_19222,Cotton_A_28019,Cotton_A_39235,Cotton_A_16254,Cotton_A_16256,Cotton_A_16257,Cotton_A_01135,Cotton_A_12288,Cotton_A_30466,Cotton_A_32285,Cotton_A_34909,Cotton_A_37032,Cotton_A_37399,Cotton_A_37400,Cotton_A_39745,Cotton_A_06507,Cotton_A_06509,Cotton_A_21658,Cotton_A_12808,Cotton_A_22379,Cotton_A_23378,Cotton_A_24241,Cotton_A_30690,Cotton_A_30691,Cotton_A_30692,Cotton_A_30693,Cotton_A_12403,Cotton_A_12404,Cotton_A_12405,Cotton_A_16675,Cotton_A_26388,Cotton_A_27535,Cotton_A_27808,Cotton_A_33937,Cotton_A_03224,Cotton_A_03315,Cotton_A_03319,Cotton_A_05735,Cotton_A_12985,Cotton_A_17521,Cotton_A_33685,Cotton_A_07935,Cotton_A_13232,Cotton_A_20715,Cotton_A_40681,Cotton_A_32951,Cotton_A_38600 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH9 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH9 Glycoside_Hydrolases GH9 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_16416,Cotton_A_38560,Cotton_A_36621,Cotton_A_08957,Cotton_A_03572,Cotton_A_34799,Cotton_A_18265,Cotton_A_12275,Cotton_A_19350,Cotton_A_23286,Cotton_A_31517,Cotton_A_37496,Cotton_A_04823,Cotton_A_28456,Cotton_A_31237,Cotton_A_37714,Cotton_A_19759,Cotton_A_04020,Cotton_A_32722,Cotton_A_35311,Cotton_A_11874,Cotton_A_20906,Cotton_A_32270,Cotton_A_40251,Cotton_A_07532,Cotton_A_13253,Cotton_A_20724,Cotton_A_27221 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH100 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH100 Glycoside_Hydrolases GH100 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_01846,Cotton_A_29971,Cotton_A_00659,Cotton_A_15959,Cotton_A_10652,Cotton_A_14415,Cotton_A_27990,Cotton_A_21885,Cotton_A_23261,Cotton_A_24303,Cotton_A_33053,Cotton_A_04001,Cotton_A_26016,Cotton_A_31813,Cotton_A_26730 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH95 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH95 Glycoside_Hydrolases GH95 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_10738,Cotton_A_10739 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT5 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT5 GlycosylTransferases GT5 GlycosylTransferases Cotton_A_08092,Cotton_A_08125,Cotton_A_22105,Cotton_A_29910,Cotton_A_34955,Cotton_A_05932,Cotton_A_05299,Cotton_A_20346,Cotton_A_17559,Cotton_A_13194 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT61 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT61 GlycosylTransferases GT61 GlycosylTransferases Cotton_A_07833,Cotton_A_27615,Cotton_A_27616,Cotton_A_27618,Cotton_A_27619,Cotton_A_41217,Cotton_A_04819,Cotton_A_06581,Cotton_A_28443,Cotton_A_26653,Cotton_A_12106,Cotton_A_01418 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT66 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT66 GlycosylTransferases GT66 GlycosylTransferases Cotton_A_18855,Cotton_A_15126,Cotton_A_03118,Cotton_A_20512 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT21 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT21 GlycosylTransferases GT21 GlycosylTransferases Cotton_A_09406,Cotton_A_18107 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT34 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT34 GlycosylTransferases GT34 GlycosylTransferases Cotton_A_22759,Cotton_A_23305,Cotton_A_04860,Cotton_A_38949,Cotton_A_09782,Cotton_A_28540,Cotton_A_28541,Cotton_A_13387,Cotton_A_37431,Cotton_A_37433 CARBOHYDRATE-BINDING_MODULES_CBM20 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CBM20 Carbohydrate-Binding_Modules CBM20 Carbohydrate-Binding_Modules Cotton_A_02491,Cotton_A_07415,Cotton_A_33261,Cotton_A_05581,Cotton_A_23060 CARBOHYDRATE_ESTERASES_CEnc GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CEnc Carbohydrate_Esterases CEnc Carbohydrate_Esterases Cotton_A_15362 GLYCOSYLTRANSFERASES_GTnc GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GTnc GlycosylTransferases GTnc GlycosylTransferases Cotton_A_01778,Cotton_A_02324,Cotton_A_07827,Cotton_A_07828,Cotton_A_16597,Cotton_A_17666,Cotton_A_28731,Cotton_A_30956,Cotton_A_37232,Cotton_A_39125,Cotton_A_02768,Cotton_A_02818,Cotton_A_10516,Cotton_A_15625,Cotton_A_16400,Cotton_A_22236,Cotton_A_27258,Cotton_A_29463,Cotton_A_35814,Cotton_A_36174,Cotton_A_38869,Cotton_A_40346,Cotton_A_15363,Cotton_A_21747,Cotton_A_23346,Cotton_A_26717,Cotton_A_31545,Cotton_A_31565,Cotton_A_36896,Cotton_A_00593,Cotton_A_08797,Cotton_A_25298,Cotton_A_27096,Cotton_A_37570,Cotton_A_11541,Cotton_A_11562,Cotton_A_12179,Cotton_A_12180,Cotton_A_19188,Cotton_A_19917,Cotton_A_23633,Cotton_A_24021,Cotton_A_25824,Cotton_A_26965,Cotton_A_27316,Cotton_A_28164,Cotton_A_28593,Cotton_A_30424,Cotton_A_31706,Cotton_A_39857,Cotton_A_08420,Cotton_A_08861,Cotton_A_16014,Cotton_A_18217,Cotton_A_18647,Cotton_A_18673,Cotton_A_20396,Cotton_A_24932,Cotton_A_24933,Cotton_A_30830,Cotton_A_01108,Cotton_A_03758,Cotton_A_09423,Cotton_A_12502,Cotton_A_14359,Cotton_A_19131,Cotton_A_24573,Cotton_A_25172,Cotton_A_31355,Cotton_A_33790,Cotton_A_04257,Cotton_A_04258,Cotton_A_04976,Cotton_A_04988,Cotton_A_06285,Cotton_A_06891,Cotton_A_12655,Cotton_A_12775,Cotton_A_16072,Cotton_A_28449,Cotton_A_29645,Cotton_A_36383,Cotton_A_39749,Cotton_A_01017,Cotton_A_03164,Cotton_A_09083,Cotton_A_09118,Cotton_A_09132,Cotton_A_16794,Cotton_A_30687,Cotton_A_33835,Cotton_A_33836,Cotton_A_33837,Cotton_A_37242,Cotton_A_38460,Cotton_A_04659,Cotton_A_07068,Cotton_A_07069,Cotton_A_11025,Cotton_A_11081,Cotton_A_11346,Cotton_A_12408,Cotton_A_15075,Cotton_A_16123,Cotton_A_16677,Cotton_A_19481,Cotton_A_25570,Cotton_A_30943,Cotton_A_33201,Cotton_A_34710,Cotton_A_34711,Cotton_A_35149,Cotton_A_35305,Cotton_A_37632,Cotton_A_03307,Cotton_A_05140,Cotton_A_11987,Cotton_A_13007,Cotton_A_18395,Cotton_A_20067,Cotton_A_22923,Cotton_A_22924,Cotton_A_26613,Cotton_A_02947,Cotton_A_02950,Cotton_A_03865,Cotton_A_10435,Cotton_A_16183,Cotton_A_17488,Cotton_A_17526,Cotton_A_24504,Cotton_A_01906,Cotton_A_06144,Cotton_A_06166,Cotton_A_07139,Cotton_A_15248,Cotton_A_20205,Cotton_A_30131,Cotton_A_30132,Cotton_A_37829,Cotton_A_39785,Cotton_A_35530,Cotton_A_40759,Cotton_A_40800 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH35 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH35 Glycoside_Hydrolases GH35 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_07840,Cotton_A_31892,Cotton_A_09413,Cotton_A_09414,Cotton_A_16291,Cotton_A_16292,Cotton_A_33701,Cotton_A_28521,Cotton_A_32909,Cotton_A_32910,Cotton_A_00712,Cotton_A_01583,Cotton_A_10296,Cotton_A_34315,Cotton_A_25446,Cotton_A_25447,Cotton_A_14685,Cotton_A_18930,Cotton_A_30157,Cotton_A_32418,Cotton_A_09067,Cotton_A_05436,Cotton_A_05440,Cotton_A_11044,Cotton_A_03841,Cotton_A_04561,Cotton_A_07960,Cotton_A_07961,Cotton_A_15261,Cotton_A_27153 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH1 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH1 Glycoside_Hydrolases GH1 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_16525,Cotton_A_27624,Cotton_A_25501,Cotton_A_25502,Cotton_A_00394,Cotton_A_00421,Cotton_A_00434,Cotton_A_41274,Cotton_A_12229,Cotton_A_12230,Cotton_A_10980,Cotton_A_14287,Cotton_A_16811,Cotton_A_17930,Cotton_A_17931,Cotton_A_29487,Cotton_A_29488,Cotton_A_29489,Cotton_A_38330,Cotton_A_11019,Cotton_A_20148,Cotton_A_28892,Cotton_A_25652,Cotton_A_25653,Cotton_A_06183,Cotton_A_17753,Cotton_A_17754,Cotton_A_17756 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT57 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT57 GlycosylTransferases GT57 GlycosylTransferases Cotton_A_19788,Cotton_A_22794 CARBOHYDRATE-BINDING_MODULES_CBM48 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CBM48 Carbohydrate-Binding_Modules CBM48 Carbohydrate-Binding_Modules Cotton_A_18008,Cotton_A_00478,Cotton_A_00531,Cotton_A_34405,Cotton_A_19291,Cotton_A_34417,Cotton_A_28857,Cotton_A_30809,Cotton_A_30810,Cotton_A_32058,Cotton_A_06073,Cotton_A_06074,Cotton_A_06075,Cotton_A_15978,Cotton_A_08243,Cotton_A_10974,Cotton_A_26520,Cotton_A_26521,Cotton_A_29303,Cotton_A_04871,Cotton_A_04917,Cotton_A_07046,Cotton_A_12146,Cotton_A_27540,Cotton_A_05116,Cotton_A_18521,Cotton_A_18782 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT22 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT22 GlycosylTransferases GT22 GlycosylTransferases Cotton_A_13793,Cotton_A_23154,Cotton_A_30430,Cotton_A_21202,Cotton_A_35980 CARBOHYDRATE-BINDING_MODULES_CBM22 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CBM22 Carbohydrate-Binding_Modules CBM22 Carbohydrate-Binding_Modules Cotton_A_21726,Cotton_A_21727,Cotton_A_25270,Cotton_A_34930,Cotton_A_27819,Cotton_A_27820,Cotton_A_24603 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH85 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH85 Glycoside_Hydrolases GH85 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_10153,Cotton_A_24952,Cotton_A_15832 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT76 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT76 GlycosylTransferases GT76 GlycosylTransferases Cotton_A_10258 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT32 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT32 GlycosylTransferases GT32 GlycosylTransferases Cotton_A_02490,Cotton_A_28927,Cotton_A_03510,Cotton_A_03511,Cotton_A_26151,Cotton_A_03879 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT47 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT47 GlycosylTransferases GT47 GlycosylTransferases Cotton_A_07394,Cotton_A_07417,Cotton_A_07555,Cotton_A_07805,Cotton_A_11180,Cotton_A_21643,Cotton_A_10498,Cotton_A_27432,Cotton_A_27745,Cotton_A_00502,Cotton_A_26705,Cotton_A_28813,Cotton_A_33024,Cotton_A_08813,Cotton_A_19612,Cotton_A_19673,Cotton_A_19683,Cotton_A_34384,Cotton_A_07287,Cotton_A_10331,Cotton_A_28589,Cotton_A_36601,Cotton_A_40629,Cotton_A_38024,Cotton_A_01206,Cotton_A_01207,Cotton_A_01208,Cotton_A_03722,Cotton_A_18883,Cotton_A_17120,Cotton_A_03060,Cotton_A_09040,Cotton_A_22355,Cotton_A_25104,Cotton_A_30235,Cotton_A_30688,Cotton_A_30689,Cotton_A_06969,Cotton_A_30454,Cotton_A_34036,Cotton_A_05734,Cotton_A_18383,Cotton_A_20068,Cotton_A_25981,Cotton_A_26774,Cotton_A_34272,Cotton_A_02986,Cotton_A_23062,Cotton_A_24420,Cotton_A_34583,Cotton_A_34584,Cotton_A_01369,Cotton_A_07987 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH19 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH19 Glycoside_Hydrolases GH19 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_16545,Cotton_A_15696,Cotton_A_10234,Cotton_A_34647 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT59 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT59 GlycosylTransferases GT59 GlycosylTransferases Cotton_A_12040,Cotton_A_30197 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH47 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH47 Glycoside_Hydrolases GH47 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_13093,Cotton_A_05291,Cotton_A_32551,Cotton_A_12344,Cotton_A_10250,Cotton_A_36102 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT14 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT14 GlycosylTransferases GT14 GlycosylTransferases Cotton_A_28194,Cotton_A_34803,Cotton_A_34804,Cotton_A_24519,Cotton_A_28095,Cotton_A_05548,Cotton_A_17245,Cotton_A_20605,Cotton_A_30722,Cotton_A_00088,Cotton_A_06284,Cotton_A_16792,Cotton_A_28890,Cotton_A_10252,Cotton_A_16165,Cotton_A_30248,Cotton_A_37455 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT92 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT92 GlycosylTransferases GT92 GlycosylTransferases Cotton_A_07812,Cotton_A_06637,Cotton_A_30190 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT29 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT29 GlycosylTransferases GT29 GlycosylTransferases Cotton_A_03652,Cotton_A_09581,Cotton_A_13888,Cotton_A_08003,Cotton_A_35410,Cotton_A_30989 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT4 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT4 GlycosylTransferases GT4 GlycosylTransferases Cotton_A_07847,Cotton_A_27256,Cotton_A_37769,Cotton_A_00333,Cotton_A_35243,Cotton_A_01589,Cotton_A_05670,Cotton_A_12199,Cotton_A_39280,Cotton_A_14677,Cotton_A_21482,Cotton_A_29135,Cotton_A_04249,Cotton_A_27772,Cotton_A_27773,Cotton_A_29422,Cotton_A_00993,Cotton_A_02286,Cotton_A_02287,Cotton_A_03057,Cotton_A_03181,Cotton_A_05352,Cotton_A_22292,Cotton_A_11932,Cotton_A_22517,Cotton_A_11836,Cotton_A_19902,Cotton_A_19903,Cotton_A_27855,Cotton_A_01977,Cotton_A_04532,Cotton_A_13580,Cotton_A_35976,Cotton_A_35982,Cotton_A_38938 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT13 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT13 GlycosylTransferases GT13 GlycosylTransferases Cotton_A_27338,Cotton_A_15779 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH37 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH37 Glycoside_Hydrolases GH37 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_02338,Cotton_A_04451 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH18 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH18 Glycoside_Hydrolases GH18 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_33972,Cotton_A_07229,Cotton_A_07231,Cotton_A_07232,Cotton_A_20387,Cotton_A_20307,Cotton_A_09055,Cotton_A_09056,Cotton_A_09057,Cotton_A_09095,Cotton_A_16800,Cotton_A_31995,Cotton_A_31998,Cotton_A_22925,Cotton_A_17761,Cotton_A_17762,Cotton_A_25893,Cotton_A_28340 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH27 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH27 Glycoside_Hydrolases GH27 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_36753,Cotton_A_32391,Cotton_A_29833,Cotton_A_28231,Cotton_A_03874,Cotton_A_21259 CARBOHYDRATE_ESTERASES_CE8 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CE8 Carbohydrate_Esterases CE8 Carbohydrate_Esterases Cotton_A_02389,Cotton_A_07374,Cotton_A_18042,Cotton_A_18043,Cotton_A_18044,Cotton_A_18045,Cotton_A_18047,Cotton_A_18048,Cotton_A_18049,Cotton_A_19241,Cotton_A_22078,Cotton_A_34102,Cotton_A_13769,Cotton_A_15617,Cotton_A_18102,Cotton_A_34988,Cotton_A_34989,Cotton_A_37789,Cotton_A_37792,Cotton_A_00605,Cotton_A_00735,Cotton_A_36055,Cotton_A_36056,Cotton_A_38246,Cotton_A_03575,Cotton_A_05664,Cotton_A_05665,Cotton_A_10317,Cotton_A_13303,Cotton_A_14061,Cotton_A_14062,Cotton_A_14063,Cotton_A_23583,Cotton_A_24017,Cotton_A_25073,Cotton_A_03354,Cotton_A_07724,Cotton_A_20350,Cotton_A_35784,Cotton_A_09518,Cotton_A_10961,Cotton_A_21466,Cotton_A_23217,Cotton_A_23287,Cotton_A_23288,Cotton_A_23289,Cotton_A_28070,Cotton_A_28968,Cotton_A_28969,Cotton_A_40848,Cotton_A_04843,Cotton_A_06540,Cotton_A_06542,Cotton_A_17794,Cotton_A_23894,Cotton_A_23895,Cotton_A_30593,Cotton_A_30741,Cotton_A_30742,Cotton_A_02290,Cotton_A_03186,Cotton_A_09047,Cotton_A_21890,Cotton_A_29736,Cotton_A_36943,Cotton_A_04015,Cotton_A_04703,Cotton_A_18763,Cotton_A_18764,Cotton_A_18765,Cotton_A_18959,Cotton_A_37293,Cotton_A_18505,Cotton_A_18506,Cotton_A_27174,Cotton_A_38911,Cotton_A_08564,Cotton_A_19905,Cotton_A_28846,Cotton_A_28847,Cotton_A_07133,Cotton_A_11358,Cotton_A_13632,Cotton_A_13633,Cotton_A_20700,Cotton_A_20702,Cotton_A_20704,Cotton_A_22061,Cotton_A_39139,Cotton_A_39462,Cotton_A_40548 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT64 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT64 GlycosylTransferases GT64 GlycosylTransferases Cotton_A_26254,Cotton_A_19133 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH36 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH36 Glycoside_Hydrolases GH36 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_19231,Cotton_A_02717,Cotton_A_31841,Cotton_A_08440,Cotton_A_24265,Cotton_A_25695,Cotton_A_02157,Cotton_A_34266,Cotton_A_07440,Cotton_A_07441,Cotton_A_08077,Cotton_A_22062 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH81 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH81 Glycoside_Hydrolases GH81 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_12187,Cotton_A_05466,Cotton_A_05468,Cotton_A_05469 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT16 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT16 GlycosylTransferases GT16 GlycosylTransferases Cotton_A_32056,Cotton_A_03703 CARBOHYDRATE_ESTERASES_CE11 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA CE11 Carbohydrate_Esterases CE11 Carbohydrate_Esterases Cotton_A_06715 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT19 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT19 GlycosylTransferases GT19 GlycosylTransferases Cotton_A_28792 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT33 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT33 GlycosylTransferases GT33 GlycosylTransferases Cotton_A_29113,Cotton_A_32780,Cotton_A_32782,Cotton_A_34117 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT31 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT31 GlycosylTransferases GT31 GlycosylTransferases Cotton_A_01806,Cotton_A_02402,Cotton_A_08122,Cotton_A_08171,Cotton_A_30617,Cotton_A_18449,Cotton_A_22227,Cotton_A_28253,Cotton_A_08743,Cotton_A_08952,Cotton_A_08953,Cotton_A_19298,Cotton_A_19084,Cotton_A_24673,Cotton_A_03414,Cotton_A_04800,Cotton_A_11672,Cotton_A_11677,Cotton_A_11762,Cotton_A_15116,Cotton_A_15117,Cotton_A_20137,Cotton_A_20139,Cotton_A_24270,Cotton_A_28137,Cotton_A_02205,Cotton_A_25085,Cotton_A_32838,Cotton_A_04681,Cotton_A_12163,Cotton_A_16135,Cotton_A_28907,Cotton_A_32709,Cotton_A_05842,Cotton_A_11933,Cotton_A_38103,Cotton_A_02934,Cotton_A_17374,Cotton_A_25629,Cotton_A_06153,Cotton_A_13192,Cotton_A_14573,Cotton_A_20935,Cotton_A_20936,Cotton_A_40774,Cotton_A_40928,Cotton_A_41139 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH17 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH17 Glycoside_Hydrolases GH17 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_01892,Cotton_A_01893,Cotton_A_02355,Cotton_A_07399,Cotton_A_08100,Cotton_A_15376,Cotton_A_16537,Cotton_A_16539,Cotton_A_35086,Cotton_A_09399,Cotton_A_09400,Cotton_A_10484,Cotton_A_10553,Cotton_A_13748,Cotton_A_17417,Cotton_A_18097,Cotton_A_18456,Cotton_A_20448,Cotton_A_36325,Cotton_A_38958,Cotton_A_38959,Cotton_A_36373,Cotton_A_00745,Cotton_A_25304,Cotton_A_34954,Cotton_A_03523,Cotton_A_09592,Cotton_A_15198,Cotton_A_18690,Cotton_A_23743,Cotton_A_25071,Cotton_A_25072,Cotton_A_39010,Cotton_A_39233,Cotton_A_06068,Cotton_A_17576,Cotton_A_18246,Cotton_A_18247,Cotton_A_18248,Cotton_A_18249,Cotton_A_29885,Cotton_A_01055,Cotton_A_15022,Cotton_A_04825,Cotton_A_12674,Cotton_A_20326,Cotton_A_24254,Cotton_A_00968,Cotton_A_03187,Cotton_A_22413,Cotton_A_23370,Cotton_A_23371,Cotton_A_23372,Cotton_A_23373,Cotton_A_23374,Cotton_A_23375,Cotton_A_26811,Cotton_A_04676,Cotton_A_11521,Cotton_A_12137,Cotton_A_12341,Cotton_A_13550,Cotton_A_13878,Cotton_A_16131,Cotton_A_03296,Cotton_A_05737,Cotton_A_14534,Cotton_A_35998,Cotton_A_36462,Cotton_A_02897,Cotton_A_11774,Cotton_A_31039,Cotton_A_13195,Cotton_A_23048,Cotton_A_37357,Cotton_A_40606 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT68 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT68 GlycosylTransferases GT68 GlycosylTransferases Cotton_A_35087,Cotton_A_26887,Cotton_A_08570 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT8 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT8 GlycosylTransferases GT8 GlycosylTransferases Cotton_A_09627,Cotton_A_12456,Cotton_A_14705,Cotton_A_30569,Cotton_A_30570,Cotton_A_37318,Cotton_A_13723,Cotton_A_24845,Cotton_A_30110,Cotton_A_19314,Cotton_A_01647,Cotton_A_05975,Cotton_A_24140,Cotton_A_24685,Cotton_A_24969,Cotton_A_25074,Cotton_A_25816,Cotton_A_14947,Cotton_A_18271,Cotton_A_18298,Cotton_A_26240,Cotton_A_34689,Cotton_A_37892,Cotton_A_08253,Cotton_A_09266,Cotton_A_09519,Cotton_A_10953,Cotton_A_15491,Cotton_A_23219,Cotton_A_26441,Cotton_A_26563,Cotton_A_31462,Cotton_A_00128,Cotton_A_06883,Cotton_A_06946,Cotton_A_33034,Cotton_A_33136,Cotton_A_00833,Cotton_A_12824,Cotton_A_17917,Cotton_A_21881,Cotton_A_23262,Cotton_A_23263,Cotton_A_23264,Cotton_A_24302,Cotton_A_27913,Cotton_A_27930,Cotton_A_04619,Cotton_A_08643,Cotton_A_16638,Cotton_A_20765,Cotton_A_29162,Cotton_A_31884,Cotton_A_18406,Cotton_A_20684,Cotton_A_22940,Cotton_A_23971,Cotton_A_12910,Cotton_A_37299,Cotton_A_07132,Cotton_A_11410,Cotton_A_20716,Cotton_A_28493,Cotton_A_41277,Cotton_A_39457,Cotton_A_40573 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH89 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH89 Glycoside_Hydrolases GH89 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_19101,Cotton_A_12970 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT50 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT50 GlycosylTransferases GT50 GlycosylTransferases Cotton_A_12246,Cotton_A_05487 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT20 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT20 GlycosylTransferases GT20 GlycosylTransferases Cotton_A_23709,Cotton_A_23712,Cotton_A_02720,Cotton_A_22808,Cotton_A_33372,Cotton_A_05024,Cotton_A_22769,Cotton_A_31871,Cotton_A_09181,Cotton_A_12382,Cotton_A_12395,Cotton_A_09724,Cotton_A_38312,Cotton_A_17512 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT30 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT30 GlycosylTransferases GT30 GlycosylTransferases Cotton_A_32816 GLYCOSYLTRANSFERASES_GT43 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GT43 GlycosylTransferases GT43 GlycosylTransferases Cotton_A_12081,Cotton_A_27874,Cotton_A_23552,Cotton_A_20490,Cotton_A_35394,Cotton_A_09043,Cotton_A_17296,Cotton_A_11907,Cotton_A_12576,Cotton_A_30529 GLYCOSIDE_HYDROLASES_GH38 GFam Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA GH38 Glycoside_Hydrolases GH38 Glycoside_Hydrolases Cotton_A_20593,Cotton_A_29267,Cotton_A_33267,Cotton_A_01551,Cotton_A_19452,Cotton_A_30826,Cotton_A_04584 PYRUVATE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00620 Pyruvate_metabolism ko00620 Pyruvate_metabolism Cotton_A_15390,Cotton_A_19789,Cotton_A_06031,Cotton_A_16343,Cotton_A_25423,Cotton_A_24070,Cotton_A_10500,Cotton_A_18869,Cotton_A_25522,Cotton_A_04227,Cotton_A_04228,Cotton_A_04230,Cotton_A_04953,Cotton_A_14523 HOMOLOGOUS_RECOMBINATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03440 Homologous_recombination ko03440 Homologous_recombination Cotton_A_21686,Cotton_A_25293,Cotton_A_21334,Cotton_A_01011,Cotton_A_25070,Cotton_A_25854,Cotton_A_10682,Cotton_A_22155,Cotton_A_19396,Cotton_A_13821,Cotton_A_19736,Cotton_A_32427,Cotton_A_17316,Cotton_A_27211,Cotton_A_09500,Cotton_A_36226,Cotton_A_37741,Cotton_A_24572,Cotton_A_30403,Cotton_A_03141,Cotton_A_34986,Cotton_A_03432,Cotton_A_24678,Cotton_A_24400,Cotton_A_07001,Cotton_A_36392,Cotton_A_16911 CITRATE_CYCLE_(TCA_CYCLE) KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00020 Citrate_cycle_(TCA_cycle) ko00020 Citrate_cycle_(TCA_cycle) Cotton_A_18654,Cotton_A_17796,Cotton_A_29624,Cotton_A_14782,Cotton_A_23055 INSULIN_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04910 Insulin_signaling_pathway ko04910 Insulin_signaling_pathway Cotton_A_01901,Cotton_A_09651,Cotton_A_13473,Cotton_A_14719,Cotton_A_29844,Cotton_A_00417,Cotton_A_24657,Cotton_A_16249,Cotton_A_18286,Cotton_A_24936,Cotton_A_29051,Cotton_A_34572,Cotton_A_05540,Cotton_A_18893,Cotton_A_02228,Cotton_A_09111,Cotton_A_09112,Cotton_A_02652,Cotton_A_07003,Cotton_A_15076,Cotton_A_21079,Cotton_A_23481,Cotton_A_07513,Cotton_A_10445,Cotton_A_08049,Cotton_A_13342 REGULATION_OF_AUTOPHAGY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04140 Regulation_of_autophagy ko04140 Regulation_of_autophagy Cotton_A_09402,Cotton_A_27159,Cotton_A_31799,Cotton_A_31834,Cotton_A_19058,Cotton_A_17377,Cotton_A_27155,Cotton_A_12234,Cotton_A_22215,Cotton_A_31823,Cotton_A_11284,Cotton_A_09669 BETALAIN_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00965 Betalain_biosynthesis ko00965 Betalain_biosynthesis Cotton_A_17597,Cotton_A_17598 RNA_DEGRADATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03018 RNA_degradation ko03018 RNA_degradation Cotton_A_06296,Cotton_A_30894,Cotton_A_35023,Cotton_A_03762,Cotton_A_03765,Cotton_A_06516,Cotton_A_38510,Cotton_A_31133,Cotton_A_28771,Cotton_A_34345,Cotton_A_23405,Cotton_A_32737,Cotton_A_21475,Cotton_A_23004,Cotton_A_29507,Cotton_A_07585,Cotton_A_25603,Cotton_A_20277,Cotton_A_39641,Cotton_A_29032,Cotton_A_21623,Cotton_A_05463,Cotton_A_11939,Cotton_A_10529,Cotton_A_24679,Cotton_A_26122,Cotton_A_07026,Cotton_A_09422,Cotton_A_05689,Cotton_A_02650,Cotton_A_12821,Cotton_A_35864,Cotton_A_25069,Cotton_A_14369,Cotton_A_06099,Cotton_A_07072,Cotton_A_37811,Cotton_A_01692,Cotton_A_00162,Cotton_A_01800,Cotton_A_02859,Cotton_A_09041,Cotton_A_04615,Cotton_A_05709,Cotton_A_06678,Cotton_A_24790,Cotton_A_24026,Cotton_A_29925,Cotton_A_12312,Cotton_A_15884,Cotton_A_21924,Cotton_A_07341,Cotton_A_07342,Cotton_A_37160,Cotton_A_05394,Cotton_A_05443,Cotton_A_02972,Cotton_A_38084,Cotton_A_15827,Cotton_A_15829,Cotton_A_01163,Cotton_A_30652,Cotton_A_06964,Cotton_A_15422,Cotton_A_15311,Cotton_A_37345,Cotton_A_13576,Cotton_A_07703,Cotton_A_31204,Cotton_A_10532,Cotton_A_07007,Cotton_A_21440,Cotton_A_15021,Cotton_A_30256,Cotton_A_35679,Cotton_A_07245,Cotton_A_09609,Cotton_A_01183,Cotton_A_05454,Cotton_A_38376,Cotton_A_09100,Cotton_A_11942,Cotton_A_39036,Cotton_A_02558,Cotton_A_07277,Cotton_A_03062,Cotton_A_34267,Cotton_A_29200,Cotton_A_05554,Cotton_A_16516,Cotton_A_38012,Cotton_A_06800 WNT_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04310 Wnt_signaling_pathway ko04310 Wnt_signaling_pathway Cotton_A_25916,Cotton_A_10272,Cotton_A_19118,Cotton_A_40179,Cotton_A_26264,Cotton_A_13864,Cotton_A_20870,Cotton_A_12342,Cotton_A_02894,Cotton_A_23560,Cotton_A_26930 ALZHEIMER'S_DISEASE KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05010 Alzheimer's_disease ko05010 Alzheimer's_disease Cotton_A_33437 NITROGEN_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00910 Nitrogen_metabolism ko00910 Nitrogen_metabolism Cotton_A_30737,Cotton_A_16852,Cotton_A_07174,Cotton_A_13629,Cotton_A_31181,Cotton_A_17475,Cotton_A_23939,Cotton_A_25488,Cotton_A_39355,Cotton_A_40405,Cotton_A_23821,Cotton_A_28858,Cotton_A_23435,Cotton_A_27599,Cotton_A_10201,Cotton_A_01485,Cotton_A_01898,Cotton_A_10515,Cotton_A_27415,Cotton_A_00484,Cotton_A_26697,Cotton_A_33228,Cotton_A_38120,Cotton_A_39322,Cotton_A_10640,Cotton_A_27425,Cotton_A_04245,Cotton_A_04246,Cotton_A_24062,Cotton_A_35610 ONE_CARBON_POOL_BY_FOLATE KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00670 One_carbon_pool_by_folate ko00670 One_carbon_pool_by_folate Cotton_A_12226,Cotton_A_15319,Cotton_A_23850,Cotton_A_21318 DNA_REPLICATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03030 DNA_replication ko03030 DNA_replication Cotton_A_16287,Cotton_A_11622,Cotton_A_01601,Cotton_A_36503,Cotton_A_02260,Cotton_A_34350,Cotton_A_33689,Cotton_A_37573,Cotton_A_32603,Cotton_A_14904,Cotton_A_18153,Cotton_A_04999,Cotton_A_03159,Cotton_A_11325,Cotton_A_36460,Cotton_A_07966,Cotton_A_23042,Cotton_A_19814,Cotton_A_31918,Cotton_A_32687,Cotton_A_09051,Cotton_A_19749,Cotton_A_20565,Cotton_A_30278,Cotton_A_12357,Cotton_A_33757,Cotton_A_33747,Cotton_A_30839,Cotton_A_23275,Cotton_A_04220,Cotton_A_16914,Cotton_A_01112,Cotton_A_09117,Cotton_A_05472,Cotton_A_20276,Cotton_A_20024,Cotton_A_29030,Cotton_A_03571,Cotton_A_07970,Cotton_A_31601 FATTY_ACID_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko01212 Fatty_acid_metabolism ko01212 Fatty_acid_metabolism Cotton_A_16566,Cotton_A_14512,Cotton_A_18818,Cotton_A_18562,Cotton_A_18570,Cotton_A_33900,Cotton_A_15026,Cotton_A_15027,Cotton_A_16458,Cotton_A_21040,Cotton_A_02550,Cotton_A_12006,Cotton_A_16390,Cotton_A_02203,Cotton_A_15940,Cotton_A_23380,Cotton_A_24719,Cotton_A_16598,Cotton_A_29915,Cotton_A_09136,Cotton_A_30225,Cotton_A_22339,Cotton_A_31023,Cotton_A_04484,Cotton_A_07148,Cotton_A_32037,Cotton_A_37079,Cotton_A_20766,Cotton_A_39655,Cotton_A_23765,Cotton_A_23766,Cotton_A_15790,Cotton_A_09068,Cotton_A_06606,Cotton_A_36175,Cotton_A_02546,Cotton_A_21122,Cotton_A_21126,Cotton_A_00324,Cotton_A_09523,Cotton_A_03484,Cotton_A_31043,Cotton_A_02965,Cotton_A_35290,Cotton_A_04180,Cotton_A_23698,Cotton_A_21962,Cotton_A_12260,Cotton_A_03179,Cotton_A_12358,Cotton_A_11864,Cotton_A_33802,Cotton_A_16607,Cotton_A_09129,Cotton_A_20444,Cotton_A_31014,Cotton_A_03102,Cotton_A_14499,Cotton_A_06350,Cotton_A_21184,Cotton_A_07154,Cotton_A_11219,Cotton_A_31022,Cotton_A_34022,Cotton_A_02238,Cotton_A_25956,Cotton_A_36887,Cotton_A_16310,Cotton_A_24965,Cotton_A_26973,Cotton_A_10977,Cotton_A_16099,Cotton_A_37994,Cotton_A_20903,Cotton_A_22119,Cotton_A_35622,Cotton_A_23615 RIG-I-LIKE_RECEPTOR_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04622 RIG-I-like_receptor_signaling_pathway ko04622 RIG-I-like_receptor_signaling_pathway Cotton_A_26266,Cotton_A_15310,Cotton_A_37347,Cotton_A_06602,Cotton_A_02534,Cotton_A_28886,Cotton_A_24183,Cotton_A_01991 ARACHIDONIC_ACID_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00590 Arachidonic_acid_metabolism ko00590 Arachidonic_acid_metabolism Cotton_A_16210,Cotton_A_01960,Cotton_A_19216,Cotton_A_13937,Cotton_A_14470,Cotton_A_14472,Cotton_A_30627,Cotton_A_22305,Cotton_A_19545,Cotton_A_25978,Cotton_A_25980,Cotton_A_18086,Cotton_A_10884,Cotton_A_00918,Cotton_A_16442,Cotton_A_04508,Cotton_A_18086,Cotton_A_10884 FANCONI_ANEMIA_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03460 Fanconi_anemia_pathway ko03460 Fanconi_anemia_pathway Cotton_A_18525,Cotton_A_30369,Cotton_A_21725,Cotton_A_20981,Cotton_A_15243,Cotton_A_33577,Cotton_A_04892,Cotton_A_27479,Cotton_A_04605,Cotton_A_24313,Cotton_A_33050,Cotton_A_03671,Cotton_A_20001,Cotton_A_03641,Cotton_A_08074,Cotton_A_33376,Cotton_A_15011,Cotton_A_22420,Cotton_A_16861,Cotton_A_16565,Cotton_A_18712 MONOTERPENOID_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00902 Monoterpenoid_biosynthesis ko00902 Monoterpenoid_biosynthesis Cotton_A_13328,Cotton_A_21478,Cotton_A_10440,Cotton_A_20789,Cotton_A_14734,Cotton_A_18373,Cotton_A_18374,Cotton_A_10726,Cotton_A_22770 PROTEIN_PROCESSING_IN_ENDOPLASMIC_RETICULUM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04141 Protein_processing_in_endoplasmic_reticulum ko04141 Protein_processing_in_endoplasmic_reticulum Cotton_A_05694,Cotton_A_11859,Cotton_A_16571,Cotton_A_08290,Cotton_A_27914,Cotton_A_18786,Cotton_A_23646,Cotton_A_21736,Cotton_A_01540,Cotton_A_18232,Cotton_A_05850,Cotton_A_06491,Cotton_A_11682,Cotton_A_02148,Cotton_A_06796,Cotton_A_06798,Cotton_A_25704,Cotton_A_26163,Cotton_A_32635,Cotton_A_10810,Cotton_A_28665,Cotton_A_12675,Cotton_A_21160,Cotton_A_04787,Cotton_A_11161,Cotton_A_14510,Cotton_A_00342,Cotton_A_31856,Cotton_A_14975,Cotton_A_34110,Cotton_A_21789,Cotton_A_10690,Cotton_A_12582,Cotton_A_34644,Cotton_A_22039,Cotton_A_01847,Cotton_A_23959,Cotton_A_04276,Cotton_A_05372,Cotton_A_07049,Cotton_A_16089,Cotton_A_20774,Cotton_A_04548,Cotton_A_40270,Cotton_A_26356,Cotton_A_12267,Cotton_A_12581,Cotton_A_22508,Cotton_A_33183,Cotton_A_26890,Cotton_A_08566,Cotton_A_02400,Cotton_A_12458,Cotton_A_04309,Cotton_A_04310,Cotton_A_28748,Cotton_A_14371,Cotton_A_22176,Cotton_A_04011,Cotton_A_06801,Cotton_A_37141,Cotton_A_07431,Cotton_A_39649,Cotton_A_15263,Cotton_A_17751,Cotton_A_27306,Cotton_A_29083,Cotton_A_24318,Cotton_A_03788,Cotton_A_10548,Cotton_A_31329,Cotton_A_06986,Cotton_A_10568,Cotton_A_34638,Cotton_A_39497,Cotton_A_22068,Cotton_A_01721,Cotton_A_11949,Cotton_A_03577,Cotton_A_13595,Cotton_A_29604,Cotton_A_21545,Cotton_A_24843,Cotton_A_17992,Cotton_A_06604,Cotton_A_00079,Cotton_A_06301,Cotton_A_06882,Cotton_A_33033,Cotton_A_11352,Cotton_A_13691,Cotton_A_03897,Cotton_A_25429,Cotton_A_05524,Cotton_A_40910,Cotton_A_24063,Cotton_A_08901,Cotton_A_30651,Cotton_A_27225,Cotton_A_35857,Cotton_A_23669,Cotton_A_00656,Cotton_A_08908,Cotton_A_15292,Cotton_A_22695,Cotton_A_29041,Cotton_A_07508,Cotton_A_07612,Cotton_A_03048,Cotton_A_40558,Cotton_A_38682,Cotton_A_04697,Cotton_A_14536,Cotton_A_13616,Cotton_A_07650,Cotton_A_21223,Cotton_A_27477,Cotton_A_32183,Cotton_A_07407,Cotton_A_30907,Cotton_A_32548,Cotton_A_15720,Cotton_A_26090,Cotton_A_26091,Cotton_A_21247,Cotton_A_06565,Cotton_A_12874,Cotton_A_12099,Cotton_A_16091,Cotton_A_14806,Cotton_A_35089,Cotton_A_26877,Cotton_A_32746,Cotton_A_32747,Cotton_A_37308,Cotton_A_37310,Cotton_A_08582,Cotton_A_09479,Cotton_A_29446,Cotton_A_24688,Cotton_A_26458,Cotton_A_26459,Cotton_A_12093,Cotton_A_00458,Cotton_A_37191,Cotton_A_18241,Cotton_A_18242,Cotton_A_33830,Cotton_A_20880,Cotton_A_26007,Cotton_A_37713,Cotton_A_02512,Cotton_A_33770,Cotton_A_09706,Cotton_A_03632,Cotton_A_01961,Cotton_A_07981,Cotton_A_34109,Cotton_A_38541,Cotton_A_04416,Cotton_A_10677,Cotton_A_21893,Cotton_A_21894,Cotton_A_27996,Cotton_A_26757,Cotton_A_13093,Cotton_A_32551,Cotton_A_13313,Cotton_A_05859,Cotton_A_04942,Cotton_A_25625,Cotton_A_38157,Cotton_A_29883,Cotton_A_34798,Cotton_A_04938,Cotton_A_04655,Cotton_A_01704,Cotton_A_18834,Cotton_A_27260,Cotton_A_07689,Cotton_A_36806,Cotton_A_04856,Cotton_A_03075,Cotton_A_11446,Cotton_A_18176,Cotton_A_09823,Cotton_A_19274,Cotton_A_29104,Cotton_A_30564,Cotton_A_08339,Cotton_A_08748,Cotton_A_07202,Cotton_A_14032,Cotton_A_14033,Cotton_A_19644,Cotton_A_19645,Cotton_A_19646,Cotton_A_18638,Cotton_A_02220,Cotton_A_30678,Cotton_A_30680,Cotton_A_33048,Cotton_A_38545,Cotton_A_02665,Cotton_A_04694,Cotton_A_05336,Cotton_A_06979,Cotton_A_22573,Cotton_A_13146,Cotton_A_18410,Cotton_A_20062,Cotton_A_21409,Cotton_A_26758,Cotton_A_39993,Cotton_A_02969,Cotton_A_12904,Cotton_A_12905,Cotton_A_13598,Cotton_A_14562,Cotton_A_21014,Cotton_A_06398,Cotton_A_33894,Cotton_A_00589,Cotton_A_08854,Cotton_A_02096 PROTEIN_DIGESTION_AND_ABSORPTION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04974 Protein_digestion_and_absorption ko04974 Protein_digestion_and_absorption Cotton_A_20347,Cotton_A_10165,Cotton_A_07237,Cotton_A_01259,Cotton_A_13910,Cotton_A_36443,Cotton_A_09800,Cotton_A_25260,Cotton_A_25819,Cotton_A_12510,Cotton_A_20347 GLYCOSYLPHOSPHATIDYLINOSITOL-ANCHOR_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00563 Glycosylphosphatidylinositol-anchor_biosynthesis ko00563 Glycosylphosphatidylinositol-anchor_biosynthesis Cotton_A_23101,Cotton_A_04249,Cotton_A_12246,Cotton_A_10258,Cotton_A_30546,Cotton_A_19462,Cotton_A_17102,Cotton_A_11209,Cotton_A_19044,Cotton_A_28657,Cotton_A_34534,Cotton_A_07340,Cotton_A_13114,Cotton_A_07924,Cotton_A_06706,Cotton_A_08432,Cotton_A_05861,Cotton_A_32658,Cotton_A_03812,Cotton_A_00143 RAS_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04014 Ras_signaling_pathway ko04014 Ras_signaling_pathway Cotton_A_01714,Cotton_A_10579,Cotton_A_22095,Cotton_A_13336,Cotton_A_33949,Cotton_A_15472,Cotton_A_02619,Cotton_A_11063,Cotton_A_11948,Cotton_A_29632,Cotton_A_01465,Cotton_A_07602,Cotton_A_07852,Cotton_A_24541,Cotton_A_01592,Cotton_A_33211,Cotton_A_19078,Cotton_A_11681,Cotton_A_22593,Cotton_A_25334,Cotton_A_02201,Cotton_A_25849,Cotton_A_07020,Cotton_A_07028,Cotton_A_22570,Cotton_A_29153,Cotton_A_32714,Cotton_A_31255,Cotton_A_23784,Cotton_A_01430,Cotton_A_20928,Cotton_A_28389,Cotton_A_09342,Cotton_A_05713,Cotton_A_06675,Cotton_A_03119,Cotton_A_01455,Cotton_A_03530,Cotton_A_17065,Cotton_A_00746,Cotton_A_19385,Cotton_A_11171,Cotton_A_16439,Cotton_A_18880,Cotton_A_39837,Cotton_A_32913,Cotton_A_01546,Cotton_A_38569,Cotton_A_22177,Cotton_A_05007,Cotton_A_18733,Cotton_A_21205,Cotton_A_03938,Cotton_A_26593,Cotton_A_20462,Cotton_A_10361,Cotton_A_05274,Cotton_A_28058,Cotton_A_35309,Cotton_A_32926,Cotton_A_10381 LYSINE_DEGRADATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00310 Lysine_degradation ko00310 Lysine_degradation Cotton_A_17732,Cotton_A_28349,Cotton_A_36322,Cotton_A_10614,Cotton_A_39715,Cotton_A_20259,Cotton_A_30827,Cotton_A_14298,Cotton_A_20520,Cotton_A_27568,Cotton_A_36870,Cotton_A_07169,Cotton_A_10094,Cotton_A_15582,Cotton_A_17352,Cotton_A_35541 FATTY_ACID_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00061 Fatty_acid_biosynthesis ko00061 Fatty_acid_biosynthesis Cotton_A_03239,Cotton_A_05096,Cotton_A_05097 HTLV-I_INFECTION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05166 HTLV-I_infection ko05166 HTLV-I_infection Cotton_A_20269,Cotton_A_01561,Cotton_A_19360,Cotton_A_35241 GABAERGIC_SYNAPSE KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04727 GABAergic_synapse ko04727 GABAergic_synapse Cotton_A_11060,Cotton_A_30616,Cotton_A_18178,Cotton_A_33954,Cotton_A_15460,Cotton_A_27657,Cotton_A_19003,Cotton_A_38042 PORPHYRIN_AND_CHLOROPHYLL_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00860 Porphyrin_and_chlorophyll_metabolism ko00860 Porphyrin_and_chlorophyll_metabolism Cotton_A_20279,Cotton_A_00118,Cotton_A_24702,Cotton_A_03662,Cotton_A_11159,Cotton_A_24708,Cotton_A_17294,Cotton_A_19518,Cotton_A_14937,Cotton_A_16804,Cotton_A_16805,Cotton_A_13673,Cotton_A_24368,Cotton_A_01723,Cotton_A_26206,Cotton_A_12291,Cotton_A_03279,Cotton_A_24099,Cotton_A_15698,Cotton_A_02579,Cotton_A_09672,Cotton_A_09530,Cotton_A_22881,Cotton_A_34949,Cotton_A_17429,Cotton_A_03073,Cotton_A_16649,Cotton_A_10151,Cotton_A_22323,Cotton_A_31482,Cotton_A_37973,Cotton_A_03642,Cotton_A_08964,Cotton_A_34845,Cotton_A_03472,Cotton_A_41294,Cotton_A_19566,Cotton_A_33994,Cotton_A_38278,Cotton_A_04066,Cotton_A_35801,Cotton_A_16093,Cotton_A_08623,Cotton_A_32379,Cotton_A_17589,Cotton_A_39447,Cotton_A_11887,Cotton_A_07830,Cotton_A_11984,Cotton_A_05012,Cotton_A_03954 LIPOIC_ACID_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00785 Lipoic_acid_metabolism ko00785 Lipoic_acid_metabolism Cotton_A_13716,Cotton_A_02553,Cotton_A_08995,Cotton_A_21830 VIRAL_CARCINOGENESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05203 Viral_carcinogenesis ko05203 Viral_carcinogenesis Cotton_A_18159,Cotton_A_01396,Cotton_A_09032,Cotton_A_26699,Cotton_A_19202,Cotton_A_09098,Cotton_A_05143,Cotton_A_25825,Cotton_A_10542,Cotton_A_10544,Cotton_A_00410,Cotton_A_31322,Cotton_A_31582,Cotton_A_02245,Cotton_A_13919,Cotton_A_32490,Cotton_A_32491,Cotton_A_32492,Cotton_A_32497,Cotton_A_21434,Cotton_A_40576,Cotton_A_10531,Cotton_A_10547,Cotton_A_00396,Cotton_A_23339,Cotton_A_34423,Cotton_A_18533,Cotton_A_26112,Cotton_A_26113,Cotton_A_02221,Cotton_A_07010,Cotton_A_21415,Cotton_A_21416,Cotton_A_21428,Cotton_A_08584,Cotton_A_16213,Cotton_A_01962,Cotton_A_07980,Cotton_A_11712,Cotton_A_20220,Cotton_A_10494,Cotton_A_27437,Cotton_A_00326,Cotton_A_05163 SPHINGOLIPID_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00600 Sphingolipid_metabolism ko00600 Sphingolipid_metabolism Cotton_A_31394,Cotton_A_10262,Cotton_A_08005,Cotton_A_24100,Cotton_A_38339,Cotton_A_38336,Cotton_A_06146,Cotton_A_35965,Cotton_A_03887,Cotton_A_39409,Cotton_A_32435,Cotton_A_25585,Cotton_A_03848,Cotton_A_13613,Cotton_A_15421,Cotton_A_07362,Cotton_A_37834,Cotton_A_17721,Cotton_A_00344,Cotton_A_29029,Cotton_A_29693,Cotton_A_12911,Cotton_A_07385,Cotton_A_27103,Cotton_A_30426,Cotton_A_04935,Cotton_A_34811 FRUCTOSE_AND_MANNOSE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00051 Fructose_and_mannose_metabolism ko00051 Fructose_and_mannose_metabolism Cotton_A_16268,Cotton_A_19795,Cotton_A_05874,Cotton_A_12238,Cotton_A_21591,Cotton_A_21151,Cotton_A_01358,Cotton_A_25878,Cotton_A_40602,Cotton_A_08469,Cotton_A_12277,Cotton_A_04210,Cotton_A_02715,Cotton_A_19453,Cotton_A_22655,Cotton_A_31722,Cotton_A_16627,Cotton_A_19345,Cotton_A_11368,Cotton_A_12544,Cotton_A_21340,Cotton_A_31988,Cotton_A_29510 MTOR_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04150 mTOR_signaling_pathway ko04150 mTOR_signaling_pathway Cotton_A_22675,Cotton_A_15660,Cotton_A_10908 RNA_TRANSPORT KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03013 RNA_transport ko03013 RNA_transport Cotton_A_23213,Cotton_A_00442,Cotton_A_19640,Cotton_A_11631,Cotton_A_07011,Cotton_A_02961,Cotton_A_09576,Cotton_A_10351,Cotton_A_10407,Cotton_A_30491,Cotton_A_06329,Cotton_A_14198,Cotton_A_24783,Cotton_A_17452,Cotton_A_17453,Cotton_A_28879,Cotton_A_08522,Cotton_A_28823,Cotton_A_05746,Cotton_A_05747,Cotton_A_22415,Cotton_A_26185,Cotton_A_00445,Cotton_A_13310,Cotton_A_29942,Cotton_A_36789,Cotton_A_28566,Cotton_A_02876,Cotton_A_02880,Cotton_A_23419,Cotton_A_23421,Cotton_A_14324,Cotton_A_28169,Cotton_A_06953,Cotton_A_16583,Cotton_A_16026,Cotton_A_13156,Cotton_A_37251,Cotton_A_00260,Cotton_A_31629,Cotton_A_14883,Cotton_A_29603,Cotton_A_36832,Cotton_A_21546,Cotton_A_40032,Cotton_A_05508,Cotton_A_28432,Cotton_A_33077,Cotton_A_08672,Cotton_A_17500,Cotton_A_04551,Cotton_A_23076,Cotton_A_11119,Cotton_A_20427,Cotton_A_39196,Cotton_A_11815,Cotton_A_08047,Cotton_A_20038,Cotton_A_08657,Cotton_A_35270,Cotton_A_39670,Cotton_A_12703,Cotton_A_23604,Cotton_A_02358,Cotton_A_37326,Cotton_A_35238,Cotton_A_07527,Cotton_A_17073,Cotton_A_20613,Cotton_A_34258,Cotton_A_23197,Cotton_A_20875,Cotton_A_23713,Cotton_A_10658,Cotton_A_22264,Cotton_A_16266,Cotton_A_03809,Cotton_A_37647,Cotton_A_33023,Cotton_A_32571,Cotton_A_37908,Cotton_A_24555,Cotton_A_38670,Cotton_A_15291,Cotton_A_39549,Cotton_A_35001,Cotton_A_14200,Cotton_A_31100,Cotton_A_12605,Cotton_A_15873,Cotton_A_03211,Cotton_A_16958,Cotton_A_34972,Cotton_A_18691,Cotton_A_37202,Cotton_A_15543,Cotton_A_12138,Cotton_A_03237,Cotton_A_14299,Cotton_A_06060,Cotton_A_22859,Cotton_A_05305,Cotton_A_34248,Cotton_A_19993,Cotton_A_41129,Cotton_A_16253,Cotton_A_06835,Cotton_A_20170,Cotton_A_21211,Cotton_A_27719,Cotton_A_27720,Cotton_A_28722,Cotton_A_14021,Cotton_A_18910,Cotton_A_02681,Cotton_A_21006,Cotton_A_35796,Cotton_A_11837,Cotton_A_10952,Cotton_A_21923,Cotton_A_26178,Cotton_A_19690,Cotton_A_05201,Cotton_A_17727,Cotton_A_24570,Cotton_A_24571,Cotton_A_00971,Cotton_A_22130,Cotton_A_38307,Cotton_A_31214,Cotton_A_05609,Cotton_A_05920,Cotton_A_08096,Cotton_A_08097,Cotton_A_19255,Cotton_A_19256,Cotton_A_03446,Cotton_A_25030,Cotton_A_25129,Cotton_A_04836,Cotton_A_19879,Cotton_A_07045,Cotton_A_05115,Cotton_A_22970,Cotton_A_27762,Cotton_A_25096,Cotton_A_36437,Cotton_A_11343,Cotton_A_03907,Cotton_A_15403,Cotton_A_15405,Cotton_A_19677,Cotton_A_17708,Cotton_A_28954,Cotton_A_18498,Cotton_A_03672,Cotton_A_24463,Cotton_A_28801,Cotton_A_34257,Cotton_A_04738,Cotton_A_04741,Cotton_A_04791,Cotton_A_15552,Cotton_A_17908,Cotton_A_21384,Cotton_A_21385,Cotton_A_18447,Cotton_A_12215,Cotton_A_23935,Cotton_A_16136,Cotton_A_16633,Cotton_A_14430,Cotton_A_16567,Cotton_A_16568,Cotton_A_17810,Cotton_A_05266,Cotton_A_04085,Cotton_A_38484,Cotton_A_12627,Cotton_A_01768,Cotton_A_11963,Cotton_A_21984,Cotton_A_18631,Cotton_A_34057 VALINE,_LEUCINE_AND_ISOLEUCINE_DEGRADATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00280 Valine,_leucine_and_isoleucine_degradation ko00280 Valine,_leucine_and_isoleucine_degradation Cotton_A_19586,Cotton_A_12765,Cotton_A_31414,Cotton_A_01737,Cotton_A_18038,Cotton_A_07163,Cotton_A_16982,Cotton_A_10769 PENTOSE_PHOSPHATE_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00030 Pentose_phosphate_pathway ko00030 Pentose_phosphate_pathway Cotton_A_20143 N-GLYCAN_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00510 N-Glycan_biosynthesis ko00510 N-Glycan_biosynthesis Cotton_A_28830,Cotton_A_15779,Cotton_A_23378,Cotton_A_26388,Cotton_A_00993,Cotton_A_29422,Cotton_A_32316,Cotton_A_23699,Cotton_A_17560,Cotton_A_29113,Cotton_A_32782,Cotton_A_32056,Cotton_A_03703,Cotton_A_35638,Cotton_A_39378,Cotton_A_03531,Cotton_A_08424,Cotton_A_30133,Cotton_A_12040,Cotton_A_30864,Cotton_A_23154,Cotton_A_21202,Cotton_A_22794,Cotton_A_19788,Cotton_A_18855,Cotton_A_15126,Cotton_A_03118,Cotton_A_20512,Cotton_A_10504,Cotton_A_04238,Cotton_A_01889,Cotton_A_09499,Cotton_A_24916,Cotton_A_05291,Cotton_A_12344,Cotton_A_10250,Cotton_A_29267,Cotton_A_19452,Cotton_A_35128,Cotton_A_38616,Cotton_A_12680,Cotton_A_31959,Cotton_A_03011,Cotton_A_25401,Cotton_A_07933,Cotton_A_35785,Cotton_A_17185,Cotton_A_09730,Cotton_A_15182,Cotton_A_13608 ESTROGEN_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04915 Estrogen_signaling_pathway ko04915 Estrogen_signaling_pathway Cotton_A_07408,Cotton_A_32764,Cotton_A_03792,Cotton_A_23474,Cotton_A_24442 LIMONENE_AND_PINENE_DEGRADATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00903 Limonene_and_pinene_degradation ko00903 Limonene_and_pinene_degradation Cotton_A_04958,Cotton_A_34727,Cotton_A_10447,Cotton_A_25651 CALCIUM_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04020 Calcium_signaling_pathway ko04020 Calcium_signaling_pathway Cotton_A_23477,Cotton_A_25032,Cotton_A_34412,Cotton_A_19436,Cotton_A_22738,Cotton_A_35167,Cotton_A_23488,Cotton_A_31475,Cotton_A_26776,Cotton_A_06132,Cotton_A_25805,Cotton_A_36879,Cotton_A_14013,Cotton_A_30014,Cotton_A_01071,Cotton_A_34366,Cotton_A_03312,Cotton_A_03313,Cotton_A_06825,Cotton_A_12992,Cotton_A_04471 THIAMINE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00730 Thiamine_metabolism ko00730 Thiamine_metabolism Cotton_A_17335,Cotton_A_21777,Cotton_A_39687,Cotton_A_06764,Cotton_A_06768,Cotton_A_06769,Cotton_A_31168,Cotton_A_19397,Cotton_A_14609,Cotton_A_20287,Cotton_A_30884,Cotton_A_04742 PI3K-AKT_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04151 PI3K-Akt_signaling_pathway ko04151 PI3K-Akt_signaling_pathway Cotton_A_36314,Cotton_A_15335,Cotton_A_04342,Cotton_A_40328 PENTOSE_AND_GLUCURONATE_INTERCONVERSIONS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00040 Pentose_and_glucuronate_interconversions ko00040 Pentose_and_glucuronate_interconversions Cotton_A_38655,Cotton_A_01349,Cotton_A_00236,Cotton_A_19106,Cotton_A_15494,Cotton_A_32127,Cotton_A_29493,Cotton_A_06182,Cotton_A_35254,Cotton_A_27829,Cotton_A_35639,Cotton_A_30975,Cotton_A_12606,Cotton_A_33174,Cotton_A_29710,Cotton_A_16159,Cotton_A_07374,Cotton_A_22078,Cotton_A_34102,Cotton_A_13769,Cotton_A_18102,Cotton_A_34989,Cotton_A_37792,Cotton_A_00605,Cotton_A_00735,Cotton_A_36055,Cotton_A_36056,Cotton_A_38246,Cotton_A_03575,Cotton_A_05664,Cotton_A_05665,Cotton_A_10317,Cotton_A_13303,Cotton_A_14061,Cotton_A_23583,Cotton_A_07724,Cotton_A_35784,Cotton_A_23287,Cotton_A_23288,Cotton_A_28968,Cotton_A_04843,Cotton_A_06540,Cotton_A_06542,Cotton_A_23894,Cotton_A_23895,Cotton_A_30741,Cotton_A_30742,Cotton_A_09047,Cotton_A_21890,Cotton_A_36943,Cotton_A_18959,Cotton_A_27174,Cotton_A_38911,Cotton_A_19905,Cotton_A_11358,Cotton_A_20700,Cotton_A_39139,Cotton_A_13106,Cotton_A_11530,Cotton_A_03422,Cotton_A_20517,Cotton_A_11789,Cotton_A_16563,Cotton_A_16564,Cotton_A_04841,Cotton_A_02442,Cotton_A_07347,Cotton_A_18370,Cotton_A_28210,Cotton_A_13840,Cotton_A_29466,Cotton_A_30326,Cotton_A_00482,Cotton_A_20836,Cotton_A_11573,Cotton_A_18621,Cotton_A_08462,Cotton_A_08506,Cotton_A_20603,Cotton_A_30522,Cotton_A_11769,Cotton_A_15159,Cotton_A_20116,Cotton_A_24761,Cotton_A_24780,Cotton_A_36249,Cotton_A_19029,Cotton_A_31594,Cotton_A_36925,Cotton_A_05153,Cotton_A_02966,Cotton_A_07470,Cotton_A_35293,Cotton_A_08069,Cotton_A_17759,Cotton_A_17760,Cotton_A_30120,Cotton_A_15615,Cotton_A_04082 AMINOACYL-TRNA_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00970 Aminoacyl-tRNA_biosynthesis ko00970 Aminoacyl-tRNA_biosynthesis Cotton_A_04970,Cotton_A_01290,Cotton_A_25365,Cotton_A_00280,Cotton_A_29462,Cotton_A_21497,Cotton_A_22425,Cotton_A_09401,Cotton_A_14533,Cotton_A_05174,Cotton_A_22340,Cotton_A_16375,Cotton_A_28172,Cotton_A_22109,Cotton_A_00604,Cotton_A_08954,Cotton_A_16601,Cotton_A_18076,Cotton_A_15209,Cotton_A_03778,Cotton_A_24947,Cotton_A_36799,Cotton_A_21323,Cotton_A_16743,Cotton_A_00559,Cotton_A_26518,Cotton_A_37881,Cotton_A_14465,Cotton_A_14471,Cotton_A_16345,Cotton_A_10102,Cotton_A_26611,Cotton_A_36000,Cotton_A_05785,Cotton_A_08887,Cotton_A_35072,Cotton_A_01449,Cotton_A_25335,Cotton_A_15091,Cotton_A_01717,Cotton_A_22253,Cotton_A_17613,Cotton_A_27253,Cotton_A_10607,Cotton_A_05601 PANTOTHENATE_AND_COA_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00770 Pantothenate_and_CoA_biosynthesis ko00770 Pantothenate_and_CoA_biosynthesis Cotton_A_23009,Cotton_A_31266,Cotton_A_34452,Cotton_A_06109,Cotton_A_07638,Cotton_A_01489,Cotton_A_23050,Cotton_A_13089,Cotton_A_37575,Cotton_A_10179,Cotton_A_23917,Cotton_A_13754,Cotton_A_23934 VITAMIN_DIGESTION_AND_ABSORPTION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04977 Vitamin_digestion_and_absorption ko04977 Vitamin_digestion_and_absorption Cotton_A_02497 TAURINE_AND_HYPOTAURINE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00430 Taurine_and_hypotaurine_metabolism ko00430 Taurine_and_hypotaurine_metabolism Cotton_A_18594,Cotton_A_17596,Cotton_A_27252,Cotton_A_28999,Cotton_A_26511,Cotton_A_35537,Cotton_A_20054,Cotton_A_01910 VIBRIO_CHOLERAE_INFECTION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05110 Vibrio_cholerae_infection ko05110 Vibrio_cholerae_infection Cotton_A_27091,Cotton_A_15188,Cotton_A_15189,Cotton_A_30419,Cotton_A_32656,Cotton_A_12392,Cotton_A_17510 PYRIMIDINE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00240 Pyrimidine_metabolism ko00240 Pyrimidine_metabolism Cotton_A_08043,Cotton_A_13058,Cotton_A_08974,Cotton_A_00224,Cotton_A_40878,Cotton_A_09183,Cotton_A_12141,Cotton_A_12066,Cotton_A_16814,Cotton_A_13665,Cotton_A_03690,Cotton_A_04924,Cotton_A_27373,Cotton_A_11603,Cotton_A_08418,Cotton_A_06485,Cotton_A_02149,Cotton_A_07452,Cotton_A_12224,Cotton_A_17864,Cotton_A_06088,Cotton_A_01025,Cotton_A_13589,Cotton_A_38793,Cotton_A_13432,Cotton_A_36474,Cotton_A_23733,Cotton_A_15817,Cotton_A_13279,Cotton_A_09475,Cotton_A_09370,Cotton_A_03135,Cotton_A_14554,Cotton_A_23926,Cotton_A_15211,Cotton_A_19095,Cotton_A_31754,Cotton_A_03776,Cotton_A_13746,Cotton_A_26451,Cotton_A_12705,Cotton_A_02185,Cotton_A_12579,Cotton_A_30195,Cotton_A_06241,Cotton_A_06243,Cotton_A_38367,Cotton_A_10902 NUCLEOTIDE_EXCISION_REPAIR KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03420 Nucleotide_excision_repair ko03420 Nucleotide_excision_repair Cotton_A_13182,Cotton_A_12250,Cotton_A_21657,Cotton_A_17934,Cotton_A_20657,Cotton_A_19471,Cotton_A_22393 INOSITOL_PHOSPHATE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00562 Inositol_phosphate_metabolism ko00562 Inositol_phosphate_metabolism Cotton_A_20849,Cotton_A_06404,Cotton_A_39917,Cotton_A_39918,Cotton_A_00489,Cotton_A_41019,Cotton_A_00566,Cotton_A_23609,Cotton_A_05988,Cotton_A_08827,Cotton_A_04096,Cotton_A_16128,Cotton_A_24465,Cotton_A_20958,Cotton_A_07324,Cotton_A_27884,Cotton_A_35475,Cotton_A_09180,Cotton_A_27825,Cotton_A_35851,Cotton_A_07571,Cotton_A_16214,Cotton_A_07977,Cotton_A_01870,Cotton_A_35083,Cotton_A_33092,Cotton_A_05666,Cotton_A_14065,Cotton_A_28065,Cotton_A_25868,Cotton_A_08559,Cotton_A_04528,Cotton_A_07857,Cotton_A_37467,Cotton_A_27073,Cotton_A_29110,Cotton_A_24199,Cotton_A_21552,Cotton_A_15486,Cotton_A_26927,Cotton_A_10758,Cotton_A_26144,Cotton_A_16579,Cotton_A_19448,Cotton_A_20747,Cotton_A_06885,Cotton_A_13827,Cotton_A_13270,Cotton_A_19939,Cotton_A_20311,Cotton_A_39835,Cotton_A_01932,Cotton_A_21120,Cotton_A_21123,Cotton_A_13846,Cotton_A_06468,Cotton_A_15857,Cotton_A_12940,Cotton_A_12942,Cotton_A_12943,Cotton_A_12944,Cotton_A_11223,Cotton_A_24470 PRION_DISEASES KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05020 Prion_diseases ko05020 Prion_diseases Cotton_A_02335,Cotton_A_16613 GLYCOSAMINOGLYCAN_DEGRADATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00531 Glycosaminoglycan_degradation ko00531 Glycosaminoglycan_degradation Cotton_A_39781,Cotton_A_28950,Cotton_A_29681,Cotton_A_20725,Cotton_A_19101,Cotton_A_12970,Cotton_A_07302,Cotton_A_15879,Cotton_A_25112 PHOTOSYNTHESIS_-_ANTENNA_PROTEINS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00196 Photosynthesis_-_antenna_proteins ko00196 Photosynthesis_-_antenna_proteins Cotton_A_00897,Cotton_A_07525,Cotton_A_12953,Cotton_A_05683,Cotton_A_21026,Cotton_A_27171,Cotton_A_37652,Cotton_A_03733,Cotton_A_29994,Cotton_A_13401,Cotton_A_28682,Cotton_A_12362,Cotton_A_17558,Cotton_A_39244,Cotton_A_40062,Cotton_A_20878,Cotton_A_21688,Cotton_A_35627,Cotton_A_00312,Cotton_A_15875,Cotton_A_04531,Cotton_A_27360,Cotton_A_36449 PHENYLALANINE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00360 Phenylalanine_metabolism ko00360 Phenylalanine_metabolism Cotton_A_07846,Cotton_A_12086,Cotton_A_12478,Cotton_A_13096,Cotton_A_15442,Cotton_A_36307,Cotton_A_16449,Cotton_A_32599,Cotton_A_36217,Cotton_A_36691,Cotton_A_25132,Cotton_A_37129,Cotton_A_39374,Cotton_A_08729,Cotton_A_22834,Cotton_A_22835,Cotton_A_24174,Cotton_A_24175,Cotton_A_41036,Cotton_A_01533,Cotton_A_11599,Cotton_A_19224,Cotton_A_19460,Cotton_A_28176,Cotton_A_28610,Cotton_A_40753,Cotton_A_06005,Cotton_A_06359,Cotton_A_06419,Cotton_A_18230,Cotton_A_23460,Cotton_A_29391,Cotton_A_31530,Cotton_A_31531,Cotton_A_32877,Cotton_A_37871,Cotton_A_01150,Cotton_A_14678,Cotton_A_30716,Cotton_A_34146,Cotton_A_36159,Cotton_A_00134,Cotton_A_04162,Cotton_A_04163,Cotton_A_38788,Cotton_A_40054,Cotton_A_24297,Cotton_A_29791,Cotton_A_36396,Cotton_A_36397,Cotton_A_36398,Cotton_A_04072,Cotton_A_04661,Cotton_A_04686,Cotton_A_11302,Cotton_A_11452,Cotton_A_13869,Cotton_A_22566,Cotton_A_05819,Cotton_A_09755,Cotton_A_12595,Cotton_A_12596,Cotton_A_12597,Cotton_A_12599,Cotton_A_29727,Cotton_A_10391,Cotton_A_17393,Cotton_A_17497,Cotton_A_22223,Cotton_A_22224,Cotton_A_29628,Cotton_A_32362,Cotton_A_02009,Cotton_A_06224,Cotton_A_07879,Cotton_A_23666,Cotton_A_23668,Cotton_A_30788,Cotton_A_31063,Cotton_A_35302,Cotton_A_21231,Cotton_A_18071,Cotton_A_29611,Cotton_A_21540,Cotton_A_06366,Cotton_A_14133,Cotton_A_10762,Cotton_A_00465,Cotton_A_34186,Cotton_A_05527,Cotton_A_06683,Cotton_A_24051,Cotton_A_22913,Cotton_A_02864,Cotton_A_10501,Cotton_A_16906,Cotton_A_33287,Cotton_A_04232,Cotton_A_08577 MRNA_SURVEILLANCE_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03015 mRNA_surveillance_pathway ko03015 mRNA_surveillance_pathway Cotton_A_34538,Cotton_A_22456,Cotton_A_19661,Cotton_A_10962,Cotton_A_28957,Cotton_A_27766,Cotton_A_12837,Cotton_A_25108,Cotton_A_18510,Cotton_A_12898,Cotton_A_15309,Cotton_A_31408,Cotton_A_37348,Cotton_A_03420,Cotton_A_37727,Cotton_A_09192,Cotton_A_02533,Cotton_A_33195,Cotton_A_11994,Cotton_A_25797,Cotton_A_07587,Cotton_A_35752,Cotton_A_23251,Cotton_A_01401,Cotton_A_25369,Cotton_A_30966,Cotton_A_32383,Cotton_A_31541,Cotton_A_05611,Cotton_A_05428,Cotton_A_17472,Cotton_A_01477,Cotton_A_28328,Cotton_A_29196,Cotton_A_33884,Cotton_A_09292,Cotton_A_12829,Cotton_A_20082,Cotton_A_34511,Cotton_A_11132,Cotton_A_31641,Cotton_A_20442,Cotton_A_00481,Cotton_A_03546,Cotton_A_11584,Cotton_A_18694,Cotton_A_19951,Cotton_A_19952,Cotton_A_09425,Cotton_A_12278,Cotton_A_03101,Cotton_A_25673,Cotton_A_04553,Cotton_A_21673,Cotton_A_17932,Cotton_A_33509,Cotton_A_29005,Cotton_A_15170,Cotton_A_25363,Cotton_A_38683,Cotton_A_08731,Cotton_A_05591,Cotton_A_34296,Cotton_A_00340,Cotton_A_07298,Cotton_A_27534,Cotton_A_19402,Cotton_A_22122,Cotton_A_40830,Cotton_A_36184,Cotton_A_37679,Cotton_A_37681,Cotton_A_39719,Cotton_A_29452,Cotton_A_17720,Cotton_A_00318,Cotton_A_17295,Cotton_A_39313,Cotton_A_03620,Cotton_A_30738,Cotton_A_26831,Cotton_A_13630,Cotton_A_15803,Cotton_A_09341,Cotton_A_05712,Cotton_A_21576,Cotton_A_35471,Cotton_A_18641,Cotton_A_35587,Cotton_A_13382,Cotton_A_01300,Cotton_A_01253,Cotton_A_09059,Cotton_A_36045,Cotton_A_37101,Cotton_A_22193,Cotton_A_01563,Cotton_A_16178,Cotton_A_29976,Cotton_A_38338,Cotton_A_04511,Cotton_A_27268,Cotton_A_25255,Cotton_A_34873,Cotton_A_34874,Cotton_A_22861,Cotton_A_22864,Cotton_A_26976,Cotton_A_36804,Cotton_A_03689,Cotton_A_24362,Cotton_A_04633,Cotton_A_12102,Cotton_A_03268,Cotton_A_26212,Cotton_A_09222,Cotton_A_16764,Cotton_A_07600,Cotton_A_01779,Cotton_A_13271,Cotton_A_37824,Cotton_A_02591,Cotton_A_11008,Cotton_A_31683,Cotton_A_01115,Cotton_A_05765 AMYOTROPHIC_LATERAL_SCLEROSIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05014 Amyotrophic_lateral_sclerosis ko05014 Amyotrophic_lateral_sclerosis Cotton_A_08989,Cotton_A_29820,Cotton_A_00113,Cotton_A_09949 NON-HOMOLOGOUS_END-JOINING KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03450 Non-homologous_end-joining ko03450 Non-homologous_end-joining Cotton_A_27324,Cotton_A_14157,Cotton_A_07735,Cotton_A_38568 ERBB_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04012 ErbB_signaling_pathway ko04012 ErbB_signaling_pathway Cotton_A_15592,Cotton_A_32160,Cotton_A_24273,Cotton_A_04041,Cotton_A_12836,Cotton_A_27014,Cotton_A_10648,Cotton_A_17728,Cotton_A_22644,Cotton_A_00149,Cotton_A_24613 PATHOGENIC_ESCHERICHIA_COLI_INFECTION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05130 Pathogenic_Escherichia_coli_infection ko05130 Pathogenic_Escherichia_coli_infection Cotton_A_18615,Cotton_A_18616,Cotton_A_16017,Cotton_A_37054,Cotton_A_00105,Cotton_A_24266,Cotton_A_28705,Cotton_A_24048 CIRCADIAN_RHYTHM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04710 Circadian_rhythm ko04710 Circadian_rhythm Cotton_A_40982 RIBOSOME_BIOGENESIS_IN_EUKARYOTES KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03008 Ribosome_biogenesis_in_eukaryotes ko03008 Ribosome_biogenesis_in_eukaryotes Cotton_A_10986,Cotton_A_16853,Cotton_A_27513,Cotton_A_18589,Cotton_A_35216,Cotton_A_25706,Cotton_A_02926,Cotton_A_01887,Cotton_A_16414,Cotton_A_15001,Cotton_A_02625,Cotton_A_18742,Cotton_A_26605,Cotton_A_25890,Cotton_A_02424,Cotton_A_37423,Cotton_A_36607,Cotton_A_37356,Cotton_A_26933,Cotton_A_09759,Cotton_A_16833,Cotton_A_30154,Cotton_A_32945,Cotton_A_12013,Cotton_A_10524,Cotton_A_26127,Cotton_A_36137,Cotton_A_19600,Cotton_A_23178,Cotton_A_17616,Cotton_A_16032,Cotton_A_09152,Cotton_A_13174,Cotton_A_07181,Cotton_A_27716,Cotton_A_14648,Cotton_A_33409,Cotton_A_16557,Cotton_A_05324,Cotton_A_19967,Cotton_A_37300,Cotton_A_03199,Cotton_A_03602,Cotton_A_16916,Cotton_A_06000,Cotton_A_05575,Cotton_A_26633,Cotton_A_23519,Cotton_A_32163,Cotton_A_04673,Cotton_A_25194,Cotton_A_24559,Cotton_A_13791,Cotton_A_19919,Cotton_A_01924,Cotton_A_15016,Cotton_A_22417,Cotton_A_16859,Cotton_A_14361,Cotton_A_14627,Cotton_A_18547,Cotton_A_10444,Cotton_A_34787,Cotton_A_13103,Cotton_A_25891,Cotton_A_13682,Cotton_A_32007,Cotton_A_02958,Cotton_A_02162,Cotton_A_18901,Cotton_A_19744,Cotton_A_08183,Cotton_A_29175,Cotton_A_32477,Cotton_A_19601 TERPENOID_BACKBONE_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00900 Terpenoid_backbone_biosynthesis ko00900 Terpenoid_backbone_biosynthesis Cotton_A_09010,Cotton_A_09011,Cotton_A_09012,Cotton_A_09013,Cotton_A_32287,Cotton_A_00117,Cotton_A_28220,Cotton_A_15768,Cotton_A_08638,Cotton_A_07637,Cotton_A_13078,Cotton_A_33139,Cotton_A_20856,Cotton_A_17179,Cotton_A_24614,Cotton_A_05120,Cotton_A_30720,Cotton_A_14604,Cotton_A_06494,Cotton_A_04623,Cotton_A_21759,Cotton_A_04799,Cotton_A_12164,Cotton_A_17013,Cotton_A_02023,Cotton_A_09539,Cotton_A_02930,Cotton_A_10205,Cotton_A_36810,Cotton_A_34233,Cotton_A_02494,Cotton_A_21115,Cotton_A_28651,Cotton_A_28272,Cotton_A_02166,Cotton_A_17187,Cotton_A_10981,Cotton_A_13281,Cotton_A_04201,Cotton_A_07939,Cotton_A_38581,Cotton_A_12191,Cotton_A_35779,Cotton_A_31652,Cotton_A_15121,Cotton_A_01042,Cotton_A_31118,Cotton_A_05787 FLAVONOID_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00941 Flavonoid_biosynthesis ko00941 Flavonoid_biosynthesis Cotton_A_07865,Cotton_A_06838,Cotton_A_04716,Cotton_A_19363,Cotton_A_11375,Cotton_A_35983,Cotton_A_09953,Cotton_A_15985,Cotton_A_15987,Cotton_A_16120,Cotton_A_13353,Cotton_A_23720,Cotton_A_23722,Cotton_A_34464,Cotton_A_01395,Cotton_A_24547,Cotton_A_12751,Cotton_A_39984,Cotton_A_35286,Cotton_A_35287,Cotton_A_00927 HIPPO_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04390 Hippo_signaling_pathway ko04390 Hippo_signaling_pathway Cotton_A_02824,Cotton_A_02837,Cotton_A_24799,Cotton_A_23631,Cotton_A_40808,Cotton_A_23951,Cotton_A_29407,Cotton_A_26496,Cotton_A_26512,Cotton_A_00137,Cotton_A_29371,Cotton_A_26828,Cotton_A_29484,Cotton_A_11278,Cotton_A_27589,Cotton_A_36037,Cotton_A_38200,Cotton_A_25173,Cotton_A_14278,Cotton_A_09187,Cotton_A_07953 SPLICEOSOME KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03040 Spliceosome ko03040 Spliceosome Cotton_A_10228,Cotton_A_21997,Cotton_A_08233,Cotton_A_16943,Cotton_A_24992,Cotton_A_28829,Cotton_A_22430,Cotton_A_20156,Cotton_A_16909,Cotton_A_13415,Cotton_A_10177,Cotton_A_25538,Cotton_A_22958,Cotton_A_40205,Cotton_A_38383,Cotton_A_23360,Cotton_A_32101,Cotton_A_30050,Cotton_A_12031,Cotton_A_12489,Cotton_A_10486,Cotton_A_22954,Cotton_A_00363,Cotton_A_05547,Cotton_A_17119,Cotton_A_18546,Cotton_A_27801,Cotton_A_06984,Cotton_A_20954,Cotton_A_23362,Cotton_A_25769,Cotton_A_09079,Cotton_A_11926,Cotton_A_11787,Cotton_A_13362,Cotton_A_29741,Cotton_A_11192,Cotton_A_33909,Cotton_A_15064,Cotton_A_10218,Cotton_A_24637,Cotton_A_06200,Cotton_A_22064,Cotton_A_08755,Cotton_A_11531,Cotton_A_08445,Cotton_A_05435,Cotton_A_36033,Cotton_A_17460,Cotton_A_01976,Cotton_A_12585,Cotton_A_12587,Cotton_A_24485,Cotton_A_23925,Cotton_A_00101,Cotton_A_28703,Cotton_A_14577,Cotton_A_11399,Cotton_A_20244,Cotton_A_15137,Cotton_A_10168,Cotton_A_10646,Cotton_A_22855,Cotton_A_02575,Cotton_A_34826,Cotton_A_31097,Cotton_A_30104,Cotton_A_26974,Cotton_A_40291,Cotton_A_18157,Cotton_A_04281,Cotton_A_20124,Cotton_A_07043,Cotton_A_22297,Cotton_A_03266,Cotton_A_05114,Cotton_A_29989,Cotton_A_38392,Cotton_A_13409,Cotton_A_08111,Cotton_A_23299,Cotton_A_22383,Cotton_A_31858,Cotton_A_24168,Cotton_A_29396,Cotton_A_00804,Cotton_A_12648,Cotton_A_01339,Cotton_A_25880,Cotton_A_24839,Cotton_A_26188,Cotton_A_35063,Cotton_A_00423,Cotton_A_32617,Cotton_A_01134,Cotton_A_00922,Cotton_A_09110,Cotton_A_17026,Cotton_A_13976,Cotton_A_20692,Cotton_A_08268,Cotton_A_25251,Cotton_A_06394,Cotton_A_32610,Cotton_A_04583,Cotton_A_05030,Cotton_A_04172,Cotton_A_22832,Cotton_A_29730,Cotton_A_08088,Cotton_A_40915,Cotton_A_15804,Cotton_A_28925,Cotton_A_15407,Cotton_A_15913,Cotton_A_15153,Cotton_A_27251,Cotton_A_17021,Cotton_A_15050,Cotton_A_02587,Cotton_A_21131,Cotton_A_07051,Cotton_A_38985,Cotton_A_20688,Cotton_A_26004,Cotton_A_06100,Cotton_A_19009,Cotton_A_28809,Cotton_A_29101,Cotton_A_10244,Cotton_A_40014,Cotton_A_40455,Cotton_A_33633,Cotton_A_30624,Cotton_A_12730,Cotton_A_29638,Cotton_A_28539,Cotton_A_14611,Cotton_A_31044,Cotton_A_02964,Cotton_A_12485,Cotton_A_04361,Cotton_A_06820,Cotton_A_04759,Cotton_A_14828,Cotton_A_26189,Cotton_A_15163,Cotton_A_15796,Cotton_A_32614,Cotton_A_17437,Cotton_A_28887,Cotton_A_26279,Cotton_A_02630,Cotton_A_17988,Cotton_A_32044,Cotton_A_07482,Cotton_A_23772,Cotton_A_34846,Cotton_A_00107,Cotton_A_22569,Cotton_A_35280,Cotton_A_04928,Cotton_A_09934,Cotton_A_18489,Cotton_A_05033,Cotton_A_25473,Cotton_A_03301,Cotton_A_09301,Cotton_A_12834,Cotton_A_35671,Cotton_A_18034,Cotton_A_04855,Cotton_A_02143,Cotton_A_21331,Cotton_A_14303,Cotton_A_18852,Cotton_A_18854,Cotton_A_25582,Cotton_A_21738,Cotton_A_08879,Cotton_A_28746,Cotton_A_05777,Cotton_A_36874,Cotton_A_18995,Cotton_A_25737,Cotton_A_09777,Cotton_A_11234,Cotton_A_11235,Cotton_A_07670,Cotton_A_27004,Cotton_A_01786,Cotton_A_02585,Cotton_A_11034,Cotton_A_20247,Cotton_A_22802,Cotton_A_07434,Cotton_A_10545,Cotton_A_31325,Cotton_A_12699,Cotton_A_18530,Cotton_A_21430,Cotton_A_35005,Cotton_A_29755,Cotton_A_16965,Cotton_A_19554,Cotton_A_22449,Cotton_A_36418 RIBOFLAVIN_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00740 Riboflavin_metabolism ko00740 Riboflavin_metabolism Cotton_A_23005,Cotton_A_07760,Cotton_A_02418,Cotton_A_25589,Cotton_A_24804,Cotton_A_29408,Cotton_A_02234 AMPK_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04152 AMPK_signaling_pathway ko04152 AMPK_signaling_pathway Cotton_A_13291,Cotton_A_11042,Cotton_A_11958,Cotton_A_35644,Cotton_A_11569,Cotton_A_32986,Cotton_A_37980,Cotton_A_16189,Cotton_A_12018,Cotton_A_10540,Cotton_A_00411,Cotton_A_00931,Cotton_A_27789,Cotton_A_32134,Cotton_A_06994,Cotton_A_15891,Cotton_A_21922,Cotton_A_29354,Cotton_A_32244,Cotton_A_33067,Cotton_A_33583,Cotton_A_08490,Cotton_A_04638,Cotton_A_03269,Cotton_A_07287,Cotton_A_07288,Cotton_A_22758,Cotton_A_33501,Cotton_A_03058,Cotton_A_09781,Cotton_A_10831,Cotton_A_14859,Cotton_A_16280,Cotton_A_16286,Cotton_A_37669,Cotton_A_22735,Cotton_A_12802,Cotton_A_08702,Cotton_A_11515,Cotton_A_25189,Cotton_A_24587 ANTHOCYANIN_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00942 Anthocyanin_biosynthesis ko00942 Anthocyanin_biosynthesis Cotton_A_28822,Cotton_A_25284 TRYPTOPHAN_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00380 Tryptophan_metabolism ko00380 Tryptophan_metabolism Cotton_A_01713,Cotton_A_11068,Cotton_A_11157,Cotton_A_40084,Cotton_A_05899,Cotton_A_07219,Cotton_A_35547,Cotton_A_39685,Cotton_A_01281,Cotton_A_09510,Cotton_A_11519,Cotton_A_22542,Cotton_A_34385,Cotton_A_40633,Cotton_A_33454,Cotton_A_35861,Cotton_A_02978,Cotton_A_37971,Cotton_A_13075,Cotton_A_23789 GLYCEROLIPID_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00561 Glycerolipid_metabolism ko00561 Glycerolipid_metabolism Cotton_A_09184,Cotton_A_25400,Cotton_A_09737,Cotton_A_00592,Cotton_A_08860,Cotton_A_02486,Cotton_A_18440,Cotton_A_19822,Cotton_A_25468,Cotton_A_36957,Cotton_A_39465,Cotton_A_20607,Cotton_A_21450,Cotton_A_24308,Cotton_A_24431,Cotton_A_30920,Cotton_A_05717,Cotton_A_04893,Cotton_A_01233,Cotton_A_06880,Cotton_A_17180,Cotton_A_07803,Cotton_A_15334,Cotton_A_28721,Cotton_A_09547,Cotton_A_06686,Cotton_A_34355,Cotton_A_19223,Cotton_A_03053,Cotton_A_11479,Cotton_A_21482,Cotton_A_29135,Cotton_A_02286,Cotton_A_00333,Cotton_A_39280,Cotton_A_35675,Cotton_A_16891,Cotton_A_19108,Cotton_A_28153,Cotton_A_21838,Cotton_A_02513,Cotton_A_13360,Cotton_A_02447,Cotton_A_37523,Cotton_A_30696,Cotton_A_06939,Cotton_A_08641,Cotton_A_37042 SYNAPTIC_VESICLE_CYCLE KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04721 Synaptic_vesicle_cycle ko04721 Synaptic_vesicle_cycle Cotton_A_09926,Cotton_A_24391,Cotton_A_07091,Cotton_A_11580,Cotton_A_20644,Cotton_A_16192 PLANT-PATHOGEN_INTERACTION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04626 Plant-pathogen_interaction ko04626 Plant-pathogen_interaction Cotton_A_02412,Cotton_A_31263,Cotton_A_17778,Cotton_A_32721,Cotton_A_03426,Cotton_A_04174,Cotton_A_13752,Cotton_A_03631,Cotton_A_16216,Cotton_A_29320,Cotton_A_33534,Cotton_A_38536,Cotton_A_18772,Cotton_A_07974,Cotton_A_01782,Cotton_A_01819,Cotton_A_07814,Cotton_A_16634,Cotton_A_33650,Cotton_A_36453,Cotton_A_39976,Cotton_A_08792,Cotton_A_27334,Cotton_A_01559,Cotton_A_23725,Cotton_A_30001,Cotton_A_03493,Cotton_A_17593,Cotton_A_18224,Cotton_A_28267,Cotton_A_37709,Cotton_A_05577,Cotton_A_19365,Cotton_A_39947,Cotton_A_04790,Cotton_A_04955,Cotton_A_32963,Cotton_A_00840,Cotton_A_09202,Cotton_A_15551,Cotton_A_20526,Cotton_A_02586,Cotton_A_04013,Cotton_A_11040,Cotton_A_23177,Cotton_A_31216,Cotton_A_31597,Cotton_A_11979,Cotton_A_10433,Cotton_A_23073,Cotton_A_24177,Cotton_A_25635,Cotton_A_21959,Cotton_A_19137,Cotton_A_14155,Cotton_A_14232,Cotton_A_29841,Cotton_A_00040,Cotton_A_00041,Cotton_A_25487,Cotton_A_16130,Cotton_A_25919,Cotton_A_15069,Cotton_A_34796,Cotton_A_08464,Cotton_A_12282,Cotton_A_21989,Cotton_A_28468,Cotton_A_07630,Cotton_A_13101,Cotton_A_40722,Cotton_A_35064,Cotton_A_00463,Cotton_A_34316,Cotton_A_20363,Cotton_A_23446,Cotton_A_01232,Cotton_A_04255,Cotton_A_39981,Cotton_A_09073,Cotton_A_39791,Cotton_A_17091,Cotton_A_01884,Cotton_A_07607,Cotton_A_18055,Cotton_A_29835,Cotton_A_24847,Cotton_A_27511,Cotton_A_15366,Cotton_A_22911,Cotton_A_34476,Cotton_A_37077,Cotton_A_08363,Cotton_A_01690,Cotton_A_11595,Cotton_A_12237,Cotton_A_12239,Cotton_A_15220,Cotton_A_18598,Cotton_A_19925,Cotton_A_30755,Cotton_A_32650,Cotton_A_40106,Cotton_A_08191,Cotton_A_09239,Cotton_A_12511,Cotton_A_12512,Cotton_A_06884,Cotton_A_33135,Cotton_A_36388,Cotton_A_29781,Cotton_A_32432,Cotton_A_16482,Cotton_A_09731,Cotton_A_07432,Cotton_A_17347,Cotton_A_21155,Cotton_A_35710,Cotton_A_40109,Cotton_A_01434,Cotton_A_01912,Cotton_A_01926,Cotton_A_07096,Cotton_A_07927,Cotton_A_20219,Cotton_A_25786,Cotton_A_30305,Cotton_A_15175,Cotton_A_05095,Cotton_A_07944,Cotton_A_21596,Cotton_A_09350,Cotton_A_28307,Cotton_A_37941,Cotton_A_05234,Cotton_A_34260,Cotton_A_00075,Cotton_A_21665,Cotton_A_29288,Cotton_A_11800,Cotton_A_05659 GLYCEROPHOSPHOLIPID_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00564 Glycerophospholipid_metabolism ko00564 Glycerophospholipid_metabolism Cotton_A_18371,Cotton_A_08402,Cotton_A_30322,Cotton_A_39153,Cotton_A_34852,Cotton_A_01438,Cotton_A_27737,Cotton_A_03374,Cotton_A_10949,Cotton_A_06875,Cotton_A_18777,Cotton_A_26133,Cotton_A_31853,Cotton_A_36221,Cotton_A_26807,Cotton_A_20748,Cotton_A_30358,Cotton_A_17440,Cotton_A_28028,Cotton_A_28885,Cotton_A_04291,Cotton_A_27330,Cotton_A_34216,Cotton_A_29916,Cotton_A_12300,Cotton_A_08483,Cotton_A_04934,Cotton_A_04644,Cotton_A_06783,Cotton_A_11733,Cotton_A_32843,Cotton_A_24833,Cotton_A_00920,Cotton_A_29118,Cotton_A_23028,Cotton_A_25508,Cotton_A_29757,Cotton_A_23472,Cotton_A_11110,Cotton_A_17448,Cotton_A_03084,Cotton_A_04653,Cotton_A_05322,Cotton_A_11805,Cotton_A_06342,Cotton_A_06343,Cotton_A_27001,Cotton_A_28309,Cotton_A_28518,Cotton_A_01522,Cotton_A_07260,Cotton_A_03378,Cotton_A_10711,Cotton_A_10944,Cotton_A_17807,Cotton_A_28560,Cotton_A_09962,Cotton_A_19886,Cotton_A_10805,Cotton_A_19212,Cotton_A_19122,Cotton_A_27507,Cotton_A_24260,Cotton_A_30587,Cotton_A_15784 ENDOCYTOSIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04144 Endocytosis ko04144 Endocytosis Cotton_A_07592,Cotton_A_16550,Cotton_A_23819,Cotton_A_34292,Cotton_A_19873,Cotton_A_35369,Cotton_A_05835,Cotton_A_10246,Cotton_A_20223,Cotton_A_31298,Cotton_A_28942,Cotton_A_00748,Cotton_A_14174,Cotton_A_19388,Cotton_A_20743,Cotton_A_10815,Cotton_A_37909,Cotton_A_07606,Cotton_A_07787,Cotton_A_39838,Cotton_A_19688,Cotton_A_23898,Cotton_A_15207,Cotton_A_19658,Cotton_A_24321,Cotton_A_08493,Cotton_A_31726,Cotton_A_39542,Cotton_A_35313,Cotton_A_05005,Cotton_A_05023,Cotton_A_20103,Cotton_A_27769,Cotton_A_39108,Cotton_A_23166,Cotton_A_25114,Cotton_A_26094,Cotton_A_12398,Cotton_A_26380,Cotton_A_34035,Cotton_A_13004,Cotton_A_21411,Cotton_A_03936,Cotton_A_23094,Cotton_A_33635,Cotton_A_01433,Cotton_A_10864,Cotton_A_17723,Cotton_A_35853,Cotton_A_23814,Cotton_A_11529,Cotton_A_08448,Cotton_A_19834,Cotton_A_35401,Cotton_A_21880,Cotton_A_23265,Cotton_A_38017,Cotton_A_12590,Cotton_A_32229,Cotton_A_05963,Cotton_A_26799,Cotton_A_17647,Cotton_A_04975,Cotton_A_03845,Cotton_A_38506,Cotton_A_05512,Cotton_A_04776,Cotton_A_25394,Cotton_A_09685,Cotton_A_06654,Cotton_A_05706,Cotton_A_06691,Cotton_A_28329,Cotton_A_29197,Cotton_A_06091,Cotton_A_04225,Cotton_A_28842,Cotton_A_09389,Cotton_A_03126,Cotton_A_14542,Cotton_A_25460,Cotton_A_26288,Cotton_A_13891,Cotton_A_05215,Cotton_A_05418,Cotton_A_17480,Cotton_A_34719,Cotton_A_10434,Cotton_A_22613,Cotton_A_25622,Cotton_A_25623,Cotton_A_13835,Cotton_A_10139,Cotton_A_35108,Cotton_A_00992,Cotton_A_08475,Cotton_A_04829,Cotton_A_14813,Cotton_A_10005,Cotton_A_22812,Cotton_A_00050,Cotton_A_21094,Cotton_A_23125,Cotton_A_09164,Cotton_A_30953,Cotton_A_23903,Cotton_A_11891,Cotton_A_23086,Cotton_A_06594,Cotton_A_12123,Cotton_A_39940,Cotton_A_04894,Cotton_A_17944,Cotton_A_13635,Cotton_A_15040,Cotton_A_10240,Cotton_A_22197,Cotton_A_12027,Cotton_A_00398,Cotton_A_34419,Cotton_A_23113,Cotton_A_09169,Cotton_A_07909,Cotton_A_07741,Cotton_A_28261,Cotton_A_23015,Cotton_A_15769,Cotton_A_11146,Cotton_A_22077,Cotton_A_18316,Cotton_A_11753 MEASLES KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05162 Measles ko05162 Measles Cotton_A_13043,Cotton_A_01427 HEDGEHOG_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04340 Hedgehog_signaling_pathway ko04340 Hedgehog_signaling_pathway Cotton_A_09354,Cotton_A_05716,Cotton_A_03143,Cotton_A_02684,Cotton_A_06082 TROPANE,_PIPERIDINE_AND_PYRIDINE_ALKALOID_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00960 Tropane,_piperidine_and_pyridine_alkaloid_biosynthesis ko00960 Tropane,_piperidine_and_pyridine_alkaloid_biosynthesis Cotton_A_12060,Cotton_A_20030,Cotton_A_20031,Cotton_A_20036,Cotton_A_20037,Cotton_A_31716,Cotton_A_37987,Cotton_A_12893,Cotton_A_12894 CIRCADIAN_RHYTHM_-_PLANT KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04712 Circadian_rhythm_-_plant ko04712 Circadian_rhythm_-_plant Cotton_A_35371,Cotton_A_20224,Cotton_A_16920,Cotton_A_06728,Cotton_A_20172,Cotton_A_12242,Cotton_A_15659,Cotton_A_26408,Cotton_A_29626,Cotton_A_03702,Cotton_A_21298,Cotton_A_22401,Cotton_A_05605,Cotton_A_05606,Cotton_A_05413,Cotton_A_02454,Cotton_A_29955,Cotton_A_05538,Cotton_A_07019,Cotton_A_02371,Cotton_A_20332,Cotton_A_15652,Cotton_A_38950,Cotton_A_30360,Cotton_A_10397,Cotton_A_23627,Cotton_A_05062,Cotton_A_10622,Cotton_A_05804,Cotton_A_14379,Cotton_A_23192 CARBON_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko01200 Carbon_metabolism ko01200 Carbon_metabolism Cotton_A_09392,Cotton_A_18087,Cotton_A_22242,Cotton_A_11205,Cotton_A_31552,Cotton_A_03603,Cotton_A_05595,Cotton_A_03123,Cotton_A_04622,Cotton_A_34630,Cotton_A_07210,Cotton_A_29103,Cotton_A_32359,Cotton_A_18958,Cotton_A_35160,Cotton_A_02576,Cotton_A_11007,Cotton_A_27456,Cotton_A_02822,Cotton_A_02823,Cotton_A_35515,Cotton_A_28595,Cotton_A_29663,Cotton_A_27799,Cotton_A_07364,Cotton_A_22450,Cotton_A_06357,Cotton_A_36417,Cotton_A_16744,Cotton_A_29990,Cotton_A_20125,Cotton_A_26207,Cotton_A_22294,Cotton_A_34770,Cotton_A_09811,Cotton_A_24119,Cotton_A_30833,Cotton_A_21479,Cotton_A_22254,Cotton_A_38972,Cotton_A_07191,Cotton_A_10322,Cotton_A_20468,Cotton_A_34083,Cotton_A_08855,Cotton_A_24052,Cotton_A_02097,Cotton_A_11394,Cotton_A_28979,Cotton_A_02182,Cotton_A_16173,Cotton_A_25815,Cotton_A_23186,Cotton_A_03293,Cotton_A_25611,Cotton_A_31639,Cotton_A_11585,Cotton_A_03701,Cotton_A_10649,Cotton_A_00037,Cotton_A_26960,Cotton_A_03737,Cotton_A_18928,Cotton_A_06084,Cotton_A_14869,Cotton_A_20989,Cotton_A_06373,Cotton_A_10755,Cotton_A_28871,Cotton_A_07247,Cotton_A_01179,Cotton_A_01250,Cotton_A_31637,Cotton_A_11587,Cotton_A_24086,Cotton_A_09427,Cotton_A_25683,Cotton_A_32255,Cotton_A_01920,Cotton_A_22720,Cotton_A_12676,Cotton_A_04608,Cotton_A_07523,Cotton_A_20834,Cotton_A_06438,Cotton_A_19312,Cotton_A_15651,Cotton_A_31885,Cotton_A_26420,Cotton_A_38106,Cotton_A_05287,Cotton_A_00043,Cotton_A_12338,Cotton_A_04498,Cotton_A_15927,Cotton_A_01621,Cotton_A_14770,Cotton_A_11575,Cotton_A_24073,Cotton_A_40896,Cotton_A_04842,Cotton_A_38641,Cotton_A_14005,Cotton_A_07388,Cotton_A_34591,Cotton_A_10560,Cotton_A_16542,Cotton_A_08741,Cotton_A_07389,Cotton_A_30963,Cotton_A_32378,Cotton_A_00758,Cotton_A_25484,Cotton_A_06667,Cotton_A_32636,Cotton_A_16140,Cotton_A_36260,Cotton_A_30530,Cotton_A_25528,Cotton_A_04672,Cotton_A_27945,Cotton_A_03357,Cotton_A_07727,Cotton_A_16608,Cotton_A_24948,Cotton_A_17123,Cotton_A_03709,Cotton_A_04911,Cotton_A_05242,Cotton_A_02678,Cotton_A_33505,Cotton_A_04552,Cotton_A_01497,Cotton_A_06544,Cotton_A_03132,Cotton_A_38000,Cotton_A_25529,Cotton_A_12154,Cotton_A_06777,Cotton_A_09478,Cotton_A_11331,Cotton_A_19906,Cotton_A_12422,Cotton_A_19765,Cotton_A_12875,Cotton_A_28777,Cotton_A_32085,Cotton_A_16863,Cotton_A_07474,Cotton_A_21445,Cotton_A_25361,Cotton_A_18105,Cotton_A_18260,Cotton_A_03111,Cotton_A_02574,Cotton_A_05405,Cotton_A_17508,Cotton_A_10839,Cotton_A_07947,Cotton_A_36969,Cotton_A_21636,Cotton_A_00509,Cotton_A_00510,Cotton_A_39776,Cotton_A_08996,Cotton_A_40812,Cotton_A_04138,Cotton_A_09160,Cotton_A_28234,Cotton_A_02511,Cotton_A_16473,Cotton_A_39191,Cotton_A_33510,Cotton_A_36514,Cotton_A_17763,Cotton_A_24612,Cotton_A_33272,Cotton_A_33273,Cotton_A_24064,Cotton_A_30841,Cotton_A_13138,Cotton_A_07890,Cotton_A_33914,Cotton_A_19267,Cotton_A_34177,Cotton_A_38049,Cotton_A_19211,Cotton_A_31006,Cotton_A_07699,Cotton_A_38256,Cotton_A_01168,Cotton_A_12305,Cotton_A_03103,Cotton_A_15362,Cotton_A_19116,Cotton_A_08849,Cotton_A_30031,Cotton_A_05568,Cotton_A_29637,Cotton_A_15819,Cotton_A_13552,Cotton_A_16832,Cotton_A_20580,Cotton_A_35153,Cotton_A_23153,Cotton_A_20154,Cotton_A_35295,Cotton_A_38209,Cotton_A_36255,Cotton_A_36640,Cotton_A_12540,Cotton_A_12541,Cotton_A_04143,Cotton_A_22555,Cotton_A_29908,Cotton_A_35667,Cotton_A_38767,Cotton_A_00523,Cotton_A_10372,Cotton_A_39345,Cotton_A_02150,Cotton_A_19760,Cotton_A_30937,Cotton_A_11360,Cotton_A_22837,Cotton_A_39744,Cotton_A_26234,Cotton_A_01527,Cotton_A_12165,Cotton_A_25001,Cotton_A_06232,Cotton_A_11386,Cotton_A_13449,Cotton_A_20025,Cotton_A_00516,Cotton_A_03553,Cotton_A_39492,Cotton_A_35218,Cotton_A_21644,Cotton_A_38115,Cotton_A_02697,Cotton_A_11596,Cotton_A_13394,Cotton_A_33732,Cotton_A_08907,Cotton_A_18565,Cotton_A_23363,Cotton_A_06974,Cotton_A_36070,Cotton_A_34809,Cotton_A_28099,Cotton_A_14976,Cotton_A_16867,Cotton_A_20195,Cotton_A_02789,Cotton_A_33535,Cotton_A_27590,Cotton_A_33785,Cotton_A_37023,Cotton_A_29780,Cotton_A_16357,Cotton_A_33113,Cotton_A_30792,Cotton_A_15587,Cotton_A_06037,Cotton_A_08967,Cotton_A_26489,Cotton_A_28324,Cotton_A_05989,Cotton_A_07308,Cotton_A_11687,Cotton_A_30019,Cotton_A_31991,Cotton_A_14712,Cotton_A_38676,Cotton_A_18292,Cotton_A_23281,Cotton_A_30415 BASE_EXCISION_REPAIR KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03410 Base_excision_repair ko03410 Base_excision_repair Cotton_A_32771,Cotton_A_23293,Cotton_A_13887,Cotton_A_36006,Cotton_A_41105,Cotton_A_29546,Cotton_A_13730,Cotton_A_25754,Cotton_A_01228,Cotton_A_12701,Cotton_A_09070,Cotton_A_17085,Cotton_A_06215,Cotton_A_13764,Cotton_A_01607,Cotton_A_18769,Cotton_A_39569,Cotton_A_07530,Cotton_A_20226,Cotton_A_26961,Cotton_A_12805,Cotton_A_14746,Cotton_A_19367,Cotton_A_23067,Cotton_A_26584,Cotton_A_35244,Cotton_A_02493,Cotton_A_00313,Cotton_A_12660,Cotton_A_37201 HISTIDINE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00340 Histidine_metabolism ko00340 Histidine_metabolism Cotton_A_15316,Cotton_A_12732,Cotton_A_31389,Cotton_A_17490 PHAGOSOME KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04145 Phagosome ko04145 Phagosome Cotton_A_24731,Cotton_A_38144,Cotton_A_20863,Cotton_A_34155,Cotton_A_27308,Cotton_A_38233,Cotton_A_06395,Cotton_A_07680,Cotton_A_13983,Cotton_A_30468,Cotton_A_27830,Cotton_A_19991,Cotton_A_02475,Cotton_A_38860,Cotton_A_16425,Cotton_A_20026,Cotton_A_13288,Cotton_A_18250,Cotton_A_14308,Cotton_A_11639,Cotton_A_11640,Cotton_A_11642,Cotton_A_29022,Cotton_A_25973,Cotton_A_25989,Cotton_A_12909 TYROSINE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00350 Tyrosine_metabolism ko00350 Tyrosine_metabolism Cotton_A_20104,Cotton_A_34221,Cotton_A_04932,Cotton_A_04642,Cotton_A_17809,Cotton_A_28594,Cotton_A_37695,Cotton_A_33397,Cotton_A_00092,Cotton_A_00093,Cotton_A_12811,Cotton_A_23859,Cotton_A_40149,Cotton_A_00291 CAROTENOID_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00906 Carotenoid_biosynthesis ko00906 Carotenoid_biosynthesis Cotton_A_01010,Cotton_A_11066,Cotton_A_36228,Cotton_A_14988,Cotton_A_12871,Cotton_A_18131,Cotton_A_07348,Cotton_A_36562,Cotton_A_24798,Cotton_A_27981,Cotton_A_21913,Cotton_A_12339,Cotton_A_02903,Cotton_A_07971,Cotton_A_06356,Cotton_A_22265,Cotton_A_07199,Cotton_A_24363,Cotton_A_00796,Cotton_A_34379,Cotton_A_14255,Cotton_A_30647,Cotton_A_32436,Cotton_A_08648,Cotton_A_13569,Cotton_A_01286,Cotton_A_27296,Cotton_A_05513,Cotton_A_26341,Cotton_A_14731,Cotton_A_36110,Cotton_A_12202,Cotton_A_29856,Cotton_A_34612,Cotton_A_34115,Cotton_A_05959,Cotton_A_26267,Cotton_A_09351,Cotton_A_20533 THYROID_HORMONE_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04919 Thyroid_hormone_signaling_pathway ko04919 Thyroid_hormone_signaling_pathway Cotton_A_00894,Cotton_A_23417,Cotton_A_11099,Cotton_A_28025,Cotton_A_16877,Cotton_A_05806,Cotton_A_02291,Cotton_A_29265,Cotton_A_19310,Cotton_A_37890,Cotton_A_20612,Cotton_A_11397 OTHER_TYPES_OF_O-GLYCAN_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00514 Other_types_of_O-glycan_biosynthesis ko00514 Other_types_of_O-glycan_biosynthesis Cotton_A_26887,Cotton_A_08570,Cotton_A_36485,Cotton_A_12817,Cotton_A_24443,Cotton_A_27619,Cotton_A_26653 FAT_DIGESTION_AND_ABSORPTION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04975 Fat_digestion_and_absorption ko04975 Fat_digestion_and_absorption Cotton_A_10910,Cotton_A_10911,Cotton_A_10912,Cotton_A_10913 MICRORNAS_IN_CANCER KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05206 MicroRNAs_in_cancer ko05206 MicroRNAs_in_cancer Cotton_A_30141,Cotton_A_22051,Cotton_A_14097,Cotton_A_01271,Cotton_A_31241,Cotton_A_34031,Cotton_A_34032,Cotton_A_38486,Cotton_A_38487,Cotton_A_34349 STEROID_HORMONE_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00140 Steroid_hormone_biosynthesis ko00140 Steroid_hormone_biosynthesis Cotton_A_10123 GLYCOSAMINOGLYCAN_BIOSYNTHESIS_-_HEPARAN_SULFATE_/_HEPARIN KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00534 Glycosaminoglycan_biosynthesis_-_heparan_sulfate_/_heparin ko00534 Glycosaminoglycan_biosynthesis_-_heparan_sulfate_/_heparin Cotton_A_03060 RIBOSOME KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03010 Ribosome ko03010 Ribosome Cotton_A_01816,Cotton_A_19096,Cotton_A_29796,Cotton_A_09331,Cotton_A_05702,Cotton_A_14040,Cotton_A_08352,Cotton_A_16500,Cotton_A_35569,Cotton_A_19769,Cotton_A_19770,Cotton_A_00298,Cotton_A_03440,Cotton_A_05181,Cotton_A_22324,Cotton_A_16383,Cotton_A_15400,Cotton_A_11182,Cotton_A_38609,Cotton_A_02829,Cotton_A_11185,Cotton_A_29406,Cotton_A_36160,Cotton_A_26829,Cotton_A_35301,Cotton_A_07591,Cotton_A_37235,Cotton_A_29986,Cotton_A_34290,Cotton_A_39234,Cotton_A_06580,Cotton_A_15528,Cotton_A_12104,Cotton_A_03242,Cotton_A_03246,Cotton_A_06787,Cotton_A_18196,Cotton_A_19846,Cotton_A_09218,Cotton_A_16154,Cotton_A_11683,Cotton_A_27297,Cotton_A_08391,Cotton_A_03044,Cotton_A_20183,Cotton_A_27485,Cotton_A_39876,Cotton_A_32828,Cotton_A_01251,Cotton_A_09062,Cotton_A_27942,Cotton_A_07730,Cotton_A_21599,Cotton_A_24395,Cotton_A_01380,Cotton_A_01381,Cotton_A_21618,Cotton_A_40773,Cotton_A_05470,Cotton_A_22574,Cotton_A_40257,Cotton_A_08371,Cotton_A_05981,Cotton_A_32544,Cotton_A_38500,Cotton_A_09383,Cotton_A_10541,Cotton_A_31321,Cotton_A_27988,Cotton_A_02244,Cotton_A_14547,Cotton_A_10454,Cotton_A_29610,Cotton_A_21542,Cotton_A_06367,Cotton_A_00184,Cotton_A_31110,Cotton_A_11546,Cotton_A_08436,Cotton_A_16180,Cotton_A_36220,Cotton_A_10396,Cotton_A_29809,Cotton_A_27905,Cotton_A_36203,Cotton_A_05849,Cotton_A_07565,Cotton_A_37665,Cotton_A_03551,Cotton_A_21600,Cotton_A_10969,Cotton_A_29322,Cotton_A_22385,Cotton_A_31849,Cotton_A_12079,Cotton_A_00439,Cotton_A_09618,Cotton_A_21061,Cotton_A_12429,Cotton_A_14996,Cotton_A_12873,Cotton_A_16864,Cotton_A_00728,Cotton_A_08891,Cotton_A_00223,Cotton_A_19726,Cotton_A_35575,Cotton_A_15599,Cotton_A_15737,Cotton_A_21260,Cotton_A_40145,Cotton_A_22388,Cotton_A_03278,Cotton_A_18523,Cotton_A_24977,Cotton_A_23232,Cotton_A_12594,Cotton_A_02942,Cotton_A_22640,Cotton_A_15401,Cotton_A_11181,Cotton_A_04335,Cotton_A_09387,Cotton_A_03127,Cotton_A_28062,Cotton_A_08550,Cotton_A_18680,Cotton_A_20754,Cotton_A_33935,Cotton_A_10386,Cotton_A_00431,Cotton_A_05537,Cotton_A_40488,Cotton_A_02870,Cotton_A_04373,Cotton_A_15237,Cotton_A_40254,Cotton_A_03256,Cotton_A_23777,Cotton_A_15354,Cotton_A_40193,Cotton_A_06610,Cotton_A_39107,Cotton_A_01762,Cotton_A_13287,Cotton_A_02605,Cotton_A_11961,Cotton_A_22190,Cotton_A_09697,Cotton_A_03667,Cotton_A_16231,Cotton_A_01940,Cotton_A_08026,Cotton_A_01568,Cotton_A_19347,Cotton_A_24182,Cotton_A_01992,Cotton_A_02359,Cotton_A_37328,Cotton_A_17369,Cotton_A_06028,Cotton_A_02633,Cotton_A_13881,Cotton_A_13883,Cotton_A_30069,Cotton_A_31507,Cotton_A_05022,Cotton_A_12407,Cotton_A_17524,Cotton_A_10522,Cotton_A_04272,Cotton_A_00885,Cotton_A_07058,Cotton_A_24043,Cotton_A_05126,Cotton_A_24015,Cotton_A_38695,Cotton_A_12294,Cotton_A_03281,Cotton_A_07373,Cotton_A_27468,Cotton_A_32011,Cotton_A_03234,Cotton_A_10633,Cotton_A_29586,Cotton_A_22443,Cotton_A_00008,Cotton_A_03008,Cotton_A_03589,Cotton_A_01970,Cotton_A_07144,Cotton_A_09689,Cotton_A_09691,Cotton_A_24908,Cotton_A_23291,Cotton_A_28965,Cotton_A_21902,Cotton_A_28537,Cotton_A_37765,Cotton_A_23694,Cotton_A_31664,Cotton_A_12318,Cotton_A_12352,Cotton_A_33760,Cotton_A_33761,Cotton_A_18054,Cotton_A_23283,Cotton_A_04840,Cotton_A_19887,Cotton_A_20710,Cotton_A_15425,Cotton_A_15426,Cotton_A_15312,Cotton_A_13973,Cotton_A_28955,Cotton_A_14625,Cotton_A_10645,Cotton_A_22858,Cotton_A_28314,Cotton_A_34251,Cotton_A_02992,Cotton_A_24656,Cotton_A_02235,Cotton_A_06999,Cotton_A_21435,Cotton_A_29234,Cotton_A_21641,Cotton_A_00504,Cotton_A_21582,Cotton_A_34513,Cotton_A_06422,Cotton_A_22739,Cotton_A_05790,Cotton_A_09767,Cotton_A_10829,Cotton_A_24024,Cotton_A_29919,Cotton_A_19037,Cotton_A_12311,Cotton_A_03285,Cotton_A_29276,Cotton_A_38321,Cotton_A_18650,Cotton_A_36570,Cotton_A_05217,Cotton_A_05420,Cotton_A_17477,Cotton_A_10559,Cotton_A_21788,Cotton_A_34643,Cotton_A_07032,Cotton_A_05106,Cotton_A_24482,Cotton_A_09385,Cotton_A_18075,Cotton_A_03128,Cotton_A_14544,Cotton_A_23706,Cotton_A_31758,Cotton_A_31759,Cotton_A_31760,Cotton_A_03785,Cotton_A_12372,Cotton_A_30604,Cotton_A_19849,Cotton_A_11764,Cotton_A_06147,Cotton_A_27679,Cotton_A_15158,Cotton_A_39431,Cotton_A_21080,Cotton_A_21436,Cotton_A_22978,Cotton_A_00965,Cotton_A_32733,Cotton_A_25406,Cotton_A_01299,Cotton_A_37371,Cotton_A_07217,Cotton_A_14172,Cotton_A_05369,Cotton_A_16588,Cotton_A_13172,Cotton_A_21208,Cotton_A_07182,Cotton_A_19787,Cotton_A_04411,Cotton_A_36541,Cotton_A_16340,Cotton_A_01267,Cotton_A_09054,Cotton_A_19268,Cotton_A_21614,Cotton_A_21617,Cotton_A_05471,Cotton_A_08960,Cotton_A_36319,Cotton_A_28708,Cotton_A_14587,Cotton_A_25212,Cotton_A_20300,Cotton_A_00977,Cotton_A_22136,Cotton_A_08112,Cotton_A_14100,Cotton_A_15650,Cotton_A_12644,Cotton_A_12645,Cotton_A_26423,Cotton_A_00533,Cotton_A_09573,Cotton_A_13897,Cotton_A_10088,Cotton_A_04995,Cotton_A_23504,Cotton_A_11339,Cotton_A_04077,Cotton_A_25117,Cotton_A_39133,Cotton_A_15680,Cotton_A_27405,Cotton_A_30293,Cotton_A_15428,Cotton_A_06886,Cotton_A_06543,Cotton_A_14800,Cotton_A_18503,Cotton_A_10041,Cotton_A_10055,Cotton_A_16717,Cotton_A_25118,Cotton_A_39129,Cotton_A_15679,Cotton_A_26787,Cotton_A_27404,Cotton_A_22029,Cotton_A_22034,Cotton_A_09359,Cotton_A_17503,Cotton_A_14178,Cotton_A_04071,Cotton_A_05378,Cotton_A_40876,Cotton_A_10038,Cotton_A_36422,Cotton_A_19024,Cotton_A_36031,Cotton_A_15807,Cotton_A_33191,Cotton_A_34430,Cotton_A_20587,Cotton_A_28513,Cotton_A_28514,Cotton_A_32672,Cotton_A_32673,Cotton_A_36974,Cotton_A_32517,Cotton_A_32518,Cotton_A_31862,Cotton_A_22492,Cotton_A_30288,Cotton_A_09750,Cotton_A_16838,Cotton_A_08772,Cotton_A_22373,Cotton_A_04657,Cotton_A_21406,Cotton_A_33215,Cotton_A_07390,Cotton_A_33845,Cotton_A_32686,Cotton_A_36791,Cotton_A_21068,Cotton_A_02357,Cotton_A_38511,Cotton_A_11527,Cotton_A_06423,Cotton_A_08449,Cotton_A_14679,Cotton_A_11967,Cotton_A_01490,Cotton_A_33750,Cotton_A_34241,Cotton_A_30357,Cotton_A_13814,Cotton_A_37692,Cotton_A_26166,Cotton_A_30290,Cotton_A_02914,Cotton_A_36058,Cotton_A_29814,Cotton_A_36972,Cotton_A_37693,Cotton_A_04885,Cotton_A_32076,Cotton_A_25127,Cotton_A_32122,Cotton_A_34681,Cotton_A_18605,Cotton_A_16052,Cotton_A_05476,Cotton_A_35811,Cotton_A_04012,Cotton_A_11348,Cotton_A_15381,Cotton_A_02273,Cotton_A_20588,Cotton_A_15342,Cotton_A_28515,Cotton_A_32671,Cotton_A_36975,Cotton_A_39288,Cotton_A_32519,Cotton_A_34143,Cotton_A_35562,Cotton_A_04884,Cotton_A_31863,Cotton_A_27410,Cotton_A_30287,Cotton_A_09749,Cotton_A_16837,Cotton_A_22012,Cotton_A_08204,Cotton_A_21681,Cotton_A_25908,Cotton_A_40486,Cotton_A_02739,Cotton_A_00764,Cotton_A_03654,Cotton_A_10589,Cotton_A_10039,Cotton_A_36032,Cotton_A_32099,Cotton_A_33500,Cotton_A_17426,Cotton_A_08739,Cotton_A_10400,Cotton_A_15341,Cotton_A_36973,Cotton_A_39287,Cotton_A_35561,Cotton_A_31861,Cotton_A_10080,Cotton_A_18461,Cotton_A_25489,Cotton_A_19674,Cotton_A_33522,Cotton_A_33382,Cotton_A_38919,Cotton_A_32623 OXYTOCIN_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04921 Oxytocin_signaling_pathway ko04921 Oxytocin_signaling_pathway Cotton_A_33161 PROTEASOME KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03050 Proteasome ko03050 Proteasome Cotton_A_05268,Cotton_A_18964,Cotton_A_08572,Cotton_A_05879,Cotton_A_38954,Cotton_A_33463,Cotton_A_13088,Cotton_A_15704,Cotton_A_07848,Cotton_A_38007,Cotton_A_18754,Cotton_A_10965,Cotton_A_31854,Cotton_A_11118,Cotton_A_20424,Cotton_A_03089,Cotton_A_00065,Cotton_A_07372,Cotton_A_33117,Cotton_A_40165,Cotton_A_37662,Cotton_A_21741,Cotton_A_15253,Cotton_A_15997,Cotton_A_05784,Cotton_A_11752,Cotton_A_06169,Cotton_A_09673,Cotton_A_31792,Cotton_A_08060,Cotton_A_00330,Cotton_A_33767,Cotton_A_09185,Cotton_A_25392,Cotton_A_09746,Cotton_A_00645,Cotton_A_01552,Cotton_A_08880,Cotton_A_06931,Cotton_A_08634,Cotton_A_05759,Cotton_A_06844,Cotton_A_35323,Cotton_A_18759,Cotton_A_26152,Cotton_A_02938,Cotton_A_01747,Cotton_A_01755,Cotton_A_11021,Cotton_A_09485,Cotton_A_35085,Cotton_A_28069,Cotton_A_08562,Cotton_A_25156,Cotton_A_03176,Cotton_A_00643,Cotton_A_01548,Cotton_A_22186,Cotton_A_22483,Cotton_A_23573,Cotton_A_23018,Cotton_A_08337,Cotton_A_16508,Cotton_A_33475,Cotton_A_16293,Cotton_A_20773,Cotton_A_34104,Cotton_A_10660,Cotton_A_10662,Cotton_A_14136,Cotton_A_38025,Cotton_A_01104,Cotton_A_09120,Cotton_A_11570,Cotton_A_08415,Cotton_A_00393,Cotton_A_07436,Cotton_A_03206 BIOSYNTHESIS_OF_AMINO_ACIDS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko01230 Biosynthesis_of_amino_acids ko01230 Biosynthesis_of_amino_acids Cotton_A_34829,Cotton_A_34830,Cotton_A_16771,Cotton_A_32739,Cotton_A_00556,Cotton_A_27353,Cotton_A_33004,Cotton_A_01868,Cotton_A_05831,Cotton_A_27902,Cotton_A_36305,Cotton_A_21974,Cotton_A_08270,Cotton_A_20070,Cotton_A_28079,Cotton_A_00386,Cotton_A_25103,Cotton_A_01829,Cotton_A_07300,Cotton_A_17056,Cotton_A_17734,Cotton_A_07226,Cotton_A_38335,Cotton_A_19158,Cotton_A_13335,Cotton_A_13982,Cotton_A_31138,Cotton_A_28767,Cotton_A_34341,Cotton_A_20058,Cotton_A_13772,Cotton_A_26025,Cotton_A_02050,Cotton_A_26604,Cotton_A_20622,Cotton_A_23840,Cotton_A_08760,Cotton_A_24980,Cotton_A_25419,Cotton_A_25420,Cotton_A_05522,Cotton_A_23235,Cotton_A_29673,Cotton_A_27173,Cotton_A_22634,Cotton_A_27944,Cotton_A_03358,Cotton_A_05938,Cotton_A_18321,Cotton_A_16592,Cotton_A_26508,Cotton_A_26832,Cotton_A_00857,Cotton_A_24474,Cotton_A_27336,Cotton_A_29047,Cotton_A_01287,Cotton_A_05563,Cotton_A_04568,Cotton_A_27621,Cotton_A_19728,Cotton_A_35573,Cotton_A_38249,Cotton_A_03712,Cotton_A_13988,Cotton_A_09300,Cotton_A_19630,Cotton_A_31487,Cotton_A_25553,Cotton_A_12426,Cotton_A_20687,Cotton_A_38380,Cotton_A_15571,Cotton_A_17877,Cotton_A_01728,Cotton_A_29962,Cotton_A_25520,Cotton_A_09337,Cotton_A_06679,Cotton_A_18904,Cotton_A_22178,Cotton_A_11383,Cotton_A_39597,Cotton_A_23409,Cotton_A_32893,Cotton_A_03366,Cotton_A_31268,Cotton_A_14323,Cotton_A_34581,Cotton_A_39105,Cotton_A_03466,Cotton_A_15842,Cotton_A_32588,Cotton_A_15484,Cotton_A_26652,Cotton_A_07331,Cotton_A_24539,Cotton_A_38078,Cotton_A_36317,Cotton_A_28704,Cotton_A_17882,Cotton_A_19922 P53_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04115 p53_signaling_pathway ko04115 p53_signaling_pathway Cotton_A_24143 ALCOHOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05034 Alcoholism ko05034 Alcoholism Cotton_A_18073 TRANSCRIPTIONAL_MISREGULATION_IN_CANCER KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05202 Transcriptional_misregulation_in_cancer ko05202 Transcriptional_misregulation_in_cancer Cotton_A_09092,Cotton_A_11503,Cotton_A_04188,Cotton_A_26057,Cotton_A_27325,Cotton_A_07853,Cotton_A_23683,Cotton_A_00032,Cotton_A_08598,Cotton_A_37611,Cotton_A_11188,Cotton_A_34310,Cotton_A_19339,Cotton_A_26517,Cotton_A_37734,Cotton_A_02561,Cotton_A_11447,Cotton_A_28888,Cotton_A_28889,Cotton_A_08552,Cotton_A_08553,Cotton_A_08554,Cotton_A_24643,Cotton_A_24084,Cotton_A_16197 TGF-BETA_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04350 TGF-beta_signaling_pathway ko04350 TGF-beta_signaling_pathway Cotton_A_00474,Cotton_A_05549,Cotton_A_29667,Cotton_A_20245,Cotton_A_04112 FOLATE_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00790 Folate_biosynthesis ko00790 Folate_biosynthesis Cotton_A_06204,Cotton_A_23410,Cotton_A_30320,Cotton_A_11962,Cotton_A_12696,Cotton_A_33818,Cotton_A_15190,Cotton_A_03800,Cotton_A_32965,Cotton_A_11960,Cotton_A_22971 NEUROACTIVE_LIGAND-RECEPTOR_INTERACTION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04080 Neuroactive_ligand-receptor_interaction ko04080 Neuroactive_ligand-receptor_interaction Cotton_A_00705,Cotton_A_00706,Cotton_A_08898,Cotton_A_27216,Cotton_A_27217,Cotton_A_30865 SNARE_INTERACTIONS_IN_VESICULAR_TRANSPORT KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04130 SNARE_interactions_in_vesicular_transport ko04130 SNARE_interactions_in_vesicular_transport Cotton_A_13486,Cotton_A_22836,Cotton_A_16016,Cotton_A_31356,Cotton_A_04974,Cotton_A_32966,Cotton_A_24221,Cotton_A_34064,Cotton_A_39743,Cotton_A_20066,Cotton_A_03846,Cotton_A_02012,Cotton_A_07325,Cotton_A_02853,Cotton_A_09454,Cotton_A_09727,Cotton_A_07925,Cotton_A_26438,Cotton_A_34281,Cotton_A_16273,Cotton_A_03036,Cotton_A_11507,Cotton_A_22137,Cotton_A_13546,Cotton_A_05941,Cotton_A_18317,Cotton_A_15477,Cotton_A_06168,Cotton_A_35680,Cotton_A_27948,Cotton_A_07720,Cotton_A_31131,Cotton_A_22848,Cotton_A_35195,Cotton_A_03934,Cotton_A_10424,Cotton_A_06590,Cotton_A_15531,Cotton_A_06786,Cotton_A_28640,Cotton_A_32769,Cotton_A_02802,Cotton_A_01740,Cotton_A_00457,Cotton_A_32871,Cotton_A_15112,Cotton_A_26268,Cotton_A_38924,Cotton_A_01210,Cotton_A_09086,Cotton_A_11472,Cotton_A_07241,Cotton_A_11918,Cotton_A_18900,Cotton_A_02658,Cotton_A_01314 AMINOBENZOATE_DEGRADATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00627 Aminobenzoate_degradation ko00627 Aminobenzoate_degradation Cotton_A_04908 ARGININE_AND_PROLINE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00330 Arginine_and_proline_metabolism ko00330 Arginine_and_proline_metabolism Cotton_A_25698,Cotton_A_12971,Cotton_A_09365,Cotton_A_10294,Cotton_A_36385,Cotton_A_12613,Cotton_A_38074,Cotton_A_17875,Cotton_A_12638,Cotton_A_10593,Cotton_A_36680,Cotton_A_20968,Cotton_A_22159,Cotton_A_00166,Cotton_A_17338,Cotton_A_21179,Cotton_A_32111,Cotton_A_27293,Cotton_A_13601,Cotton_A_02070,Cotton_A_26274,Cotton_A_18588,Cotton_A_14982,Cotton_A_14983,Cotton_A_00690,Cotton_A_08902,Cotton_A_32373 LEGIONELLOSIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05134 Legionellosis ko05134 Legionellosis Cotton_A_19687,Cotton_A_07672,Cotton_A_16062,Cotton_A_23863,Cotton_A_09143,Cotton_A_27002,Cotton_A_26301,Cotton_A_17724,Cotton_A_17587 DRUG_METABOLISM_-_CYTOCHROME_P450 KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00982 Drug_metabolism_-_cytochrome_P450 ko00982 Drug_metabolism_-_cytochrome_P450 Cotton_A_22096,Cotton_A_31568,Cotton_A_31569,Cotton_A_08857,Cotton_A_27850 STARCH_AND_SUCROSE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00500 Starch_and_sucrose_metabolism ko00500 Starch_and_sucrose_metabolism Cotton_A_14707,Cotton_A_20022,Cotton_A_29497,Cotton_A_11319,Cotton_A_12199,Cotton_A_03181,Cotton_A_22517,Cotton_A_27855,Cotton_A_01977,Cotton_A_37769,Cotton_A_03057,Cotton_A_11932,Cotton_A_04532,Cotton_A_23709,Cotton_A_23712,Cotton_A_02720,Cotton_A_22808,Cotton_A_33372,Cotton_A_05024,Cotton_A_22769,Cotton_A_31871,Cotton_A_09181,Cotton_A_12382,Cotton_A_12395,Cotton_A_09724,Cotton_A_38312,Cotton_A_17512,Cotton_A_00531,Cotton_A_34417,Cotton_A_08092,Cotton_A_22105,Cotton_A_05932,Cotton_A_20346,Cotton_A_25631,Cotton_A_33261,Cotton_A_11251,Cotton_A_12456,Cotton_A_30569,Cotton_A_30110,Cotton_A_05975,Cotton_A_24140,Cotton_A_24685,Cotton_A_25816,Cotton_A_14947,Cotton_A_18271,Cotton_A_18298,Cotton_A_34689,Cotton_A_10953,Cotton_A_26563,Cotton_A_00128,Cotton_A_00833,Cotton_A_17917,Cotton_A_04619,Cotton_A_29162,Cotton_A_20684,Cotton_A_22940,Cotton_A_37299,Cotton_A_11410,Cotton_A_20715,Cotton_A_07863,Cotton_A_12451,Cotton_A_00279,Cotton_A_00729,Cotton_A_32985,Cotton_A_37981,Cotton_A_14087,Cotton_A_03729,Cotton_A_06836,Cotton_A_19725,Cotton_A_08085,Cotton_A_33778,Cotton_A_26720,Cotton_A_35626,Cotton_A_27028,Cotton_A_17122,Cotton_A_23890,Cotton_A_34116,Cotton_A_05041,Cotton_A_07119,Cotton_A_13592,Cotton_A_17739,Cotton_A_28679,Cotton_A_08645,Cotton_A_33072,Cotton_A_34134,Cotton_A_21458,Cotton_A_21459,Cotton_A_09156,Cotton_A_06792,Cotton_A_07184,Cotton_A_28490,Cotton_A_31237,Cotton_A_19759,Cotton_A_11874,Cotton_A_27221,Cotton_A_01711,Cotton_A_41274,Cotton_A_10980,Cotton_A_14287,Cotton_A_29489,Cotton_A_38330,Cotton_A_11019,Cotton_A_20148,Cotton_A_17753,Cotton_A_20020,Cotton_A_35620,Cotton_A_31360,Cotton_A_31361,Cotton_A_11069,Cotton_A_27571,Cotton_A_12919,Cotton_A_19988,Cotton_A_27624,Cotton_A_25501,Cotton_A_00394,Cotton_A_12230,Cotton_A_16811,Cotton_A_25652,Cotton_A_02338,Cotton_A_04451,Cotton_A_27349,Cotton_A_06389,Cotton_A_28280,Cotton_A_06075,Cotton_A_26520,Cotton_A_26521,Cotton_A_25291,Cotton_A_27943,Cotton_A_07729,Cotton_A_17834,Cotton_A_09919,Cotton_A_20166,Cotton_A_24399,Cotton_A_34592 BASAL_TRANSCRIPTION_FACTORS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03022 Basal_transcription_factors ko03022 Basal_transcription_factors Cotton_A_15025,Cotton_A_22412,Cotton_A_16855,Cotton_A_03238,Cotton_A_13038,Cotton_A_13039,Cotton_A_27620,Cotton_A_32412,Cotton_A_18750,Cotton_A_28759,Cotton_A_08228,Cotton_A_16946,Cotton_A_20507,Cotton_A_01734,Cotton_A_16103,Cotton_A_03889,Cotton_A_07085,Cotton_A_29309,Cotton_A_16369,Cotton_A_19666,Cotton_A_12892,Cotton_A_16689,Cotton_A_07834,Cotton_A_14634,Cotton_A_33141,Cotton_A_03547,Cotton_A_16670,Cotton_A_20731,Cotton_A_19206,Cotton_A_01176,Cotton_A_30492,Cotton_A_12120,Cotton_A_11992,Cotton_A_14727,Cotton_A_27228,Cotton_A_05523,Cotton_A_24067,Cotton_A_02944,Cotton_A_08525,Cotton_A_28011,Cotton_A_01137,Cotton_A_02547,Cotton_A_19868,Cotton_A_05251,Cotton_A_22580,Cotton_A_08529,Cotton_A_11566,Cotton_A_16186,Cotton_A_24016,Cotton_A_12296,Cotton_A_02314,Cotton_A_09992,Cotton_A_35278 ALANINE,_ASPARTATE_AND_GLUTAMATE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00250 Alanine,_aspartate_and_glutamate_metabolism ko00250 Alanine,_aspartate_and_glutamate_metabolism Cotton_A_12480,Cotton_A_04341,Cotton_A_24626,Cotton_A_37176,Cotton_A_24784,Cotton_A_28860,Cotton_A_05636,Cotton_A_14036,Cotton_A_21135,Cotton_A_20006,Cotton_A_09527,Cotton_A_32485,Cotton_A_12954,Cotton_A_36795,Cotton_A_35249 AMOEBIASIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05146 Amoebiasis ko05146 Amoebiasis Cotton_A_08612 ABC_TRANSPORTERS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko02010 ABC_transporters ko02010 ABC_transporters Cotton_A_40025,Cotton_A_18109,Cotton_A_00476,Cotton_A_08997,Cotton_A_19450,Cotton_A_38229,Cotton_A_38230,Cotton_A_15922,Cotton_A_18238,Cotton_A_37889,Cotton_A_15688,Cotton_A_23097,Cotton_A_17915,Cotton_A_28123,Cotton_A_29669,Cotton_A_27179,Cotton_A_03970,Cotton_A_08542,Cotton_A_07918,Cotton_A_22622,Cotton_A_22625,Cotton_A_04147,Cotton_A_17758,Cotton_A_17089,Cotton_A_23321,Cotton_A_26725,Cotton_A_40025,Cotton_A_18109,Cotton_A_00476,Cotton_A_08997,Cotton_A_19450,Cotton_A_38229,Cotton_A_38230,Cotton_A_15922,Cotton_A_18238,Cotton_A_37889,Cotton_A_15688,Cotton_A_23097,Cotton_A_17915,Cotton_A_28123,Cotton_A_29669,Cotton_A_27179,Cotton_A_03970,Cotton_A_08542,Cotton_A_07918,Cotton_A_22622,Cotton_A_22625 ANTIGEN_PROCESSING_AND_PRESENTATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04612 Antigen_processing_and_presentation ko04612 Antigen_processing_and_presentation Cotton_A_36618,Cotton_A_05707,Cotton_A_06049,Cotton_A_06685,Cotton_A_26079,Cotton_A_03153,Cotton_A_02567,Cotton_A_02671,Cotton_A_03321,Cotton_A_12983,Cotton_A_08538,Cotton_A_10241,Cotton_A_29111,Cotton_A_06526,Cotton_A_02119,Cotton_A_08309,Cotton_A_12715,Cotton_A_26323,Cotton_A_32253,Cotton_A_32311,Cotton_A_12432,Cotton_A_31293,Cotton_A_06733,Cotton_A_11842,Cotton_A_25641,Cotton_A_03443,Cotton_A_04189,Cotton_A_22325 LEISHMANIASIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05140 Leishmaniasis ko05140 Leishmaniasis Cotton_A_06879,Cotton_A_16636 NOTCH_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04330 Notch_signaling_pathway ko04330 Notch_signaling_pathway Cotton_A_26574,Cotton_A_29968,Cotton_A_09005,Cotton_A_00116,Cotton_A_31780,Cotton_A_05191,Cotton_A_32685,Cotton_A_14264 PROPANOATE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00640 Propanoate_metabolism ko00640 Propanoate_metabolism Cotton_A_08466 BETA-ALANINE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00410 beta-Alanine_metabolism ko00410 beta-Alanine_metabolism Cotton_A_32004 NOD-LIKE_RECEPTOR_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04621 NOD-like_receptor_signaling_pathway ko04621 NOD-like_receptor_signaling_pathway Cotton_A_38357,Cotton_A_30354,Cotton_A_17775 OXIDATIVE_PHOSPHORYLATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00190 Oxidative_phosphorylation ko00190 Oxidative_phosphorylation Cotton_A_13853,Cotton_A_10062,Cotton_A_31623,Cotton_A_34410,Cotton_A_30852,Cotton_A_33873,Cotton_A_30673,Cotton_A_16758,Cotton_A_05610,Cotton_A_00741,Cotton_A_19381,Cotton_A_26756,Cotton_A_21034,Cotton_A_05967,Cotton_A_03219,Cotton_A_22232,Cotton_A_31866,Cotton_A_27407,Cotton_A_07859,Cotton_A_10048,Cotton_A_24471,Cotton_A_36517,Cotton_A_10049,Cotton_A_10045,Cotton_A_10046,Cotton_A_10047,Cotton_A_10079,Cotton_A_39996,Cotton_A_36637,Cotton_A_10078,Cotton_A_13815,Cotton_A_36252,Cotton_A_10073,Cotton_A_09439,Cotton_A_00054,Cotton_A_07339,Cotton_A_12019,Cotton_A_34108,Cotton_A_15343,Cotton_A_16750,Cotton_A_07299,Cotton_A_08822,Cotton_A_14098,Cotton_A_31581,Cotton_A_39331,Cotton_A_03051,Cotton_A_11481,Cotton_A_17055,Cotton_A_25209,Cotton_A_18486,Cotton_A_10266,Cotton_A_02073,Cotton_A_26406,Cotton_A_37572,Cotton_A_25023,Cotton_A_16922,Cotton_A_16931,Cotton_A_31687,Cotton_A_39154,Cotton_A_01119,Cotton_A_24775,Cotton_A_09053,Cotton_A_09115,Cotton_A_17071,Cotton_A_06727,Cotton_A_07526,Cotton_A_08575,Cotton_A_07156,Cotton_A_10609,Cotton_A_28256,Cotton_A_32514,Cotton_A_27413,Cotton_A_22495,Cotton_A_33190,Cotton_A_36254,Cotton_A_24924,Cotton_A_24927,Cotton_A_15087,Cotton_A_10260,Cotton_A_23480,Cotton_A_10830,Cotton_A_13968,Cotton_A_28538,Cotton_A_14619,Cotton_A_35460,Cotton_A_19957,Cotton_A_19962,Cotton_A_01725,Cotton_A_02608,Cotton_A_02411,Cotton_A_17777,Cotton_A_15136,Cotton_A_10590,Cotton_A_32100,Cotton_A_02985,Cotton_A_21682,Cotton_A_21683,Cotton_A_27482,Cotton_A_01719,Cotton_A_37906,Cotton_A_34445,Cotton_A_34446,Cotton_A_00692,Cotton_A_27223,Cotton_A_36883,Cotton_A_35757,Cotton_A_32896,Cotton_A_27386,Cotton_A_25193,Cotton_A_16203,Cotton_A_02094,Cotton_A_40183,Cotton_A_13422,Cotton_A_10188,Cotton_A_10072,Cotton_A_28297,Cotton_A_11806,Cotton_A_38399,Cotton_A_09808,Cotton_A_39808,Cotton_A_23632,Cotton_A_26515,Cotton_A_13155,Cotton_A_09593,Cotton_A_37285,Cotton_A_02158,Cotton_A_20394,Cotton_A_17242,Cotton_A_27972,Cotton_A_27976,Cotton_A_25882,Cotton_A_15414,Cotton_A_32525,Cotton_A_36253,Cotton_A_30286,Cotton_A_36638,Cotton_A_35444,Cotton_A_25516,Cotton_A_04795,Cotton_A_10089,Cotton_A_07269,Cotton_A_25549,Cotton_A_10608,Cotton_A_33154,Cotton_A_28254,Cotton_A_06463,Cotton_A_23431,Cotton_A_19115,Cotton_A_18158,Cotton_A_13345,Cotton_A_21212,Cotton_A_27486,Cotton_A_07187,Cotton_A_10909,Cotton_A_27154,Cotton_A_39406,Cotton_A_09252,Cotton_A_29938,Cotton_A_28004,Cotton_A_09377,Cotton_A_18069,Cotton_A_13048,Cotton_A_28562,Cotton_A_17339,Cotton_A_30824,Cotton_A_09444,Cotton_A_09477,Cotton_A_29167,Cotton_A_04306,Cotton_A_40624,Cotton_A_30053,Cotton_A_16875,Cotton_A_20689,Cotton_A_37239,Cotton_A_33714,Cotton_A_00900,Cotton_A_37992,Cotton_A_05726,Cotton_A_01724,Cotton_A_00228,Cotton_A_32410,Cotton_A_32411,Cotton_A_19748,Cotton_A_11952,Cotton_A_37353,Cotton_A_41257,Cotton_A_31902,Cotton_A_00689,Cotton_A_01571,Cotton_A_08903,Cotton_A_19335,Cotton_A_32372,Cotton_A_01988,Cotton_A_28201,Cotton_A_19438,Cotton_A_15534,Cotton_A_12121,Cotton_A_06785 CELL_CYCLE_-_CAULOBACTER KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04112 Cell_cycle_-_Caulobacter ko04112 Cell_cycle_-_Caulobacter Cotton_A_09159,Cotton_A_13162,Cotton_A_20845,Cotton_A_26373,Cotton_A_06386,Cotton_A_06406,Cotton_A_40483,Cotton_A_27563,Cotton_A_27564,Cotton_A_07084,Cotton_A_07171,Cotton_A_14586,Cotton_A_22054,Cotton_A_13424,Cotton_A_35949,Cotton_A_05473,Cotton_A_15533,Cotton_A_08091,Cotton_A_26075,Cotton_A_05814 ZEATIN_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00908 Zeatin_biosynthesis ko00908 Zeatin_biosynthesis Cotton_A_29965,Cotton_A_22295,Cotton_A_01894,Cotton_A_07842,Cotton_A_25778,Cotton_A_10108,Cotton_A_14045,Cotton_A_27632,Cotton_A_32419,Cotton_A_01018,Cotton_A_03140,Cotton_A_09023,Cotton_A_11875,Cotton_A_15359,Cotton_A_22429,Cotton_A_35602,Cotton_A_08236,Cotton_A_30632,Cotton_A_05749,Cotton_A_34758,Cotton_A_12537,Cotton_A_21353 MEIOSIS_-_YEAST KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04113 Meiosis_-_yeast ko04113 Meiosis_-_yeast Cotton_A_12475,Cotton_A_04331,Cotton_A_04154,Cotton_A_32356,Cotton_A_13056,Cotton_A_06534,Cotton_A_31120,Cotton_A_02866,Cotton_A_08360,Cotton_A_16487 MINERAL_ABSORPTION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04978 Mineral_absorption ko04978 Mineral_absorption Cotton_A_21749,Cotton_A_00360,Cotton_A_05652,Cotton_A_25158,Cotton_A_27770,Cotton_A_27779,Cotton_A_27780,Cotton_A_34698,Cotton_A_12903,Cotton_A_20257,Cotton_A_27991,Cotton_A_10455 LYSOSOME KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04142 Lysosome ko04142 Lysosome Cotton_A_15673,Cotton_A_26926,Cotton_A_25164,Cotton_A_03169,Cotton_A_22234,Cotton_A_05608,Cotton_A_36760,Cotton_A_07125,Cotton_A_00708,Cotton_A_07195,Cotton_A_38004,Cotton_A_19747,Cotton_A_28845,Cotton_A_20003,Cotton_A_20641,Cotton_A_04336,Cotton_A_32357,Cotton_A_33890,Cotton_A_12653,Cotton_A_23562,Cotton_A_26577,Cotton_A_08705,Cotton_A_33371,Cotton_A_36004,Cotton_A_21325,Cotton_A_11668,Cotton_A_19528,Cotton_A_23788,Cotton_A_09007,Cotton_A_30875,Cotton_A_01413,Cotton_A_15947,Cotton_A_26386,Cotton_A_21882,Cotton_A_01615,Cotton_A_14774,Cotton_A_14254,Cotton_A_13571,Cotton_A_02785,Cotton_A_27598,Cotton_A_09391,Cotton_A_03124 BIOTIN_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00780 Biotin_metabolism ko00780 Biotin_metabolism Cotton_A_23876,Cotton_A_02519,Cotton_A_00278,Cotton_A_16126 VASOPRESSIN-REGULATED_WATER_REABSORPTION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04962 Vasopressin-regulated_water_reabsorption ko04962 Vasopressin-regulated_water_reabsorption Cotton_A_35812,Cotton_A_04984,Cotton_A_23923,Cotton_A_30499,Cotton_A_35330,Cotton_A_04640,Cotton_A_02999,Cotton_A_31302,Cotton_A_28945,Cotton_A_00389,Cotton_A_37504,Cotton_A_03581,Cotton_A_31200,Cotton_A_04852,Cotton_A_21689,Cotton_A_28149,Cotton_A_18821 INSULIN_SECRETION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04911 Insulin_secretion ko04911 Insulin_secretion Cotton_A_19104,Cotton_A_13367 SESQUITERPENOID_AND_TRITERPENOID_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00909 Sesquiterpenoid_and_triterpenoid_biosynthesis ko00909 Sesquiterpenoid_and_triterpenoid_biosynthesis Cotton_A_17265,Cotton_A_30164,Cotton_A_21677,Cotton_A_02280,Cotton_A_02281,Cotton_A_41116,Cotton_A_34489,Cotton_A_34490,Cotton_A_34493,Cotton_A_40473,Cotton_A_37524,Cotton_A_37529,Cotton_A_15098,Cotton_A_02895 2-OXOCARBOXYLIC_ACID_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko01210 2-Oxocarboxylic_acid_metabolism ko01210 2-Oxocarboxylic_acid_metabolism Cotton_A_01191,Cotton_A_21105,Cotton_A_25267,Cotton_A_32512,Cotton_A_16734,Cotton_A_34159,Cotton_A_31309,Cotton_A_33518,Cotton_A_09799,Cotton_A_07487,Cotton_A_02760,Cotton_A_35651,Cotton_A_10280,Cotton_A_00871,Cotton_A_19415,Cotton_A_32064,Cotton_A_26071,Cotton_A_04058,Cotton_A_23839,Cotton_A_31982,Cotton_A_39789,Cotton_A_04429,Cotton_A_21147,Cotton_A_04352,Cotton_A_12956,Cotton_A_12021,Cotton_A_06424,Cotton_A_09776,Cotton_A_37876,Cotton_A_23078,Cotton_A_11659,Cotton_A_40317,Cotton_A_31877,Cotton_A_20592,Cotton_A_22713,Cotton_A_25847,Cotton_A_31978,Cotton_A_09018,Cotton_A_23943,Cotton_A_28263,Cotton_A_28214,Cotton_A_23120,Cotton_A_24546,Cotton_A_35288,Cotton_A_34533,Cotton_A_36341,Cotton_A_32277 AMINO_SUGAR_AND_NUCLEOTIDE_SUGAR_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00520 Amino_sugar_and_nucleotide_sugar_metabolism ko00520 Amino_sugar_and_nucleotide_sugar_metabolism Cotton_A_28411,Cotton_A_29161,Cotton_A_20144,Cotton_A_01722,Cotton_A_17443,Cotton_A_18886,Cotton_A_29725,Cotton_A_22577,Cotton_A_15988,Cotton_A_32191,Cotton_A_40673,Cotton_A_17682,Cotton_A_33749,Cotton_A_19779,Cotton_A_19781,Cotton_A_19782,Cotton_A_33972,Cotton_A_36865,Cotton_A_36866,Cotton_A_07229,Cotton_A_07232,Cotton_A_20387,Cotton_A_22147,Cotton_A_09055,Cotton_A_09056,Cotton_A_09095,Cotton_A_31995,Cotton_A_31998,Cotton_A_22925,Cotton_A_35181,Cotton_A_17761,Cotton_A_17762,Cotton_A_15917,Cotton_A_21495,Cotton_A_29070,Cotton_A_33993,Cotton_A_22880,Cotton_A_14011,Cotton_A_22596,Cotton_A_22768,Cotton_A_31873,Cotton_A_15578,Cotton_A_36067,Cotton_A_10227,Cotton_A_25312,Cotton_A_09548,Cotton_A_02639,Cotton_A_13907 DITERPENOID_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00904 Diterpenoid_biosynthesis ko00904 Diterpenoid_biosynthesis Cotton_A_34113,Cotton_A_03565,Cotton_A_21592,Cotton_A_09631,Cotton_A_23693,Cotton_A_36733,Cotton_A_24968,Cotton_A_05289,Cotton_A_26690,Cotton_A_30390,Cotton_A_21910,Cotton_A_12589,Cotton_A_02891,Cotton_A_28292,Cotton_A_03544,Cotton_A_14497,Cotton_A_11828,Cotton_A_06914,Cotton_A_18270,Cotton_A_01030,Cotton_A_13133,Cotton_A_24686,Cotton_A_32754,Cotton_A_12710,Cotton_A_36749,Cotton_A_08218 UBIQUINONE_AND_OTHER_TERPENOID-QUINONE_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00130 Ubiquinone_and_other_terpenoid-quinone_biosynthesis ko00130 Ubiquinone_and_other_terpenoid-quinone_biosynthesis Cotton_A_07352,Cotton_A_27443,Cotton_A_23511,Cotton_A_31572,Cotton_A_37762,Cotton_A_26609,Cotton_A_24153,Cotton_A_04453,Cotton_A_14575,Cotton_A_23812,Cotton_A_25048,Cotton_A_15041,Cotton_A_02522,Cotton_A_38152,Cotton_A_08364,Cotton_A_08190,Cotton_A_25995,Cotton_A_07201,Cotton_A_20488,Cotton_A_15402,Cotton_A_15406,Cotton_A_36851 CELL_CYCLE_-_YEAST KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04111 Cell_cycle_-_yeast ko04111 Cell_cycle_-_yeast Cotton_A_09726,Cotton_A_13916,Cotton_A_24176,Cotton_A_14713,Cotton_A_03584,Cotton_A_23882,Cotton_A_30615,Cotton_A_24009,Cotton_A_14325,Cotton_A_17886 DORSO-VENTRAL_AXIS_FORMATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04320 Dorso-ventral_axis_formation ko04320 Dorso-ventral_axis_formation Cotton_A_13380 SULFUR_RELAY_SYSTEM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04122 Sulfur_relay_system ko04122 Sulfur_relay_system Cotton_A_01067,Cotton_A_29695,Cotton_A_17869,Cotton_A_10943,Cotton_A_12140 SYSTEMIC_LUPUS_ERYTHEMATOSUS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05322 Systemic_lupus_erythematosus ko05322 Systemic_lupus_erythematosus Cotton_A_00406,Cotton_A_00407,Cotton_A_00409,Cotton_A_39195,Cotton_A_05960,Cotton_A_21280,Cotton_A_29314,Cotton_A_37012,Cotton_A_03090,Cotton_A_17922,Cotton_A_22406,Cotton_A_05320,Cotton_A_21361,Cotton_A_22550,Cotton_A_25192,Cotton_A_03200,Cotton_A_06742,Cotton_A_16851,Cotton_A_18515,Cotton_A_19530,Cotton_A_19570,Cotton_A_21432,Cotton_A_21433,Cotton_A_07212 PEPTIDOGLYCAN_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00550 Peptidoglycan_biosynthesis ko00550 Peptidoglycan_biosynthesis Cotton_A_02753,Cotton_A_12349,Cotton_A_33762 LINOLEIC_ACID_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00591 Linoleic_acid_metabolism ko00591 Linoleic_acid_metabolism Cotton_A_33908,Cotton_A_15217,Cotton_A_01087,Cotton_A_04986,Cotton_A_04987,Cotton_A_08514,Cotton_A_12434,Cotton_A_08319,Cotton_A_27917 SULFUR_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00920 Sulfur_metabolism ko00920 Sulfur_metabolism Cotton_A_34778,Cotton_A_06331,Cotton_A_04730,Cotton_A_03860,Cotton_A_03864,Cotton_A_27364,Cotton_A_28620,Cotton_A_25523,Cotton_A_04675,Cotton_A_30000,Cotton_A_02568,Cotton_A_25313,Cotton_A_22741,Cotton_A_22408,Cotton_A_09768,Cotton_A_34435,Cotton_A_16413,Cotton_A_08361,Cotton_A_16484,Cotton_A_30442,Cotton_A_19684,Cotton_A_18675,Cotton_A_17311,Cotton_A_03341 TNF_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04668 TNF_signaling_pathway ko04668 TNF_signaling_pathway Cotton_A_03899,Cotton_A_20831,Cotton_A_01156,Cotton_A_17213 PLANT_HORMONE_SIGNAL_TRANSDUCTION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04075 Plant_hormone_signal_transduction ko04075 Plant_hormone_signal_transduction 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n_A_14056,Cotton_A_18896,Cotton_A_00049,Cotton_A_36075,Cotton_A_11862,Cotton_A_27840,Cotton_A_16729,Cotton_A_34783,Cotton_A_09975,Cotton_A_02067 BRASSINOSTEROID_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00905 Brassinosteroid_biosynthesis ko00905 Brassinosteroid_biosynthesis Cotton_A_30018,Cotton_A_01585,Cotton_A_14683,Cotton_A_14641,Cotton_A_08414,Cotton_A_03726,Cotton_A_13852,Cotton_A_15874,Cotton_A_27636,Cotton_A_33919,Cotton_A_11115,Cotton_A_17451,Cotton_A_31341,Cotton_A_31346,Cotton_A_31347,Cotton_A_33122,Cotton_A_33123,Cotton_A_33126,Cotton_A_19422,Cotton_A_35190,Cotton_A_35192,Cotton_A_35193,Cotton_A_41164,Cotton_A_28880 FLAVONE_AND_FLAVONOL_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00944 Flavone_and_flavonol_biosynthesis ko00944 Flavone_and_flavonol_biosynthesis Cotton_A_01801,Cotton_A_23957 VARIOUS_TYPES_OF_N-GLYCAN_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00513 Various_types_of_N-glycan_biosynthesis ko00513 Various_types_of_N-glycan_biosynthesis Cotton_A_29622,Cotton_A_10772,Cotton_A_33057,Cotton_A_08743,Cotton_A_06153,Cotton_A_06581 VITAMIN_B6_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00750 Vitamin_B6_metabolism ko00750 Vitamin_B6_metabolism Cotton_A_12521,Cotton_A_09374,Cotton_A_05429,Cotton_A_05430,Cotton_A_05431,Cotton_A_05432,Cotton_A_17471,Cotton_A_02498,Cotton_A_00317,Cotton_A_03499,Cotton_A_05366,Cotton_A_11853,Cotton_A_11043 RENIN-ANGIOTENSIN_SYSTEM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04614 Renin-angiotensin_system ko04614 Renin-angiotensin_system Cotton_A_25674 MAPK_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04010 MAPK_signaling_pathway ko04010 MAPK_signaling_pathway Cotton_A_02388,Cotton_A_08153,Cotton_A_16590,Cotton_A_34841,Cotton_A_14000,Cotton_A_33718,Cotton_A_06492,Cotton_A_16034,Cotton_A_16036,Cotton_A_09151,Cotton_A_25210,Cotton_A_07469,Cotton_A_13237,Cotton_A_13238,Cotton_A_19082,Cotton_A_39862,Cotton_A_16161,Cotton_A_35704,Cotton_A_34840,Cotton_A_05616,Cotton_A_12261,Cotton_A_28798 CYSTEINE_AND_METHIONINE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00270 Cysteine_and_methionine_metabolism ko00270 Cysteine_and_methionine_metabolism Cotton_A_07391,Cotton_A_25294,Cotton_A_24759,Cotton_A_36261,Cotton_A_09376,Cotton_A_03556,Cotton_A_10305,Cotton_A_28756,Cotton_A_31312,Cotton_A_16678,Cotton_A_32717,Cotton_A_09798,Cotton_A_31117,Cotton_A_10834,Cotton_A_20923,Cotton_A_08356,Cotton_A_16494,Cotton_A_33465,Cotton_A_30303,Cotton_A_36368,Cotton_A_10301,Cotton_A_34793,Cotton_A_34794,Cotton_A_12270,Cotton_A_04648,Cotton_A_03276,Cotton_A_08348,Cotton_A_19286,Cotton_A_16980,Cotton_A_27044,Cotton_A_03613,Cotton_A_27234,Cotton_A_29333,Cotton_A_20737,Cotton_A_02743,Cotton_A_32616,Cotton_A_38070,Cotton_A_38933,Cotton_A_17737,Cotton_A_10740,Cotton_A_06278,Cotton_A_00661,Cotton_A_10600,Cotton_A_16269,Cotton_A_32846,Cotton_A_12635,Cotton_A_30080,Cotton_A_28496,Cotton_A_08135,Cotton_A_13210,Cotton_A_05692,Cotton_A_03177 GLYOXYLATE_AND_DICARBOXYLATE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00630 Glyoxylate_and_dicarboxylate_metabolism ko00630 Glyoxylate_and_dicarboxylate_metabolism Cotton_A_23689,Cotton_A_18898,Cotton_A_18899,Cotton_A_27979,Cotton_A_27980,Cotton_A_12335,Cotton_A_15372,Cotton_A_28649,Cotton_A_12650,Cotton_A_28508,Cotton_A_05347,Cotton_A_40796,Cotton_A_18387,Cotton_A_21735,Cotton_A_25347,Cotton_A_05375,Cotton_A_23130,Cotton_A_09161 SELENOCOMPOUND_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00450 Selenocompound_metabolism ko00450 Selenocompound_metabolism Cotton_A_07386,Cotton_A_27795,Cotton_A_40013,Cotton_A_26072,Cotton_A_02598 RAP1_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04015 Rap1_signaling_pathway ko04015 Rap1_signaling_pathway Cotton_A_09397,Cotton_A_09398,Cotton_A_18094,Cotton_A_18096,Cotton_A_05594,Cotton_A_03120,Cotton_A_14535 PHOTOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00195 Photosynthesis ko00195 Photosynthesis Cotton_A_17950,Cotton_A_17951,Cotton_A_19372,Cotton_A_15039,Cotton_A_11377,Cotton_A_35347,Cotton_A_32516,Cotton_A_27411,Cotton_A_22493,Cotton_A_19915,Cotton_A_32522,Cotton_A_26100,Cotton_A_02038,Cotton_A_37836,Cotton_A_10037,Cotton_A_10082,Cotton_A_17406,Cotton_A_15470,Cotton_A_10083,Cotton_A_37835,Cotton_A_29959,Cotton_A_08320,Cotton_A_22005,Cotton_A_16966,Cotton_A_05895,Cotton_A_03228,Cotton_A_02974,Cotton_A_25714,Cotton_A_18979,Cotton_A_10036,Cotton_A_40258,Cotton_A_29782,Cotton_A_16716,Cotton_A_14349,Cotton_A_30618,Cotton_A_28255,Cotton_A_40284,Cotton_A_32515,Cotton_A_27412,Cotton_A_22494,Cotton_A_35500,Cotton_A_36081,Cotton_A_40065,Cotton_A_37936,Cotton_A_30291,Cotton_A_00084,Cotton_A_30252,Cotton_A_28586,Cotton_A_34833,Cotton_A_15923,Cotton_A_29859,Cotton_A_26403,Cotton_A_34751,Cotton_A_02250,Cotton_A_17919,Cotton_A_04714,Cotton_A_20799,Cotton_A_36585,Cotton_A_23954,Cotton_A_16097,Cotton_A_05974,Cotton_A_09314,Cotton_A_26564,Cotton_A_20685,Cotton_A_19678,Cotton_A_26951,Cotton_A_34230,Cotton_A_02168,Cotton_A_07428,Cotton_A_05377,Cotton_A_05190,Cotton_A_38955,Cotton_A_09604,Cotton_A_13861,Cotton_A_29706,Cotton_A_12423,Cotton_A_00761,Cotton_A_19400,Cotton_A_02631,Cotton_A_13879,Cotton_A_13880,Cotton_A_07899,Cotton_A_10807,Cotton_A_26868 HERPES_SIMPLEX_INFECTION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05168 Herpes_simplex_infection ko05168 Herpes_simplex_infection Cotton_A_10125,Cotton_A_36381,Cotton_A_37162,Cotton_A_31724,Cotton_A_01182,Cotton_A_01187,Cotton_A_25102,Cotton_A_17076 FLUOROBENZOATE_DEGRADATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00364 Fluorobenzoate_degradation ko00364 Fluorobenzoate_degradation Cotton_A_08303,Cotton_A_39507,Cotton_A_25843,Cotton_A_18810 PROTEIN_EXPORT KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03060 Protein_export ko03060 Protein_export Cotton_A_36365,Cotton_A_22620,Cotton_A_25537,Cotton_A_07484,Cotton_A_32334,Cotton_A_35952,Cotton_A_18543,Cotton_A_20902,Cotton_A_13251,Cotton_A_30118,Cotton_A_28971,Cotton_A_16889,Cotton_A_33824,Cotton_A_12393,Cotton_A_40757,Cotton_A_05933,Cotton_A_07704,Cotton_A_02614,Cotton_A_11957,Cotton_A_36588,Cotton_A_28612,Cotton_A_31529,Cotton_A_07497,Cotton_A_08041,Cotton_A_33774,Cotton_A_36783,Cotton_A_17780,Cotton_A_26560,Cotton_A_20683,Cotton_A_20194,Cotton_A_03325,Cotton_A_05273,Cotton_A_03643,Cotton_A_16453,Cotton_A_25758,Cotton_A_07252,Cotton_A_25393,Cotton_A_09743,Cotton_A_12863,Cotton_A_23037,Cotton_A_11164,Cotton_A_06916,Cotton_A_12801,Cotton_A_21960,Cotton_A_34232,Cotton_A_12360,Cotton_A_00311,Cotton_A_24909,Cotton_A_21029,Cotton_A_14140,Cotton_A_00969,Cotton_A_04275,Cotton_A_26128,Cotton_A_07053,Cotton_A_05331,Cotton_A_11790,Cotton_A_02337,Cotton_A_02340,Cotton_A_27390,Cotton_A_31846,Cotton_A_33806 LIPOPOLYSACCHARIDE_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00540 Lipopolysaccharide_biosynthesis ko00540 Lipopolysaccharide_biosynthesis Cotton_A_18063,Cotton_A_28792,Cotton_A_32816,Cotton_A_41015,Cotton_A_20386,Cotton_A_06715 CELL_CYCLE KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04110 Cell_cycle ko04110 Cell_cycle Cotton_A_09611,Cotton_A_38746,Cotton_A_39109,Cotton_A_21447,Cotton_A_32738,Cotton_A_04105,Cotton_A_09145,Cotton_A_26291,Cotton_A_23314,Cotton_A_18464,Cotton_A_16125,Cotton_A_25125,Cotton_A_21718,Cotton_A_27119,Cotton_A_06174,Cotton_A_32245,Cotton_A_33776,Cotton_A_05546,Cotton_A_39375,Cotton_A_20541,Cotton_A_33344,Cotton_A_20299,Cotton_A_15176,Cotton_A_29207,Cotton_A_11071,Cotton_A_08265,Cotton_A_25040,Cotton_A_14353,Cotton_A_40891,Cotton_A_05805,Cotton_A_06814,Cotton_A_37492,Cotton_A_24896,Cotton_A_25676 UBIQUITIN_MEDIATED_PROTEOLYSIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04120 Ubiquitin_mediated_proteolysis ko04120 Ubiquitin_mediated_proteolysis Cotton_A_35661,Cotton_A_19590,Cotton_A_12761,Cotton_A_20027,Cotton_A_18193,Cotton_A_11767,Cotton_A_30338,Cotton_A_36565,Cotton_A_05288,Cotton_A_02899,Cotton_A_19679,Cotton_A_20012,Cotton_A_23486,Cotton_A_32273,Cotton_A_13053,Cotton_A_08473,Cotton_A_12269,Cotton_A_02580,Cotton_A_02255,Cotton_A_02427,Cotton_A_02431,Cotton_A_02432,Cotton_A_39060,Cotton_A_37290,Cotton_A_16631,Cotton_A_14422,Cotton_A_30926,Cotton_A_10136,Cotton_A_09408,Cotton_A_22798,Cotton_A_03116,Cotton_A_03850,Cotton_A_12320,Cotton_A_29424,Cotton_A_33882,Cotton_A_04567,Cotton_A_27785,Cotton_A_01604,Cotton_A_34433,Cotton_A_04194,Cotton_A_04195,Cotton_A_24285,Cotton_A_02386,Cotton_A_08090,Cotton_A_22905,Cotton_A_12519,Cotton_A_15756,Cotton_A_04086,Cotton_A_41004,Cotton_A_22202,Cotton_A_22217,Cotton_A_28356,Cotton_A_08006,Cotton_A_23741,Cotton_A_20371,Cotton_A_21052,Cotton_A_29556,Cotton_A_04218,Cotton_A_37617,Cotton_A_35542,Cotton_A_20053,Cotton_A_06136,Cotton_A_27700,Cotton_A_13090,Cotton_A_28760,Cotton_A_30048,Cotton_A_11664,Cotton_A_24841,Cotton_A_02022,Cotton_A_28042,Cotton_A_35155,Cotton_A_23157,Cotton_A_28906,Cotton_A_10577,Cotton_A_35809,Cotton_A_17999,Cotton_A_08878,Cotton_A_17240,Cotton_A_00078,Cotton_A_06287,Cotton_A_03901,Cotton_A_14297,Cotton_A_00495,Cotton_A_09628,Cotton_A_21226,Cotton_A_32907,Cotton_A_00244,Cotton_A_02872,Cotton_A_15264,Cotton_A_04639,Cotton_A_24827,Cotton_A_06514,Cotton_A_16690,Cotton_A_19492,Cotton_A_09803,Cotton_A_16226,Cotton_A_08036,Cotton_A_00716,Cotton_A_27209,Cotton_A_12453,Cotton_A_07843,Cotton_A_01586,Cotton_A_32420,Cotton_A_28386,Cotton_A_31121 GLUTATHIONE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00480 Glutathione_metabolism ko00480 Glutathione_metabolism Cotton_A_31743,Cotton_A_26565,Cotton_A_31437,Cotton_A_02311,Cotton_A_02453,Cotton_A_02460,Cotton_A_02461,Cotton_A_02462,Cotton_A_34451,Cotton_A_35955,Cotton_A_00425,Cotton_A_24522,Cotton_A_24523,Cotton_A_24525,Cotton_A_24526,Cotton_A_24534,Cotton_A_05897,Cotton_A_12201,Cotton_A_37696,Cotton_A_03413,Cotton_A_03415,Cotton_A_03416,Cotton_A_12321,Cotton_A_23310,Cotton_A_36350,Cotton_A_14469,Cotton_A_27774,Cotton_A_34119,Cotton_A_00921,Cotton_A_16759,Cotton_A_21914,Cotton_A_21916,Cotton_A_21917,Cotton_A_35457,Cotton_A_29359,Cotton_A_29364,Cotton_A_12614,Cotton_A_22529,Cotton_A_25983,Cotton_A_34756,Cotton_A_25755,Cotton_A_07251,Cotton_A_09071,Cotton_A_11663,Cotton_A_08986,Cotton_A_08179,Cotton_A_36145 CYANOAMINO_ACID_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00460 Cyanoamino_acid_metabolism ko00460 Cyanoamino_acid_metabolism Cotton_A_09606,Cotton_A_15070 PEROXISOME KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04146 Peroxisome ko04146 Peroxisome Cotton_A_05851,Cotton_A_17692,Cotton_A_21978,Cotton_A_30467,Cotton_A_24238,Cotton_A_32487,Cotton_A_36793,Cotton_A_17860,Cotton_A_21932,Cotton_A_24138,Cotton_A_27622,Cotton_A_18405,Cotton_A_07134,Cotton_A_08596,Cotton_A_13932,Cotton_A_17535,Cotton_A_07424,Cotton_A_01487,Cotton_A_03745,Cotton_A_09285,Cotton_A_05640,Cotton_A_05200,Cotton_A_10637,Cotton_A_04669,Cotton_A_33772,Cotton_A_11163,Cotton_A_20964,Cotton_A_20966,Cotton_A_34637,Cotton_A_21827,Cotton_A_13664,Cotton_A_35819,Cotton_A_11912,Cotton_A_40199,Cotton_A_22984,Cotton_A_14142,Cotton_A_04032 RETINOL_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00830 Retinol_metabolism ko00830 Retinol_metabolism Cotton_A_08476,Cotton_A_08477,Cotton_A_04650,Cotton_A_25846,Cotton_A_10377,Cotton_A_39692 STEROID_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00100 Steroid_biosynthesis ko00100 Steroid_biosynthesis Cotton_A_04417,Cotton_A_31242,Cotton_A_37997,Cotton_A_16346,Cotton_A_10259,Cotton_A_00518,Cotton_A_00880,Cotton_A_04487,Cotton_A_37706,Cotton_A_16618,Cotton_A_27941,Cotton_A_07733,Cotton_A_07090,Cotton_A_20029,Cotton_A_27760,Cotton_A_09928,Cotton_A_25261,Cotton_A_00557,Cotton_A_29068,Cotton_A_27809,Cotton_A_09793,Cotton_A_12178,Cotton_A_27472,Cotton_A_17332,Cotton_A_20532,Cotton_A_00700,Cotton_A_00232,Cotton_A_27374,Cotton_A_31392,Cotton_A_41279,Cotton_A_12268,Cotton_A_20567,Cotton_A_15094,Cotton_A_26635,Cotton_A_19923,Cotton_A_12350,Cotton_A_12351 BUTANOATE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00650 Butanoate_metabolism ko00650 Butanoate_metabolism Cotton_A_06266,Cotton_A_12712,Cotton_A_14432,Cotton_A_28410,Cotton_A_09966,Cotton_A_12308,Cotton_A_03283,Cotton_A_13068,Cotton_A_35363,Cotton_A_34447,Cotton_A_01468,Cotton_A_20232,Cotton_A_23729,Cotton_A_14310 GLYCOLYSIS_/_GLUCONEOGENESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00010 Glycolysis_/_Gluconeogenesis ko00010 Glycolysis_/_Gluconeogenesis Cotton_A_18419,Cotton_A_07109,Cotton_A_16298,Cotton_A_32613,Cotton_A_01580,Cotton_A_28874,Cotton_A_25453,Cotton_A_01068,Cotton_A_16086,Cotton_A_01478,Cotton_A_23038,Cotton_A_26131,Cotton_A_11291,Cotton_A_22329,Cotton_A_22332,Cotton_A_27067,Cotton_A_27072,Cotton_A_29010,Cotton_A_09213,Cotton_A_39264,Cotton_A_26882,Cotton_A_08427,Cotton_A_14368,Cotton_A_14658,Cotton_A_23188,Cotton_A_06724,Cotton_A_37140,Cotton_A_08579,Cotton_A_37793,Cotton_A_11706,Cotton_A_01359 PHENYLPROPANOID_BIOSYNTHESIS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00940 Phenylpropanoid_biosynthesis ko00940 Phenylpropanoid_biosynthesis Cotton_A_16447,Cotton_A_25730,Cotton_A_21562,Cotton_A_33801,Cotton_A_10749,Cotton_A_34868,Cotton_A_17081,Cotton_A_11147,Cotton_A_10367,Cotton_A_15321,Cotton_A_20549,Cotton_A_14696,Cotton_A_24191,Cotton_A_02006,Cotton_A_33551,Cotton_A_17099,Cotton_A_24840,Cotton_A_08326,Cotton_A_01634,Cotton_A_29096,Cotton_A_40178 PURINE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00230 Purine_metabolism ko00230 Purine_metabolism Cotton_A_04770,Cotton_A_17399,Cotton_A_33819,Cotton_A_02570,Cotton_A_20252,Cotton_A_01828,Cotton_A_25723,Cotton_A_40803,Cotton_A_08304,Cotton_A_28613,Cotton_A_07496,Cotton_A_30312,Cotton_A_29069,Cotton_A_17680,Cotton_A_14846,Cotton_A_36171,Cotton_A_01211,Cotton_A_23496,Cotton_A_32047,Cotton_A_07116,Cotton_A_36831,Cotton_A_00687,Cotton_A_32365,Cotton_A_15308,Cotton_A_24053,Cotton_A_31962,Cotton_A_09688,Cotton_A_33315,Cotton_A_24906,Cotton_A_11594,Cotton_A_19918,Cotton_A_04019,Cotton_A_23827,Cotton_A_08057,Cotton_A_08157,Cotton_A_09676,Cotton_A_28074,Cotton_A_21201,Cotton_A_13246,Cotton_A_13247,Cotton_A_27705,Cotton_A_07330,Cotton_A_07813,Cotton_A_37903,Cotton_A_40960,Cotton_A_06636,Cotton_A_39645,Cotton_A_39646,Cotton_A_35630,Cotton_A_01524,Cotton_A_22158,Cotton_A_04983,Cotton_A_02208,Cotton_A_20250,Cotton_A_36085,Cotton_A_31860,Cotton_A_32503,Cotton_A_14348,Cotton_A_02039,Cotton_A_10086,Cotton_A_34677,Cotton_A_34678,Cotton_A_24350,Cotton_A_13896,Cotton_A_16923,Cotton_A_16932,Cotton_A_13877,Cotton_A_15567,Cotton_A_28978,Cotton_A_35563,Cotton_A_23206,Cotton_A_13257,Cotton_A_36407,Cotton_A_36808,Cotton_A_31795,Cotton_A_39972,Cotton_A_35267,Cotton_A_05229,Cotton_A_18917,Cotton_A_14137,Cotton_A_36266,Cotton_A_03890,Cotton_A_27254,Cotton_A_30176,Cotton_A_07177,Cotton_A_25505,Cotton_A_03477,Cotton_A_22337,Cotton_A_27656,Cotton_A_06150,Cotton_A_18128,Cotton_A_24223,Cotton_A_15066,Cotton_A_07761,Cotton_A_27465,Cotton_A_07346,Cotton_A_26855,Cotton_A_30551,Cotton_A_25219,Cotton_A_27578,Cotton_A_26452,Cotton_A_00500,Cotton_A_27015,Cotton_A_02048,Cotton_A_11649,Cotton_A_25969,Cotton_A_06842,Cotton_A_02882,Cotton_A_30103,Cotton_A_16457,Cotton_A_16388,Cotton_A_36432,Cotton_A_20554,Cotton_A_23509,Cotton_A_06372,Cotton_A_10757,Cotton_A_41199,Cotton_A_27470,Cotton_A_12435,Cotton_A_18272,Cotton_A_31034,Cotton_A_21412,Cotton_A_17798,Cotton_A_01879,Cotton_A_10343,Cotton_A_14515,Cotton_A_07542,Cotton_A_39832,Cotton_A_15886,Cotton_A_05271,Cotton_A_23807,Cotton_A_23054,Cotton_A_06501,Cotton_A_29021,Cotton_A_38859,Cotton_A_09327,Cotton_A_03590,Cotton_A_03161,Cotton_A_40467,Cotton_A_08764,Cotton_A_24066,Cotton_A_05973,Cotton_A_38878,Cotton_A_01446,Cotton_A_18239,Cotton_A_23112,Cotton_A_27656,Cotton_A_06150,Cotton_A_36808 HIPPO_SIGNALING_PATHWAY_-_FLY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04391 Hippo_signaling_pathway_-_fly ko04391 Hippo_signaling_pathway_-_fly Cotton_A_15375,Cotton_A_10389,Cotton_A_08009 PPAR_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03320 PPAR_signaling_pathway ko03320 PPAR_signaling_pathway Cotton_A_14288,Cotton_A_14289,Cotton_A_12089,Cotton_A_32873,Cotton_A_35787,Cotton_A_04736,Cotton_A_15147,Cotton_A_25689,Cotton_A_17909,Cotton_A_20821,Cotton_A_21379,Cotton_A_21380,Cotton_A_21382,Cotton_A_31062 ADHERENS_JUNCTION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04520 Adherens_junction ko04520 Adherens_junction Cotton_A_38162 OTHER_GLYCAN_DEGRADATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00511 Other_glycan_degradation ko00511 Other_glycan_degradation Cotton_A_20593,Cotton_A_33267,Cotton_A_01551,Cotton_A_30826,Cotton_A_05150,Cotton_A_01366,Cotton_A_10739,Cotton_A_10153,Cotton_A_24952,Cotton_A_15832,Cotton_A_13612 MISMATCH_REPAIR KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko03430 Mismatch_repair ko03430 Mismatch_repair Cotton_A_27623,Cotton_A_03977,Cotton_A_38482,Cotton_A_20455,Cotton_A_26367,Cotton_A_25844,Cotton_A_14610,Cotton_A_03891,Cotton_A_01316,Cotton_A_28658 GLYCINE,_SERINE_AND_THREONINE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00260 Glycine,_serine_and_threonine_metabolism ko00260 Glycine,_serine_and_threonine_metabolism Cotton_A_07549,Cotton_A_14434,Cotton_A_09969,Cotton_A_02713,Cotton_A_12433,Cotton_A_08321,Cotton_A_17168,Cotton_A_28476,Cotton_A_36568,Cotton_A_09918,Cotton_A_35615,Cotton_A_39012,Cotton_A_14467 BILE_SECRETION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04976 Bile_secretion ko04976 Bile_secretion Cotton_A_38407 GALACTOSE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00052 Galactose_metabolism ko00052 Galactose_metabolism Cotton_A_22062,Cotton_A_19231,Cotton_A_02717,Cotton_A_08440,Cotton_A_25695,Cotton_A_02157,Cotton_A_34266,Cotton_A_07440,Cotton_A_09624,Cotton_A_17791,Cotton_A_29756,Cotton_A_15038,Cotton_A_05172,Cotton_A_15043,Cotton_A_36753,Cotton_A_29833,Cotton_A_28231,Cotton_A_03874,Cotton_A_21259,Cotton_A_15619,Cotton_A_05440,Cotton_A_36875,Cotton_A_10174,Cotton_A_39532,Cotton_A_18925,Cotton_A_18926,Cotton_A_23891,Cotton_A_09030,Cotton_A_07120,Cotton_A_13591,Cotton_A_25653,Cotton_A_08156,Cotton_A_00498,Cotton_A_00499,Cotton_A_31498,Cotton_A_14451,Cotton_A_35037,Cotton_A_09990 FOCAL_ADHESION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04510 Focal_adhesion ko04510 Focal_adhesion Cotton_A_01715 ALPHA-LINOLENIC_ACID_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00592 alpha-Linolenic_acid_metabolism ko00592 alpha-Linolenic_acid_metabolism Cotton_A_09324,Cotton_A_25174,Cotton_A_17095,Cotton_A_23456,Cotton_A_07860,Cotton_A_37468,Cotton_A_28401,Cotton_A_12286,Cotton_A_40105,Cotton_A_06894,Cotton_A_16642,Cotton_A_02059,Cotton_A_02062,Cotton_A_35452,Cotton_A_12628,Cotton_A_12629,Cotton_A_12630,Cotton_A_12631,Cotton_A_37195,Cotton_A_06083 FATTY_ACID_ELONGATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00062 Fatty_acid_elongation ko00062 Fatty_acid_elongation Cotton_A_02087,Cotton_A_07553,Cotton_A_11120,Cotton_A_31611,Cotton_A_40578,Cotton_A_13763,Cotton_A_20428,Cotton_A_36064,Cotton_A_00737,Cotton_A_19287,Cotton_A_27018,Cotton_A_00219,Cotton_A_00221,Cotton_A_03189,Cotton_A_16465,Cotton_A_38995,Cotton_A_14494,Cotton_A_38264,Cotton_A_26434,Cotton_A_21460 NICOTINATE_AND_NICOTINAMIDE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00760 Nicotinate_and_nicotinamide_metabolism ko00760 Nicotinate_and_nicotinamide_metabolism Cotton_A_33093,Cotton_A_18609,Cotton_A_01805,Cotton_A_01060,Cotton_A_06794,Cotton_A_03078,Cotton_A_24349,Cotton_A_31084,Cotton_A_33807 CHAGAS_DISEASE_(AMERICAN_TRYPANOSOMIASIS) KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko05142 Chagas_disease_(American_trypanosomiasis) ko05142 Chagas_disease_(American_trypanosomiasis) Cotton_A_29827 ASCORBATE_AND_ALDARATE_METABOLISM KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00053 Ascorbate_and_aldarate_metabolism ko00053 Ascorbate_and_aldarate_metabolism Cotton_A_02072,Cotton_A_14327,Cotton_A_13437,Cotton_A_00532,Cotton_A_17946,Cotton_A_32716,Cotton_A_10193,Cotton_A_16171,Cotton_A_36377,Cotton_A_27307,Cotton_A_02502,Cotton_A_02504,Cotton_A_02505,Cotton_A_02506,Cotton_A_02507,Cotton_A_02508,Cotton_A_05112,Cotton_A_02819,Cotton_A_10528,Cotton_A_34995,Cotton_A_00641,Cotton_A_01547,Cotton_A_07027,Cotton_A_16087,Cotton_A_05101,Cotton_A_05102,Cotton_A_05103,Cotton_A_02871,Cotton_A_18083,Cotton_A_17496,Cotton_A_07911,Cotton_A_04822,Cotton_A_15544,Cotton_A_12143,Cotton_A_15046,Cotton_A_08491,Cotton_A_04637,Cotton_A_35427,Cotton_A_16873 CHLOROCYCLOHEXANE_AND_CHLOROBENZENE_DEGRADATION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00361 Chlorocyclohexane_and_chlorobenzene_degradation ko00361 Chlorocyclohexane_and_chlorobenzene_degradation Cotton_A_39117,Cotton_A_35326 GLYCOSAMINOGLYCAN_BIOSYNTHESIS_-_CHONDROITIN_SULFATE_/_DERMATAN_SULFATE KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00532 Glycosaminoglycan_biosynthesis_-_chondroitin_sulfate_/_dermatan_sulfate ko00532 Glycosaminoglycan_biosynthesis_-_chondroitin_sulfate_/_dermatan_sulfate Cotton_A_05548,Cotton_A_28890,Cotton_A_10252 REGULATION_OF_ACTIN_CYTOSKELETON KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04810 Regulation_of_actin_cytoskeleton ko04810 Regulation_of_actin_cytoskeleton Cotton_A_07329,Cotton_A_08182,Cotton_A_10623,Cotton_A_29588,Cotton_A_38553,Cotton_A_10543,Cotton_A_37119,Cotton_A_00400,Cotton_A_00401,Cotton_A_31273,Cotton_A_31276,Cotton_A_00644,Cotton_A_01701,Cotton_A_21469,Cotton_A_37544,Cotton_A_00933,Cotton_A_03023,Cotton_A_01305,Cotton_A_01306,Cotton_A_15274,Cotton_A_27283,Cotton_A_02524,Cotton_A_06722,Cotton_A_36915,Cotton_A_06669,Cotton_A_06353,Cotton_A_27098,Cotton_A_38348,Cotton_A_33483,Cotton_A_33484,Cotton_A_10643,Cotton_A_30192 TIGHT_JUNCTION KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04530 Tight_junction ko04530 Tight_junction Cotton_A_38087,Cotton_A_20354,Cotton_A_20355 NF-KAPPA_B_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04064 NF-kappa_B_signaling_pathway ko04064 NF-kappa_B_signaling_pathway Cotton_A_13079,Cotton_A_01746,Cotton_A_12044,Cotton_A_27605,Cotton_A_33447,Cotton_A_10530,Cotton_A_10555,Cotton_A_25507,Cotton_A_08762,Cotton_A_01529,Cotton_A_07230,Cotton_A_19639,Cotton_A_27951,Cotton_A_27952,Cotton_A_15945,Cotton_A_22161,Cotton_A_28039,Cotton_A_38360,Cotton_A_12654,Cotton_A_30745,Cotton_A_22392,Cotton_A_23361,Cotton_A_37512,Cotton_A_38689,Cotton_A_02645,Cotton_A_06973,Cotton_A_11020,Cotton_A_24036,Cotton_A_28911,Cotton_A_34291,Cotton_A_26634,Cotton_A_40117,Cotton_A_40185,Cotton_A_02955,Cotton_A_08521,Cotton_A_23411,Cotton_A_06139,Cotton_A_10817 GLYCOSPHINGOLIPID_BIOSYNTHESIS_-_GLOBO_SERIES KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko00603 Glycosphingolipid_biosynthesis_-_globo_series ko00603 Glycosphingolipid_biosynthesis_-_globo_series Cotton_A_02490,Cotton_A_28927,Cotton_A_03510,Cotton_A_03511 DEGRADATION_OF_AROMATIC_COMPOUNDS KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko01220 Degradation_of_aromatic_compounds ko01220 Degradation_of_aromatic_compounds Cotton_A_19615,Cotton_A_19620,Cotton_A_34952,Cotton_A_09516,Cotton_A_09517,Cotton_A_05783,Cotton_A_08904,Cotton_A_22660,Cotton_A_10474,Cotton_A_21256 FOXO_SIGNALING_PATHWAY KEGG Gossypium arboreum NA Symbol Marcela K Monaco et al. Cold Spring Harbor Laboratory NA ko04068 FoxO_signaling_pathway ko04068 FoxO_signaling_pathway Cotton_A_03623,Cotton_A_04050,Cotton_A_21263,Cotton_A_11114,Cotton_A_09375,Cotton_A_18067,Cotton_A_19135,Cotton_A_27995,Cotton_A_16517,Cotton_A_22074,Cotton_A_15585,Cotton_A_39763,Cotton_A_40954,Cotton_A_04333,Cotton_A_05944,Cotton_A_30062,Cotton_A_05019,Cotton_A_04065,Cotton_A_17083,Cotton_A_37254,Cotton_A_13775,Cotton_A_28167,Cotton_A_20508,Cotton_A_38612,Cotton_A_02259,Cotton_A_11072,Cotton_A_24717,Cotton_A_04247,Cotton_A_04917,Cotton_A_07046,Cotton_A_05116,Cotton_A_01767,Cotton_A_28828,Cotton_A_31574,Cotton_A_01496,Cotton_A_14306,Cotton_A_17321,Cotton_A_39389,Cotton_A_16604,Cotton_A_17601,Cotton_A_23234,Cotton_A_32839,Cotton_A_35689,Cotton_A_24409,Cotton_A_25628,Cotton_A_06230